More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0398 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0328  peptide chain release factor 3  62.3 
 
 		 533 aa  676    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1434  peptide chain release factor 3  60.5 
 
 		 539 aa  674    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157478  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3254  peptide chain release factor 3  58.8 
 
 		 529 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000111312  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0398  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 532 aa  1101    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0592  peptide chain release factor 3  60.43 
 
 		 531 aa  640    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0581  peptide chain release factor 3  60.43 
 
 		 531 aa  640    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0116263  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0780  peptide chain release factor 3  59.61 
 
 		 543 aa  632  1e-180  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.474397  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3596  peptide chain release factor 3  56.45 
 
 		 529 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.750333  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1704  peptide chain release factor 3  54.08 
 
 		 542 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2904  peptide chain release factor 3  51.42 
 
 		 542 aa  579  1e-164  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835611  normal  0.0349958 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2024  peptide chain release factor 3  53.33 
 
 		 539 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1843  peptide chain release factor 3  52.47 
 
 		 540 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1999  peptide chain release factor 3  53.53 
 
 		 539 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3298  peptide chain release factor 3  53.73 
 
 		 540 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1056  peptide chain release factor 3  53.06 
 
 		 542 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448459 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1844  peptide chain release factor 3  51.61 
 
 		 541 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1764  peptide chain release factor 3  51.8 
 
 		 541 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4549  peptide chain release factor 3  53.03 
 
 		 563 aa  563  1.0000000000000001e-159  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2365  peptide chain release factor 3  51.91 
 
 		 556 aa  563  1.0000000000000001e-159  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.100255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2112  peptide chain release factor 3  51.61 
 
 		 541 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1279  peptide chain release factor 3  53.22 
 
 		 548 aa  555  1e-157  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0095  peptide chain release factor 3  52.8 
 
 		 555 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07201  peptide chain release factor 3  52.8 
 
 		 555 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.577625  normal  0.0107792 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07361  peptide chain release factor 3  53.17 
 
 		 545 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.301095  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07161  peptide chain release factor 3  52.47 
 
 		 545 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.651427  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07181  peptide chain release factor 3  52.59 
 
 		 545 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.55147  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0414  peptide chain release factor 3  51.53 
 
 		 531 aa  541  1e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0663  peptide chain release factor 3  53.83 
 
 		 545 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.635496  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0609  peptide chain release factor 3  50.67 
 
 		 520 aa  535  1e-151  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00905219  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07731  peptide chain release factor 3  51.46 
 
 		 555 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107568 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1198  peptide chain release factor 3  53.91 
 
 		 548 aa  534  1e-150  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1037  peptide chain release factor 3  50.67 
 
 		 520 aa  534  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00273811  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1018  peptide chain release factor 3  50.67 
 
 		 520 aa  534  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0165348  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  51.14 
 
 		 524 aa  534  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  52.93 
 
 		 528 aa  534  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0882  peptide chain release factor 3  51.25 
 
 		 527 aa  532  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4019  peptide chain release factor 3  51.64 
 
 		 526 aa  529  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5160199999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  50.76 
 
 		 542 aa  531  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3935  peptide chain release factor 3  51.83 
 
 		 526 aa  531  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1990  peptide chain release factor 3  50.57 
 
 		 526 aa  526  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14191  peptide chain release factor 3  52.71 
 
 		 571 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  50.85 
 
 		 528 aa  526  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1821  peptide chain release factor 3  54.64 
 
 		 536 aa  528  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4412  peptide chain release factor 3  51.45 
 
 		 527 aa  528  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000888652  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1365  peptide chain release factor 3  50.48 
 
 		 522 aa  525  1e-148  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000156295  hitchhiker  0.000000502816 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0935  peptide chain release factor 3  52.64 
 
 		 526 aa  522  1e-147  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0905  peptide chain release factor 3  53.07 
 
 		 526 aa  524  1e-147  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  52 
 
 		 524 aa  525  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1351  peptide chain release factor 3  50.58 
 
 		 525 aa  524  1e-147  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000276996  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1393  peptide chain release factor 3  54.7 
 
 		 524 aa  522  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263078  normal  0.346403 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0395  peptide chain release factor 3  50.38 
 
 		 523 aa  523  1e-147  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.118943  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0772  peptide chain release factor 3  52.87 
 
 		 514 aa  520  1e-146  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00659018  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  54.53 
 
 		 531 aa  519  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1492  peptide chain release factor 3  48.29 
 
 		 567 aa  520  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1532  peptide chain release factor 3  52.99 
 
 		 514 aa  520  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  53.28 
 
 		 530 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0192  peptide chain release factor 3  50 
 
 		 527 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01678  peptide chain release factor 3  53.91 
 
 		 534 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790822  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1490  peptide chain release factor 3  50 
 
 		 535 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000251643  hitchhiker  0.00000000120572 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0138  peptide chain release factor 3  50.29 
 
 		 526 aa  513  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1662  peptide chain release factor 3  48.79 
 
 		 533 aa  512  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.828617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3649  peptide chain release factor 3  49.81 
 
 		 528 aa  514  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2819  peptide chain release factor 3  50.58 
 
 		 528 aa  511  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0140  peptide chain release factor 3  50.67 
 
 		 503 aa  512  1e-144  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0147  peptide chain release factor 3  50.1 
 
 		 534 aa  509  1e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5334  peptide chain release factor 3  52.16 
 
 		 533 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490929  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1267  peptide chain release factor 3  50.29 
 
 		 504 aa  509  1e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.551841  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02787  peptide chain release factor 3  49.25 
 
 		 529 aa  506  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0130  peptide chain release factor 3  49.9 
 
 		 534 aa  507  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.174893  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0435  peptide chain release factor 3  48.56 
 
 		 531 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0266  peptide chain release factor 3  53.08 
 
 		 529 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.580519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3872  peptide chain release factor 3  47.64 
 
 		 531 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0970  peptide chain release factor 3  51.89 
 
 		 524 aa  506  9.999999999999999e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00550606  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3761  peptide chain release factor 3  47.64 
 
 		 531 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.106529 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5808  peptide chain release factor 3  51.87 
 
 		 530 aa  506  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1358  peptide chain release factor 3  50.19 
 
 		 528 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3554  peptide chain release factor 3  48.86 
 
 		 526 aa  504  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.93604  decreased coverage  0.000001078 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0806  peptide chain release factor 3  47.8 
 
 		 528 aa  502  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0794725  hitchhiker  0.00323143 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2046  peptide chain release factor 3  51.59 
 
 		 531 aa  502  1e-141  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.840556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2700  peptide chain release factor 3  46.53 
 
 		 583 aa  503  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0551  peptide chain release factor 3  48.86 
 
 		 529 aa  503  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5127  peptide chain release factor 3  49.32 
 
 		 521 aa  502  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.166056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3586  peptide chain release factor 3  47.82 
 
 		 529 aa  502  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3053  peptide chain release factor 3  52.01 
 
 		 534 aa  504  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3382  peptide chain release factor 3  48.38 
 
 		 526 aa  498  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00211559  hitchhiker  0.00272137 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4813  peptide chain release factor 3  47.14 
 
 		 529 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4916  peptide chain release factor 3  47.14 
 
 		 529 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.996004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4968  peptide chain release factor 3  47.14 
 
 		 529 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3235  peptide chain release factor 3  49.13 
 
 		 523 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.458258  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0453  peptide chain release factor 3  48.2 
 
 		 529 aa  499  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.267512  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2820  peptide chain release factor 3  47.45 
 
 		 526 aa  500  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0200081  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1140  peptide chain release factor 3  52.23 
 
 		 525 aa  499  1e-140  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3053  peptide chain release factor 3  47.83 
 
 		 526 aa  501  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00432214  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0652  peptide chain release factor 3  48.02 
 
 		 529 aa  499  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4881  peptide chain release factor 3  47.14 
 
 		 529 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180345  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0877  peptide chain release factor 3  52.23 
 
 		 525 aa  499  1e-140  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4974  peptide chain release factor 3  47.14 
 
 		 529 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.219451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3466  peptide chain release factor 3  47.91 
 
 		 529 aa  500  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3370  peptide chain release factor 3  47.41 
 
 		 528 aa  501  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0764098  normal  0.150996 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0190  peptide chain release factor 3  48.85 
 
 		 531 aa  501  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>