More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_07731 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_07201  peptide chain release factor 3  82.8 
 
 		 555 aa  933    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.577625  normal  0.0107792 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07181  peptide chain release factor 3  75.84 
 
 		 545 aa  848    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.55147  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0095  peptide chain release factor 3  82.8 
 
 		 555 aa  933    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1843  peptide chain release factor 3  68.48 
 
 		 540 aa  790    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1056  peptide chain release factor 3  68.04 
 
 		 542 aa  768    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3298  peptide chain release factor 3  68.18 
 
 		 540 aa  760    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1198  peptide chain release factor 3  80.11 
 
 		 548 aa  888    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1279  peptide chain release factor 3  81.8 
 
 		 548 aa  933    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07161  peptide chain release factor 3  76.4 
 
 		 545 aa  850    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.651427  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0663  peptide chain release factor 3  75.84 
 
 		 545 aa  842    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.635496  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2365  peptide chain release factor 3  71.78 
 
 		 556 aa  808    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.100255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07361  peptide chain release factor 3  73.48 
 
 		 545 aa  850    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.301095  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4549  peptide chain release factor 3  68.56 
 
 		 563 aa  762    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2904  peptide chain release factor 3  68.97 
 
 		 542 aa  790    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835611  normal  0.0349958 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07731  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 555 aa  1145    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107568 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2024  peptide chain release factor 3  69.3 
 
 		 539 aa  778    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1999  peptide chain release factor 3  69.3 
 
 		 539 aa  778    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14191  peptide chain release factor 3  79.42 
 
 		 571 aa  896    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27956  predicted protein  53.99 
 
 		 634 aa  587  1e-166  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0592  peptide chain release factor 3  50.29 
 
 		 531 aa  550  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0581  peptide chain release factor 3  50.29 
 
 		 531 aa  550  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0116263  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3596  peptide chain release factor 3  50.48 
 
 		 529 aa  537  1e-151  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.750333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1434  peptide chain release factor 3  50.38 
 
 		 539 aa  534  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0780  peptide chain release factor 3  52.25 
 
 		 543 aa  532  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.474397  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3254  peptide chain release factor 3  52.12 
 
 		 529 aa  533  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000111312  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0328  peptide chain release factor 3  50.77 
 
 		 533 aa  530  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0398  peptide chain release factor 3  51.46 
 
 		 532 aa  525  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1704  peptide chain release factor 3  50.38 
 
 		 542 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2112  peptide chain release factor 3  48.87 
 
 		 541 aa  518  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1764  peptide chain release factor 3  49.06 
 
 		 541 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1844  peptide chain release factor 3  49.06 
 
 		 541 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2700  peptide chain release factor 3  47.28 
 
 		 583 aa  505  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1492  peptide chain release factor 3  49.62 
 
 		 567 aa  498  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1351  peptide chain release factor 3  48.02 
 
 		 525 aa  492  9.999999999999999e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000276996  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0882  peptide chain release factor 3  48.15 
 
 		 527 aa  486  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0935  peptide chain release factor 3  51.06 
 
 		 526 aa  482  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  48.75 
 
 		 524 aa  484  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  52.19 
 
 		 542 aa  484  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2819  peptide chain release factor 3  47.98 
 
 		 528 aa  485  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  47.62 
 
 		 528 aa  483  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1678  peptide chain release factor 3  47.78 
 
 		 533 aa  483  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0068133  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1592  peptide chain release factor 3  46.77 
 
 		 527 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1018  peptide chain release factor 3  47.44 
 
 		 520 aa  481  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0165348  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1037  peptide chain release factor 3  47.44 
 
 		 520 aa  481  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00273811  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01678  peptide chain release factor 3  50.11 
 
 		 534 aa  479  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790822  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1267  peptide chain release factor 3  47.09 
 
 		 504 aa  479  1e-134  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.551841  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0138  peptide chain release factor 3  46.63 
 
 		 526 aa  475  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  48.27 
 
 		 530 aa  477  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3053  peptide chain release factor 3  47.43 
 
 		 534 aa  478  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0905  peptide chain release factor 3  50.85 
 
 		 526 aa  477  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  52.69 
 
 		 531 aa  478  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0359  peptide chain release factor 3  47.9 
 
 		 542 aa  478  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3935  peptide chain release factor 3  46.8 
 
 		 526 aa  478  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0414  peptide chain release factor 3  47.53 
 
 		 531 aa  478  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4019  peptide chain release factor 3  46.8 
 
 		 526 aa  477  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5160199999999995e-20 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0395  peptide chain release factor 3  47.32 
 
 		 523 aa  477  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.118943  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0609  peptide chain release factor 3  46.21 
 
 		 520 aa  474  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00905219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0192  peptide chain release factor 3  47.1 
 
 		 527 aa  474  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0147  peptide chain release factor 3  50.96 
 
 		 535 aa  472  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0130  peptide chain release factor 3  51.28 
 
 		 534 aa  474  1e-132  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.174893  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1490  peptide chain release factor 3  46.67 
 
 		 535 aa  474  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000251643  hitchhiker  0.00000000120572 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0147  peptide chain release factor 3  51.28 
 
 		 534 aa  475  1e-132  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2046  peptide chain release factor 3  47 
 
 		 531 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.840556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4881  peptide chain release factor 3  47.1 
 
 		 529 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180345  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4968  peptide chain release factor 3  47.1 
 
 		 529 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  47.98 
 
 		 528 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4974  peptide chain release factor 3  47.1 
 
 		 529 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.219451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4813  peptide chain release factor 3  47.1 
 
 		 529 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  47.78 
 
 		 524 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1828  peptide chain release factor 3  48.49 
 
 		 544 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0613  peptide chain release factor 3  46.78 
 
 		 526 aa  468  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0551  peptide chain release factor 3  46.54 
 
 		 529 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1365  peptide chain release factor 3  48.67 
 
 		 522 aa  470  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000156295  hitchhiker  0.000000502816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2092  peptide chain release factor 3  46.9 
 
 		 528 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4916  peptide chain release factor 3  47.1 
 
 		 529 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.996004  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04250  peptide chain release factor 3  46.72 
 
 		 529 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.631503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3624  peptide chain release factor 3  46.72 
 
 		 529 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4971  peptide chain release factor 3  46.72 
 
 		 529 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00185733  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0205  peptide chain release factor 3  44.77 
 
 		 526 aa  466  9.999999999999999e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4918  peptide chain release factor 3  46.72 
 
 		 529 aa  468  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100391  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0380  peptide chain release factor 3  48.45 
 
 		 531 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.864644 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1279  peptide chain release factor 3  44.3 
 
 		 529 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4411  peptide chain release factor 3  46.17 
 
 		 541 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5887  peptide chain release factor 3  46.72 
 
 		 529 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.397514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0534  peptide chain release factor 3  47.1 
 
 		 529 aa  467  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.319663  hitchhiker  0.0098421 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0453  peptide chain release factor 3  49.68 
 
 		 529 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.267512  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3682  peptide chain release factor 3  46.72 
 
 		 529 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.297475  hitchhiker  0.00075439 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04216  hypothetical protein  46.72 
 
 		 529 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.659942  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4922  peptide chain release factor 3  46.72 
 
 		 529 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.55632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4609  peptide chain release factor 3  46.72 
 
 		 529 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00121865  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0422  peptide chain release factor 3  48.87 
 
 		 531 aa  468  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2646  peptide chain release factor 3  47.01 
 
 		 535 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3466  peptide chain release factor 3  47.39 
 
 		 529 aa  467  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1532  peptide chain release factor 3  47.9 
 
 		 514 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0652  peptide chain release factor 3  47.2 
 
 		 529 aa  468  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1011  peptide chain release factor 3  49.58 
 
 		 528 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0772  peptide chain release factor 3  48.09 
 
 		 514 aa  464  1e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00659018  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2497  peptide chain release factor 3  45.86 
 
 		 530 aa  465  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0968  peptide chain release factor 3  47.22 
 
 		 528 aa  462  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.463155  decreased coverage  0.000218803 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3586  peptide chain release factor 3  47 
 
 		 529 aa  463  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>