More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0328 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0328  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 533 aa  1106    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3596  peptide chain release factor 3  61.27 
 
 		 529 aa  670    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.750333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1434  peptide chain release factor 3  80.83 
 
 		 539 aa  909    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157478  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3254  peptide chain release factor 3  58.49 
 
 		 529 aa  635    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000111312  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0592  peptide chain release factor 3  66.79 
 
 		 531 aa  746    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0581  peptide chain release factor 3  66.79 
 
 		 531 aa  746    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0116263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0398  peptide chain release factor 3  62.3 
 
 		 532 aa  658    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0780  peptide chain release factor 3  61.01 
 
 		 543 aa  643    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.474397  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1704  peptide chain release factor 3  53.18 
 
 		 542 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2904  peptide chain release factor 3  53.98 
 
 		 542 aa  582  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835611  normal  0.0349958 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2112  peptide chain release factor 3  51.69 
 
 		 541 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1844  peptide chain release factor 3  51.69 
 
 		 541 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1764  peptide chain release factor 3  51.69 
 
 		 541 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1056  peptide chain release factor 3  53.03 
 
 		 542 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448459 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2024  peptide chain release factor 3  54.15 
 
 		 539 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3298  peptide chain release factor 3  53.22 
 
 		 540 aa  565  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1999  peptide chain release factor 3  53.96 
 
 		 539 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1843  peptide chain release factor 3  53.22 
 
 		 540 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1279  peptide chain release factor 3  52.29 
 
 		 548 aa  558  1e-158  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2365  peptide chain release factor 3  51.89 
 
 		 556 aa  560  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.100255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07181  peptide chain release factor 3  53.08 
 
 		 545 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.55147  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07161  peptide chain release factor 3  52.88 
 
 		 545 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.651427  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07361  peptide chain release factor 3  51.92 
 
 		 545 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.301095  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4549  peptide chain release factor 3  52.88 
 
 		 563 aa  548  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0663  peptide chain release factor 3  52.31 
 
 		 545 aa  548  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.635496  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0095  peptide chain release factor 3  51.34 
 
 		 555 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07201  peptide chain release factor 3  51.34 
 
 		 555 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.577625  normal  0.0107792 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1198  peptide chain release factor 3  51.89 
 
 		 548 aa  544  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1037  peptide chain release factor 3  52.31 
 
 		 520 aa  538  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00273811  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1018  peptide chain release factor 3  52.31 
 
 		 520 aa  538  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0165348  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0609  peptide chain release factor 3  51.54 
 
 		 520 aa  534  1e-150  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00905219  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1351  peptide chain release factor 3  50.76 
 
 		 525 aa  533  1e-150  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000276996  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1365  peptide chain release factor 3  51.24 
 
 		 522 aa  530  1e-149  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000156295  hitchhiker  0.000000502816 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07731  peptide chain release factor 3  50.77 
 
 		 555 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107568 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0395  peptide chain release factor 3  50.58 
 
 		 523 aa  522  1e-147  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.118943  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14191  peptide chain release factor 3  50.57 
 
 		 571 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0772  peptide chain release factor 3  52.12 
 
 		 514 aa  520  1e-146  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00659018  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  49.62 
 
 		 524 aa  519  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1532  peptide chain release factor 3  51.82 
 
 		 514 aa  520  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  49.43 
 
 		 528 aa  521  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0414  peptide chain release factor 3  51.05 
 
 		 531 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  52.95 
 
 		 542 aa  513  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0140  peptide chain release factor 3  50.19 
 
 		 503 aa  514  1e-144  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1990  peptide chain release factor 3  48.97 
 
 		 526 aa  510  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3808  peptide chain release factor 3  49.33 
 
 		 538 aa  509  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1492  peptide chain release factor 3  48.96 
 
 		 567 aa  508  1e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5334  peptide chain release factor 3  49.24 
 
 		 533 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490929  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0192  peptide chain release factor 3  54.56 
 
 		 527 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3219  peptide chain release factor 3  48.87 
 
 		 538 aa  507  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.76683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3649  peptide chain release factor 3  49.81 
 
 		 528 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1393  peptide chain release factor 3  51.79 
 
 		 524 aa  506  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263078  normal  0.346403 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3053  peptide chain release factor 3  47.99 
 
 		 534 aa  506  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1662  peptide chain release factor 3  48.86 
 
 		 533 aa  504  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.828617  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0935  peptide chain release factor 3  48.84 
 
 		 526 aa  502  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0905  peptide chain release factor 3  48.45 
 
 		 526 aa  502  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  50.1 
 
 		 528 aa  503  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0147  peptide chain release factor 3  51.06 
 
 		 535 aa  503  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1118  peptide chain release factor 3  48.57 
 
 		 531 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950984  normal  0.664681 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5808  peptide chain release factor 3  48.95 
 
 		 530 aa  504  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3761  peptide chain release factor 3  48.2 
 
 		 531 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.106529 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3872  peptide chain release factor 3  48.2 
 
 		 531 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0435  peptide chain release factor 3  49.71 
 
 		 531 aa  502  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0138  peptide chain release factor 3  53.5 
 
 		 526 aa  500  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  49.71 
 
 		 524 aa  499  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01678  peptide chain release factor 3  51.9 
 
 		 534 aa  500  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790822  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0266  peptide chain release factor 3  47.91 
 
 		 529 aa  501  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.580519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0147  peptide chain release factor 3  48.56 
 
 		 534 aa  500  1e-140  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2514  peptide chain release factor 3  52.49 
 
 		 539 aa  500  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0130  peptide chain release factor 3  48.56 
 
 		 534 aa  498  1e-140  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.174893  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2144  peptide chain release factor 3  52.49 
 
 		 539 aa  500  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.280372  hitchhiker  0.00257154 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1267  peptide chain release factor 3  49.42 
 
 		 504 aa  500  1e-140  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.551841  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5122  peptide chain release factor 3  49.61 
 
 		 531 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.535643  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  48.38 
 
 		 531 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3858  peptide chain release factor 3  47.65 
 
 		 547 aa  496  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  48.37 
 
 		 530 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2968  peptide chain release factor 3  48.47 
 
 		 533 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.720802 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3935  peptide chain release factor 3  50 
 
 		 526 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4019  peptide chain release factor 3  53.29 
 
 		 526 aa  496  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5160199999999995e-20 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0882  peptide chain release factor 3  51.67 
 
 		 527 aa  496  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2372  peptide chain release factor 3  49.61 
 
 		 529 aa  498  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4287  peptide chain release factor 3  47.53 
 
 		 533 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6925  peptide chain release factor 3  48.28 
 
 		 533 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.209121  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1821  peptide chain release factor 3  52.07 
 
 		 536 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1279  peptide chain release factor 3  48.65 
 
 		 529 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2700  peptide chain release factor 3  44.33 
 
 		 583 aa  493  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0205  peptide chain release factor 3  49.61 
 
 		 526 aa  490  1e-137  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3370  peptide chain release factor 3  47.46 
 
 		 528 aa  491  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0764098  normal  0.150996 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1140  peptide chain release factor 3  52.03 
 
 		 525 aa  491  1e-137  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2330  peptide chain release factor 3  49.6 
 
 		 535 aa  490  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0877  peptide chain release factor 3  52.03 
 
 		 525 aa  491  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3382  peptide chain release factor 3  51.88 
 
 		 526 aa  490  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00211559  hitchhiker  0.00272137 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2819  peptide chain release factor 3  49.23 
 
 		 528 aa  491  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4412  peptide chain release factor 3  48.93 
 
 		 527 aa  490  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000888652  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0792  peptide chain release factor 3  51.37 
 
 		 527 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2820  peptide chain release factor 3  50.94 
 
 		 526 aa  489  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0200081  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3053  peptide chain release factor 3  51.16 
 
 		 526 aa  486  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00432214  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4579  peptide chain release factor 3  51.16 
 
 		 527 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0807  peptide chain release factor 3  51.16 
 
 		 527 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.986611  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2497  peptide chain release factor 3  48.84 
 
 		 530 aa  487  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0791  peptide chain release factor 3  47.89 
 
 		 530 aa  486  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>