More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2144 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04250  peptide chain release factor 3  61.08 
 
 		 529 aa  702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.631503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3624  peptide chain release factor 3  61.08 
 
 		 529 aa  702    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2820  peptide chain release factor 3  61.52 
 
 		 526 aa  702    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0200081  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0138  peptide chain release factor 3  62.88 
 
 		 526 aa  681    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0872  peptide chain release factor 3  63.78 
 
 		 527 aa  699    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2819  peptide chain release factor 3  63.22 
 
 		 528 aa  675    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4412  peptide chain release factor 3  62.69 
 
 		 527 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000888652  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1990  peptide chain release factor 3  66.41 
 
 		 526 aa  722    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1662  peptide chain release factor 3  63.65 
 
 		 533 aa  691    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.828617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3872  peptide chain release factor 3  64.44 
 
 		 531 aa  693    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1111  peptide chain release factor 3  64.73 
 
 		 526 aa  726    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0534  peptide chain release factor 3  62.01 
 
 		 529 aa  706    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.319663  hitchhiker  0.0098421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4974  peptide chain release factor 3  61.45 
 
 		 529 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.219451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4287  peptide chain release factor 3  58.62 
 
 		 533 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0902  peptide chain release factor 3  62.5 
 
 		 541 aa  701    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.779467  normal  0.296207 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4579  peptide chain release factor 3  63.78 
 
 		 527 aa  708    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2474  peptide chain release factor 3  64.16 
 
 		 526 aa  724    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0266  peptide chain release factor 3  62.62 
 
 		 529 aa  669    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.580519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5887  peptide chain release factor 3  61.08 
 
 		 529 aa  702    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.397514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0147  peptide chain release factor 3  65.32 
 
 		 534 aa  697    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0935  peptide chain release factor 3  63.86 
 
 		 526 aa  731    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0905  peptide chain release factor 3  63.67 
 
 		 526 aa  731    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4253  peptide chain release factor 3  63.58 
 
 		 527 aa  705    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.995333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0380  peptide chain release factor 3  60.38 
 
 		 531 aa  670    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.864644 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  62.64 
 
 		 524 aa  680    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0190  peptide chain release factor 3  63.46 
 
 		 531 aa  699    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4881  peptide chain release factor 3  61.45 
 
 		 529 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180345  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1011  peptide chain release factor 3  60.61 
 
 		 528 aa  685    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5334  peptide chain release factor 3  62.29 
 
 		 533 aa  674    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490929  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0968  peptide chain release factor 3  64.25 
 
 		 543 aa  728    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0806  peptide chain release factor 3  61.27 
 
 		 528 aa  701    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0794725  hitchhiker  0.00323143 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3682  peptide chain release factor 3  61.08 
 
 		 529 aa  702    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.297475  hitchhiker  0.00075439 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4968  peptide chain release factor 3  61.45 
 
 		 529 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  67.69 
 
 		 542 aa  750    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0807  peptide chain release factor 3  64.35 
 
 		 527 aa  713    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.986611  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4918  peptide chain release factor 3  61.08 
 
 		 529 aa  702    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100391  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  65.7 
 
 		 528 aa  724    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3633  peptide chain release factor 3  62.31 
 
 		 529 aa  699    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0792  peptide chain release factor 3  63.39 
 
 		 527 aa  702    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01678  peptide chain release factor 3  65.44 
 
 		 534 aa  706    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790822  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2514  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 539 aa  1105    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0192  peptide chain release factor 3  63.08 
 
 		 527 aa  683    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3649  peptide chain release factor 3  60.81 
 
 		 528 aa  667    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0970  peptide chain release factor 3  62.28 
 
 		 524 aa  690    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00550606  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03381  peptide chain release factor 3  61.26 
 
 		 529 aa  687    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2046  peptide chain release factor 3  60.15 
 
 		 531 aa  688    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.840556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3382  peptide chain release factor 3  61.85 
 
 		 526 aa  697    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00211559  hitchhiker  0.00272137 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2372  peptide chain release factor 3  62.06 
 
 		 529 aa  662    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  67.57 
 
 		 531 aa  740    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3935  peptide chain release factor 3  63.85 
 
 		 526 aa  681    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3504  peptide chain release factor 3  62.31 
 
 		 529 aa  699    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3235  peptide chain release factor 3  62.04 
 
 		 523 aa  707    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.458258  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4813  peptide chain release factor 3  61.45 
 
 		 529 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0414  peptide chain release factor 3  63.13 
 
 		 531 aa  684    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0916  peptide chain release factor 3  63.58 
 
 		 527 aa  699    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0920838  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1135  peptide chain release factor 3  62.24 
 
 		 526 aa  708    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000115855  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2519  peptide chain release factor 3  62.67 
 
 		 527 aa  704    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0130  peptide chain release factor 3  65.32 
 
 		 534 aa  696    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.174893  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  62.79 
 
 		 524 aa  691    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2968  peptide chain release factor 3  59 
 
 		 533 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.720802 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1021  peptide chain release factor 3  62.48 
 
 		 527 aa  690    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000101004  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4922  peptide chain release factor 3  61.08 
 
 		 529 aa  702    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.55632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12250  peptide chain release factor 3  62.81 
 
 		 527 aa  697    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.882878  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1828  peptide chain release factor 3  63.64 
 
 		 544 aa  712    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0837  peptide chain release factor 3  62.31 
 
 		 529 aa  699    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0422  peptide chain release factor 3  60.77 
 
 		 531 aa  674    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5808  peptide chain release factor 3  64.53 
 
 		 530 aa  688    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0877  peptide chain release factor 3  65.31 
 
 		 525 aa  721    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1202  peptide chain release factor 3  63.2 
 
 		 527 aa  700    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0147  peptide chain release factor 3  66.92 
 
 		 535 aa  729    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3371  peptide chain release factor 3  62.43 
 
 		 523 aa  709    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0198312  hitchhiker  0.00795059 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3053  peptide chain release factor 3  64.93 
 
 		 534 aa  704    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1358  peptide chain release factor 3  64.16 
 
 		 528 aa  715    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4916  peptide chain release factor 3  61.45 
 
 		 529 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.996004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1140  peptide chain release factor 3  65.31 
 
 		 525 aa  721    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3761  peptide chain release factor 3  64.44 
 
 		 531 aa  693    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.106529 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0384  peptide chain release factor 3  61.71 
 
 		 526 aa  698    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3554  peptide chain release factor 3  62.04 
 
 		 526 aa  698    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.93604  decreased coverage  0.000001078 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1033  peptide chain release factor 3  62.04 
 
 		 526 aa  704    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00526307  hitchhiker  0.0000000642839 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1098  peptide chain release factor 3  62.04 
 
 		 526 aa  704    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00192369  unclonable  0.0000319314 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1393  peptide chain release factor 3  67.05 
 
 		 524 aa  734    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263078  normal  0.346403 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0997  peptide chain release factor 3  60.89 
 
 		 526 aa  696    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0156098  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0015  peptide chain release factor 3  63.57 
 
 		 517 aa  672    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3053  peptide chain release factor 3  62.81 
 
 		 526 aa  706    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00432214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13410  peptide chain release factor 3  63.01 
 
 		 527 aa  699    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.898041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0652  peptide chain release factor 3  61.83 
 
 		 529 aa  698    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4609  peptide chain release factor 3  61.08 
 
 		 529 aa  702    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00121865  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02787  peptide chain release factor 3  62.5 
 
 		 529 aa  686    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6925  peptide chain release factor 3  59 
 
 		 533 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.209121  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2827  peptide chain release factor 3  62.04 
 
 		 526 aa  705    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000333993  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3219  peptide chain release factor 3  58.93 
 
 		 538 aa  636    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.76683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2144  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 539 aa  1105    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.280372  hitchhiker  0.00257154 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  61.97 
 
 		 528 aa  659    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0613  peptide chain release factor 3  61.9 
 
 		 526 aa  695    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1037  peptide chain release factor 3  62.04 
 
 		 526 aa  705    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00294724  unclonable  0.000000000176372 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0882  peptide chain release factor 3  63.27 
 
 		 527 aa  677    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4971  peptide chain release factor 3  61.08 
 
 		 529 aa  702    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00185733  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4306  peptide chain release factor 3  63.2 
 
 		 527 aa  697    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.546945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3232  peptide chain release factor 3  61.85 
 
 		 526 aa  705    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0110977  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0968  peptide chain release factor 3  61.86 
 
 		 528 aa  689    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.463155  decreased coverage  0.000218803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>