More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2365 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2024  peptide chain release factor 3  76.31 
 
 		 539 aa  874    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07201  peptide chain release factor 3  71.22 
 
 		 555 aa  810    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.577625  normal  0.0107792 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0095  peptide chain release factor 3  71.22 
 
 		 555 aa  810    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07361  peptide chain release factor 3  68.97 
 
 		 545 aa  781    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.301095  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3298  peptide chain release factor 3  77.47 
 
 		 540 aa  900    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1198  peptide chain release factor 3  73.84 
 
 		 548 aa  805    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14191  peptide chain release factor 3  73.98 
 
 		 571 aa  794    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1279  peptide chain release factor 3  74.77 
 
 		 548 aa  838    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07731  peptide chain release factor 3  71.78 
 
 		 555 aa  808    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107568 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0663  peptide chain release factor 3  70.28 
 
 		 545 aa  773    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.635496  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07181  peptide chain release factor 3  70.84 
 
 		 545 aa  784    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.55147  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2365  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 556 aa  1149    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.100255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1843  peptide chain release factor 3  74.58 
 
 		 540 aa  877    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1056  peptide chain release factor 3  76.44 
 
 		 542 aa  885    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448459 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07161  peptide chain release factor 3  70.84 
 
 		 545 aa  783    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.651427  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4549  peptide chain release factor 3  77.88 
 
 		 563 aa  894    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2904  peptide chain release factor 3  77.18 
 
 		 542 aa  914    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835611  normal  0.0349958 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1999  peptide chain release factor 3  76.31 
 
 		 539 aa  874    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27956  predicted protein  54.53 
 
 		 634 aa  592  1e-168  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1434  peptide chain release factor 3  52.36 
 
 		 539 aa  580  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157478  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3596  peptide chain release factor 3  53.06 
 
 		 529 aa  568  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.750333  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0780  peptide chain release factor 3  53.67 
 
 		 543 aa  567  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.474397  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2700  peptide chain release factor 3  50.35 
 
 		 583 aa  564  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0328  peptide chain release factor 3  51.89 
 
 		 533 aa  560  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0592  peptide chain release factor 3  51.04 
 
 		 531 aa  560  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0581  peptide chain release factor 3  51.04 
 
 		 531 aa  560  1e-158  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0116263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0398  peptide chain release factor 3  51.91 
 
 		 532 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3254  peptide chain release factor 3  54.22 
 
 		 529 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000111312  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1492  peptide chain release factor 3  51.71 
 
 		 567 aa  539  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1704  peptide chain release factor 3  50.76 
 
 		 542 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1764  peptide chain release factor 3  49.43 
 
 		 541 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1490  peptide chain release factor 3  48.78 
 
 		 535 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000251643  hitchhiker  0.00000000120572 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1351  peptide chain release factor 3  48.86 
 
 		 525 aa  516  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000276996  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1844  peptide chain release factor 3  49.43 
 
 		 541 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2112  peptide chain release factor 3  49.43 
 
 		 541 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1990  peptide chain release factor 3  48.38 
 
 		 526 aa  499  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  51.91 
 
 		 542 aa  500  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01678  peptide chain release factor 3  51.59 
 
 		 534 aa  500  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  49.23 
 
 		 528 aa  498  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0882  peptide chain release factor 3  48.92 
 
 		 527 aa  500  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0609  peptide chain release factor 3  47.33 
 
 		 520 aa  496  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00905219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1037  peptide chain release factor 3  47.9 
 
 		 520 aa  498  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00273811  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1018  peptide chain release factor 3  47.9 
 
 		 520 aa  498  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0165348  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  48.48 
 
 		 524 aa  497  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3053  peptide chain release factor 3  47.35 
 
 		 534 aa  493  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0970  peptide chain release factor 3  47.78 
 
 		 524 aa  494  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00550606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2819  peptide chain release factor 3  47.99 
 
 		 528 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3935  peptide chain release factor 3  49.01 
 
 		 526 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4019  peptide chain release factor 3  48.81 
 
 		 526 aa  491  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5160199999999995e-20 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0140  peptide chain release factor 3  47.79 
 
 		 503 aa  489  1e-137  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0935  peptide chain release factor 3  50.64 
 
 		 526 aa  485  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0130  peptide chain release factor 3  48.08 
 
 		 534 aa  486  1e-136  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.174893  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0147  peptide chain release factor 3  48.08 
 
 		 534 aa  487  1e-136  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  48.63 
 
 		 528 aa  487  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0395  peptide chain release factor 3  46.93 
 
 		 523 aa  485  1e-136  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.118943  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1267  peptide chain release factor 3  46.55 
 
 		 504 aa  486  1e-136  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.551841  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1365  peptide chain release factor 3  48.39 
 
 		 522 aa  486  1e-136  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000156295  hitchhiker  0.000000502816 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0414  peptide chain release factor 3  47.88 
 
 		 531 aa  484  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3219  peptide chain release factor 3  47.72 
 
 		 538 aa  484  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.76683  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0905  peptide chain release factor 3  50.21 
 
 		 526 aa  483  1e-135  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4411  peptide chain release factor 3  46.72 
 
 		 541 aa  485  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1828  peptide chain release factor 3  45.71 
 
 		 544 aa  483  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0435  peptide chain release factor 3  45.66 
 
 		 531 aa  483  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  47.79 
 
 		 530 aa  484  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04250  peptide chain release factor 3  46.53 
 
 		 529 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.631503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3624  peptide chain release factor 3  46.53 
 
 		 529 aa  479  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4881  peptide chain release factor 3  46.82 
 
 		 529 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180345  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1662  peptide chain release factor 3  46.85 
 
 		 533 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.828617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4918  peptide chain release factor 3  46.53 
 
 		 529 aa  479  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100391  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3872  peptide chain release factor 3  46.46 
 
 		 531 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3682  peptide chain release factor 3  46.53 
 
 		 529 aa  479  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.297475  hitchhiker  0.00075439 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4412  peptide chain release factor 3  46.39 
 
 		 527 aa  481  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000888652  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0652  peptide chain release factor 3  50.11 
 
 		 529 aa  479  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4609  peptide chain release factor 3  46.53 
 
 		 529 aa  479  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00121865  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00010  peptide chain release factor 3  45.47 
 
 		 533 aa  480  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.417378  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3808  peptide chain release factor 3  47.15 
 
 		 538 aa  481  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4968  peptide chain release factor 3  46.82 
 
 		 529 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1021  peptide chain release factor 3  50.32 
 
 		 527 aa  479  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000101004  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4916  peptide chain release factor 3  46.82 
 
 		 529 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.996004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04216  hypothetical protein  46.53 
 
 		 529 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.659942  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4971  peptide chain release factor 3  46.53 
 
 		 529 aa  479  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00185733  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3761  peptide chain release factor 3  46.46 
 
 		 531 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.106529 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4974  peptide chain release factor 3  46.82 
 
 		 529 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.219451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3858  peptide chain release factor 3  46.77 
 
 		 547 aa  480  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4922  peptide chain release factor 3  46.53 
 
 		 529 aa  479  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.55632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5887  peptide chain release factor 3  46.53 
 
 		 529 aa  479  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.397514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1678  peptide chain release factor 3  47.12 
 
 		 533 aa  480  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0068133  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4813  peptide chain release factor 3  46.82 
 
 		 529 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0138  peptide chain release factor 3  47.04 
 
 		 526 aa  477  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0205  peptide chain release factor 3  45 
 
 		 526 aa  477  1e-133  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1592  peptide chain release factor 3  48.37 
 
 		 527 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2092  peptide chain release factor 3  46.45 
 
 		 528 aa  478  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0946  peptide chain release factor 3  44.3 
 
 		 530 aa  477  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0192  peptide chain release factor 3  46.01 
 
 		 527 aa  475  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2514  peptide chain release factor 3  47.83 
 
 		 539 aa  477  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5127  peptide chain release factor 3  46.92 
 
 		 521 aa  476  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.166056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  47.18 
 
 		 524 aa  476  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5122  peptide chain release factor 3  45.75 
 
 		 531 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.535643  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1393  peptide chain release factor 3  50.32 
 
 		 524 aa  478  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263078  normal  0.346403 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1821  peptide chain release factor 3  50.86 
 
 		 536 aa  478  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>