More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0663 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_07361  peptide chain release factor 3  91.56 
 
 		 545 aa  1042    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.301095  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1999  peptide chain release factor 3  68.3 
 
 		 539 aa  764    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14191  peptide chain release factor 3  76.92 
 
 		 571 aa  845    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0095  peptide chain release factor 3  78.45 
 
 		 555 aa  873    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3298  peptide chain release factor 3  66.48 
 
 		 540 aa  734    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07181  peptide chain release factor 3  96.7 
 
 		 545 aa  1066    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.55147  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1198  peptide chain release factor 3  77.2 
 
 		 548 aa  850    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1279  peptide chain release factor 3  78.05 
 
 		 548 aa  886    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0663  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 545 aa  1121    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.635496  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2365  peptide chain release factor 3  70.28 
 
 		 556 aa  790    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.100255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07201  peptide chain release factor 3  78.45 
 
 		 555 aa  873    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.577625  normal  0.0107792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2024  peptide chain release factor 3  68.3 
 
 		 539 aa  764    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4549  peptide chain release factor 3  66.98 
 
 		 563 aa  736    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1056  peptide chain release factor 3  66.79 
 
 		 542 aa  750    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2904  peptide chain release factor 3  68.18 
 
 		 542 aa  769    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835611  normal  0.0349958 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1843  peptide chain release factor 3  68.18 
 
 		 540 aa  764    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07731  peptide chain release factor 3  75.84 
 
 		 555 aa  862    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107568 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07161  peptide chain release factor 3  96.7 
 
 		 545 aa  1069    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.651427  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27956  predicted protein  54.72 
 
 		 634 aa  580  1e-164  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0780  peptide chain release factor 3  52.62 
 
 		 543 aa  559  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.474397  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3596  peptide chain release factor 3  51.74 
 
 		 529 aa  560  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.750333  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0328  peptide chain release factor 3  52.31 
 
 		 533 aa  557  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1434  peptide chain release factor 3  51.43 
 
 		 539 aa  556  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0592  peptide chain release factor 3  51.71 
 
 		 531 aa  557  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0581  peptide chain release factor 3  51.71 
 
 		 531 aa  557  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0116263  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3254  peptide chain release factor 3  52.06 
 
 		 529 aa  543  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000111312  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0398  peptide chain release factor 3  53.83 
 
 		 532 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1704  peptide chain release factor 3  50.75 
 
 		 542 aa  532  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2700  peptide chain release factor 3  48.6 
 
 		 583 aa  522  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1844  peptide chain release factor 3  51.07 
 
 		 541 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1764  peptide chain release factor 3  51.07 
 
 		 541 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2112  peptide chain release factor 3  50.68 
 
 		 541 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  49.41 
 
 		 528 aa  506  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1351  peptide chain release factor 3  49.33 
 
 		 525 aa  503  1e-141  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000276996  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0609  peptide chain release factor 3  48.45 
 
 		 520 aa  492  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00905219  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1678  peptide chain release factor 3  47.95 
 
 		 533 aa  494  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0068133  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1018  peptide chain release factor 3  49.22 
 
 		 520 aa  491  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0165348  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1490  peptide chain release factor 3  47.85 
 
 		 535 aa  489  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000251643  hitchhiker  0.00000000120572 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2514  peptide chain release factor 3  48.53 
 
 		 539 aa  491  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2144  peptide chain release factor 3  48.53 
 
 		 539 aa  491  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.280372  hitchhiker  0.00257154 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0882  peptide chain release factor 3  46.63 
 
 		 527 aa  489  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1037  peptide chain release factor 3  49.22 
 
 		 520 aa  491  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00273811  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01678  peptide chain release factor 3  50.42 
 
 		 534 aa  485  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790822  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  49.9 
 
 		 542 aa  486  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0147  peptide chain release factor 3  50.1 
 
 		 534 aa  485  1e-136  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1492  peptide chain release factor 3  47.57 
 
 		 567 aa  488  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0138  peptide chain release factor 3  46.53 
 
 		 526 aa  482  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  52.15 
 
 		 531 aa  485  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0935  peptide chain release factor 3  50.42 
 
 		 526 aa  484  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0130  peptide chain release factor 3  50.1 
 
 		 534 aa  484  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.174893  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  48.13 
 
 		 524 aa  483  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  48.24 
 
 		 528 aa  484  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0192  peptide chain release factor 3  46.91 
 
 		 527 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0551  peptide chain release factor 3  50.94 
 
 		 529 aa  484  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0905  peptide chain release factor 3  49.69 
 
 		 526 aa  481  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2819  peptide chain release factor 3  47.64 
 
 		 528 aa  479  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3935  peptide chain release factor 3  47.48 
 
 		 526 aa  481  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3053  peptide chain release factor 3  49.15 
 
 		 534 aa  480  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  47.91 
 
 		 524 aa  479  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1021  peptide chain release factor 3  48.82 
 
 		 527 aa  479  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000101004  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4019  peptide chain release factor 3  47.48 
 
 		 526 aa  481  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5160199999999995e-20 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0806  peptide chain release factor 3  49.17 
 
 		 528 aa  481  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0794725  hitchhiker  0.00323143 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4916  peptide chain release factor 3  48.72 
 
 		 529 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.996004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  49.79 
 
 		 530 aa  477  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4968  peptide chain release factor 3  48.72 
 
 		 529 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0791  peptide chain release factor 3  45.33 
 
 		 530 aa  476  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0807  peptide chain release factor 3  50 
 
 		 527 aa  476  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.986611  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4306  peptide chain release factor 3  49.89 
 
 		 527 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.546945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2497  peptide chain release factor 3  46.23 
 
 		 530 aa  476  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5127  peptide chain release factor 3  46.24 
 
 		 521 aa  477  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.166056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4813  peptide chain release factor 3  48.72 
 
 		 529 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0147  peptide chain release factor 3  47.84 
 
 		 535 aa  478  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4881  peptide chain release factor 3  48.72 
 
 		 529 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180345  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4974  peptide chain release factor 3  48.72 
 
 		 529 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.219451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1267  peptide chain release factor 3  46.3 
 
 		 504 aa  476  1e-133  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.551841  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1532  peptide chain release factor 3  47.87 
 
 		 514 aa  477  1e-133  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4412  peptide chain release factor 3  47.05 
 
 		 527 aa  477  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000888652  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04250  peptide chain release factor 3  50.53 
 
 		 529 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.631503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3624  peptide chain release factor 3  50.53 
 
 		 529 aa  474  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1202  peptide chain release factor 3  49.79 
 
 		 527 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0453  peptide chain release factor 3  50.85 
 
 		 529 aa  475  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.267512  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4971  peptide chain release factor 3  50.53 
 
 		 529 aa  474  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00185733  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4253  peptide chain release factor 3  49.57 
 
 		 527 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.995333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5334  peptide chain release factor 3  48.57 
 
 		 533 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490929  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2092  peptide chain release factor 3  46.48 
 
 		 528 aa  474  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0414  peptide chain release factor 3  47.05 
 
 		 531 aa  474  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3219  peptide chain release factor 3  47.17 
 
 		 538 aa  474  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.76683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02787  peptide chain release factor 3  49.27 
 
 		 529 aa  473  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0652  peptide chain release factor 3  51.07 
 
 		 529 aa  475  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4918  peptide chain release factor 3  50.53 
 
 		 529 aa  474  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04216  hypothetical protein  50.53 
 
 		 529 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.659942  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0792  peptide chain release factor 3  49.36 
 
 		 527 aa  474  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4609  peptide chain release factor 3  50.53 
 
 		 529 aa  474  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00121865  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4922  peptide chain release factor 3  50.53 
 
 		 529 aa  474  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.55632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3682  peptide chain release factor 3  50.53 
 
 		 529 aa  474  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.297475  hitchhiker  0.00075439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5887  peptide chain release factor 3  50.53 
 
 		 529 aa  474  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.397514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13410  peptide chain release factor 3  50 
 
 		 527 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.898041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1365  peptide chain release factor 3  48.26 
 
 		 522 aa  474  1e-132  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000156295  hitchhiker  0.000000502816 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03381  peptide chain release factor 3  49.17 
 
 		 529 aa  472  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0968  peptide chain release factor 3  47.77 
 
 		 528 aa  472  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.463155  decreased coverage  0.000218803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>