More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1279 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2024  peptide chain release factor 3  71.54 
 
 		 539 aa  804    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07201  peptide chain release factor 3  83.27 
 
 		 555 aa  941    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.577625  normal  0.0107792 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0095  peptide chain release factor 3  83.27 
 
 		 555 aa  941    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3298  peptide chain release factor 3  70.4 
 
 		 540 aa  780    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1198  peptide chain release factor 3  90.33 
 
 		 548 aa  1001    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1279  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 548 aa  1124    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07181  peptide chain release factor 3  78.61 
 
 		 545 aa  874    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.55147  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0663  peptide chain release factor 3  78.05 
 
 		 545 aa  863    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.635496  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2365  peptide chain release factor 3  74.77 
 
 		 556 aa  838    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.100255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1843  peptide chain release factor 3  72.69 
 
 		 540 aa  826    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07731  peptide chain release factor 3  81.8 
 
 		 555 aa  933    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107568 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1056  peptide chain release factor 3  70.32 
 
 		 542 aa  796    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2904  peptide chain release factor 3  71.54 
 
 		 542 aa  820    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835611  normal  0.0349958 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1999  peptide chain release factor 3  71.54 
 
 		 539 aa  805    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4549  peptide chain release factor 3  69.74 
 
 		 563 aa  778    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07361  peptide chain release factor 3  75.23 
 
 		 545 aa  877    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.301095  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07161  peptide chain release factor 3  78.61 
 
 		 545 aa  873    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.651427  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14191  peptide chain release factor 3  86.65 
 
 		 571 aa  949    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27956  predicted protein  53.74 
 
 		 634 aa  595  1e-169  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1434  peptide chain release factor 3  51.8 
 
 		 539 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0592  peptide chain release factor 3  51.53 
 
 		 531 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0581  peptide chain release factor 3  51.53 
 
 		 531 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0116263  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0328  peptide chain release factor 3  52.29 
 
 		 533 aa  558  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3596  peptide chain release factor 3  51.54 
 
 		 529 aa  560  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.750333  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0398  peptide chain release factor 3  53.22 
 
 		 532 aa  544  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0780  peptide chain release factor 3  52.91 
 
 		 543 aa  539  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.474397  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1704  peptide chain release factor 3  52.47 
 
 		 542 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3254  peptide chain release factor 3  50.97 
 
 		 529 aa  535  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000111312  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2700  peptide chain release factor 3  49.65 
 
 		 583 aa  533  1e-150  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1844  peptide chain release factor 3  50.57 
 
 		 541 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1764  peptide chain release factor 3  50.57 
 
 		 541 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2112  peptide chain release factor 3  50.19 
 
 		 541 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1351  peptide chain release factor 3  50.57 
 
 		 525 aa  515  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000276996  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1492  peptide chain release factor 3  51.45 
 
 		 567 aa  514  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  49.71 
 
 		 524 aa  498  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1018  peptide chain release factor 3  49.05 
 
 		 520 aa  495  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0165348  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1037  peptide chain release factor 3  49.05 
 
 		 520 aa  495  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00273811  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0882  peptide chain release factor 3  48.17 
 
 		 527 aa  497  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0609  peptide chain release factor 3  48.1 
 
 		 520 aa  494  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00905219  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1490  peptide chain release factor 3  48.03 
 
 		 535 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000251643  hitchhiker  0.00000000120572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  48.94 
 
 		 524 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  49.9 
 
 		 528 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2819  peptide chain release factor 3  48.47 
 
 		 528 aa  490  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0935  peptide chain release factor 3  47.69 
 
 		 526 aa  489  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0138  peptide chain release factor 3  47.12 
 
 		 526 aa  487  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0192  peptide chain release factor 3  46.92 
 
 		 527 aa  485  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0414  peptide chain release factor 3  48.65 
 
 		 531 aa  486  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  52.65 
 
 		 531 aa  482  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0905  peptide chain release factor 3  47.12 
 
 		 526 aa  483  1e-135  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0395  peptide chain release factor 3  48.18 
 
 		 523 aa  483  1e-135  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.118943  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1678  peptide chain release factor 3  47.78 
 
 		 533 aa  484  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0068133  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1592  peptide chain release factor 3  48.26 
 
 		 527 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0147  peptide chain release factor 3  48.58 
 
 		 534 aa  480  1e-134  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5127  peptide chain release factor 3  46.53 
 
 		 521 aa  480  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.166056  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0772  peptide chain release factor 3  48 
 
 		 514 aa  478  1e-134  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00659018  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  51.61 
 
 		 530 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4411  peptide chain release factor 3  48.44 
 
 		 541 aa  479  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  48.02 
 
 		 542 aa  480  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  49.23 
 
 		 528 aa  479  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01678  peptide chain release factor 3  48.45 
 
 		 534 aa  481  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790822  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3053  peptide chain release factor 3  47.23 
 
 		 534 aa  481  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0130  peptide chain release factor 3  48.49 
 
 		 534 aa  479  1e-134  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.174893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3935  peptide chain release factor 3  48.65 
 
 		 526 aa  481  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4019  peptide chain release factor 3  48.46 
 
 		 526 aa  480  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5160199999999995e-20 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1365  peptide chain release factor 3  48.11 
 
 		 522 aa  478  1e-134  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000156295  hitchhiker  0.000000502816 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0140  peptide chain release factor 3  47.76 
 
 		 503 aa  481  1e-134  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1279  peptide chain release factor 3  45.42 
 
 		 529 aa  477  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2144  peptide chain release factor 3  47.98 
 
 		 539 aa  476  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.280372  hitchhiker  0.00257154 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1579  peptide chain release factor 3  45.33 
 
 		 529 aa  476  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1828  peptide chain release factor 3  45.32 
 
 		 544 aa  476  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2514  peptide chain release factor 3  47.98 
 
 		 539 aa  476  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1267  peptide chain release factor 3  46.12 
 
 		 504 aa  475  1e-133  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.551841  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1532  peptide chain release factor 3  48.36 
 
 		 514 aa  475  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3219  peptide chain release factor 3  47.04 
 
 		 538 aa  472  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.76683  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1662  peptide chain release factor 3  47.18 
 
 		 533 aa  473  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.828617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4412  peptide chain release factor 3  47.89 
 
 		 527 aa  475  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000888652  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0534  peptide chain release factor 3  47.39 
 
 		 529 aa  472  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.319663  hitchhiker  0.0098421 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0791  peptide chain release factor 3  44.85 
 
 		 530 aa  473  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3466  peptide chain release factor 3  47.69 
 
 		 529 aa  473  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0970  peptide chain release factor 3  47.49 
 
 		 524 aa  473  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00550606  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3212  peptide chain release factor 3  46.31 
 
 		 538 aa  472  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714231  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0652  peptide chain release factor 3  48.17 
 
 		 529 aa  472  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2046  peptide chain release factor 3  46.76 
 
 		 531 aa  473  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.840556  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0205  peptide chain release factor 3  45.05 
 
 		 526 aa  469  1.0000000000000001e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1990  peptide chain release factor 3  48.27 
 
 		 526 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0806  peptide chain release factor 3  46.14 
 
 		 528 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0794725  hitchhiker  0.00323143 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2820  peptide chain release factor 3  47.49 
 
 		 526 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0200081  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0453  peptide chain release factor 3  47.68 
 
 		 529 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.267512  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4974  peptide chain release factor 3  47.2 
 
 		 529 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.219451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0359  peptide chain release factor 3  47.51 
 
 		 542 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5334  peptide chain release factor 3  46.73 
 
 		 533 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490929  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3808  peptide chain release factor 3  46.76 
 
 		 538 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3761  peptide chain release factor 3  46.34 
 
 		 531 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.106529 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5808  peptide chain release factor 3  47.18 
 
 		 530 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4916  peptide chain release factor 3  47.2 
 
 		 529 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.996004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3858  peptide chain release factor 3  47.89 
 
 		 547 aa  470  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4968  peptide chain release factor 3  47.2 
 
 		 529 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4813  peptide chain release factor 3  47.2 
 
 		 529 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0551  peptide chain release factor 3  46.93 
 
 		 529 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2092  peptide chain release factor 3  47.68 
 
 		 528 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>