More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1365 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0772  peptide chain release factor 3  65.32 
 
 		 514 aa  685    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00659018  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1037  peptide chain release factor 3  59.04 
 
 		 520 aa  644    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00273811  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1018  peptide chain release factor 3  59.04 
 
 		 520 aa  644    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0165348  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1351  peptide chain release factor 3  72.17 
 
 		 525 aa  788    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000276996  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0395  peptide chain release factor 3  65.7 
 
 		 523 aa  731    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.118943  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1267  peptide chain release factor 3  63.03 
 
 		 504 aa  687    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.551841  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1365  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 522 aa  1073    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000156295  hitchhiker  0.000000502816 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0140  peptide chain release factor 3  62.26 
 
 		 503 aa  680    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1532  peptide chain release factor 3  65.77 
 
 		 514 aa  687    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0609  peptide chain release factor 3  57.69 
 
 		 520 aa  634  1e-180  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00905219  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0780  peptide chain release factor 3  53.31 
 
 		 543 aa  550  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.474397  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0328  peptide chain release factor 3  51.24 
 
 		 533 aa  530  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0398  peptide chain release factor 3  50.48 
 
 		 532 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1434  peptide chain release factor 3  49.71 
 
 		 539 aa  514  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0592  peptide chain release factor 3  51.04 
 
 		 531 aa  510  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0581  peptide chain release factor 3  51.04 
 
 		 531 aa  510  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0116263  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3298  peptide chain release factor 3  49.53 
 
 		 540 aa  506  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2904  peptide chain release factor 3  49.34 
 
 		 542 aa  505  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835611  normal  0.0349958 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4549  peptide chain release factor 3  49.91 
 
 		 563 aa  502  1e-141  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1490  peptide chain release factor 3  48.85 
 
 		 535 aa  504  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000251643  hitchhiker  0.00000000120572 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3254  peptide chain release factor 3  49.71 
 
 		 529 aa  504  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000111312  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1843  peptide chain release factor 3  49.06 
 
 		 540 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3649  peptide chain release factor 3  49.43 
 
 		 528 aa  500  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1056  peptide chain release factor 3  48.3 
 
 		 542 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448459 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0414  peptide chain release factor 3  48.94 
 
 		 531 aa  489  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  53.07 
 
 		 528 aa  491  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2024  peptide chain release factor 3  48.3 
 
 		 539 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0435  peptide chain release factor 3  48.27 
 
 		 531 aa  489  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1999  peptide chain release factor 3  48.3 
 
 		 539 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  49.9 
 
 		 542 aa  488  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0266  peptide chain release factor 3  47.83 
 
 		 529 aa  485  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.580519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2365  peptide chain release factor 3  48.39 
 
 		 556 aa  486  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.100255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  50.64 
 
 		 528 aa  488  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  46.79 
 
 		 531 aa  488  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  47.89 
 
 		 524 aa  479  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1279  peptide chain release factor 3  48.11 
 
 		 548 aa  478  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1704  peptide chain release factor 3  45.95 
 
 		 542 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1492  peptide chain release factor 3  46.18 
 
 		 567 aa  479  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2474  peptide chain release factor 3  47.52 
 
 		 526 aa  478  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01678  peptide chain release factor 3  45.56 
 
 		 534 aa  477  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790822  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0095  peptide chain release factor 3  47.43 
 
 		 555 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0147  peptide chain release factor 3  47.82 
 
 		 535 aa  475  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3053  peptide chain release factor 3  45.37 
 
 		 534 aa  475  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07201  peptide chain release factor 3  47.43 
 
 		 555 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.577625  normal  0.0107792 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2514  peptide chain release factor 3  49.07 
 
 		 539 aa  477  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07361  peptide chain release factor 3  48.64 
 
 		 545 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.301095  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2144  peptide chain release factor 3  49.07 
 
 		 539 aa  477  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.280372  hitchhiker  0.00257154 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1990  peptide chain release factor 3  45.28 
 
 		 526 aa  474  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  45.06 
 
 		 530 aa  474  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1821  peptide chain release factor 3  50 
 
 		 536 aa  473  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0968  peptide chain release factor 3  46.29 
 
 		 543 aa  472  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3596  peptide chain release factor 3  47.81 
 
 		 529 aa  474  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.750333  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4287  peptide chain release factor 3  50 
 
 		 533 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2968  peptide chain release factor 3  50.21 
 
 		 533 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.720802 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1393  peptide chain release factor 3  45.44 
 
 		 524 aa  473  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263078  normal  0.346403 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3858  peptide chain release factor 3  45.64 
 
 		 547 aa  471  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1662  peptide chain release factor 3  44.63 
 
 		 533 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.828617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0147  peptide chain release factor 3  44.78 
 
 		 534 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3219  peptide chain release factor 3  44.88 
 
 		 538 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.76683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  46.37 
 
 		 524 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3808  peptide chain release factor 3  45.27 
 
 		 538 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5808  peptide chain release factor 3  44.17 
 
 		 530 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13410  peptide chain release factor 3  49.37 
 
 		 527 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.898041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07731  peptide chain release factor 3  48.67 
 
 		 555 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107568 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1202  peptide chain release factor 3  49.37 
 
 		 527 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04250  peptide chain release factor 3  46.42 
 
 		 529 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.631503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3624  peptide chain release factor 3  46.42 
 
 		 529 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6925  peptide chain release factor 3  49.79 
 
 		 533 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.209121  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07181  peptide chain release factor 3  49.03 
 
 		 545 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.55147  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3935  peptide chain release factor 3  48.19 
 
 		 526 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3761  peptide chain release factor 3  44.74 
 
 		 531 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.106529 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5334  peptide chain release factor 3  44.86 
 
 		 533 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490929  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4609  peptide chain release factor 3  46.42 
 
 		 529 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00121865  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0369  peptide chain release factor 3  44.72 
 
 		 527 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0970  peptide chain release factor 3  46.1 
 
 		 524 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00550606  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04216  hypothetical protein  46.42 
 
 		 529 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.659942  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4922  peptide chain release factor 3  46.42 
 
 		 529 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.55632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4019  peptide chain release factor 3  49.47 
 
 		 526 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5160199999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0130  peptide chain release factor 3  44.78 
 
 		 534 aa  468  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.174893  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1011  peptide chain release factor 3  45.23 
 
 		 528 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1828  peptide chain release factor 3  45.16 
 
 		 544 aa  465  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4918  peptide chain release factor 3  46.42 
 
 		 529 aa  465  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100391  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07161  peptide chain release factor 3  49.12 
 
 		 545 aa  465  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.651427  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1844  peptide chain release factor 3  45.35 
 
 		 541 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4971  peptide chain release factor 3  46.42 
 
 		 529 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00185733  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1358  peptide chain release factor 3  50.11 
 
 		 528 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5887  peptide chain release factor 3  46.42 
 
 		 529 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.397514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2372  peptide chain release factor 3  46.72 
 
 		 529 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1764  peptide chain release factor 3  45.35 
 
 		 541 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3682  peptide chain release factor 3  46.42 
 
 		 529 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.297475  hitchhiker  0.00075439 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3872  peptide chain release factor 3  44.74 
 
 		 531 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4253  peptide chain release factor 3  45.8 
 
 		 527 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.995333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2819  peptide chain release factor 3  49.58 
 
 		 528 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4686  peptide chain release factor 3  45.71 
 
 		 542 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3504  peptide chain release factor 3  48.84 
 
 		 529 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2112  peptide chain release factor 3  44.97 
 
 		 541 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02787  peptide chain release factor 3  46.2 
 
 		 529 aa  463  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0645  peptide chain release factor 3  45.16 
 
 		 543 aa  463  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.563471  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2820  peptide chain release factor 3  47.09 
 
 		 526 aa  464  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0200081  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0652  peptide chain release factor 3  48.84 
 
 		 529 aa  462  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>