More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0147 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0138  peptide chain release factor 3  59.77 
 
 		 526 aa  647    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0872  peptide chain release factor 3  58.46 
 
 		 527 aa  644    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3053  peptide chain release factor 3  61.83 
 
 		 534 aa  666    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1990  peptide chain release factor 3  60.8 
 
 		 526 aa  672    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1662  peptide chain release factor 3  60.98 
 
 		 533 aa  645    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.828617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1202  peptide chain release factor 3  59.23 
 
 		 527 aa  649    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1111  peptide chain release factor 3  58.7 
 
 		 526 aa  643    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4579  peptide chain release factor 3  59.04 
 
 		 527 aa  647    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  62.1 
 
 		 530 aa  678    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0935  peptide chain release factor 3  60.5 
 
 		 526 aa  667    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0905  peptide chain release factor 3  60.88 
 
 		 526 aa  671    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4253  peptide chain release factor 3  59.04 
 
 		 527 aa  647    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.995333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0380  peptide chain release factor 3  57.31 
 
 		 531 aa  637    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.864644 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  60.46 
 
 		 524 aa  642    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2144  peptide chain release factor 3  66.92 
 
 		 539 aa  729    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.280372  hitchhiker  0.00257154 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3554  peptide chain release factor 3  58.08 
 
 		 526 aa  639    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.93604  decreased coverage  0.000001078 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5334  peptide chain release factor 3  61.02 
 
 		 533 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490929  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0968  peptide chain release factor 3  69.94 
 
 		 543 aa  764    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  63 
 
 		 542 aa  692    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0807  peptide chain release factor 3  58.65 
 
 		 527 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.986611  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  59.96 
 
 		 528 aa  660    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0192  peptide chain release factor 3  60.04 
 
 		 527 aa  650    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0806  peptide chain release factor 3  57.06 
 
 		 528 aa  641    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0794725  hitchhiker  0.00323143 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0435  peptide chain release factor 3  57.55 
 
 		 531 aa  642    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0970  peptide chain release factor 3  59.23 
 
 		 524 aa  649    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00550606  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0147  peptide chain release factor 3  60.57 
 
 		 534 aa  656    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2474  peptide chain release factor 3  58.86 
 
 		 526 aa  657    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2330  peptide chain release factor 3  59.39 
 
 		 535 aa  637    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0147  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 535 aa  1098    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0453  peptide chain release factor 3  59.01 
 
 		 529 aa  642    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.267512  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0916  peptide chain release factor 3  58.65 
 
 		 527 aa  646    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0920838  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2514  peptide chain release factor 3  66.92 
 
 		 539 aa  729    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2519  peptide chain release factor 3  58.8 
 
 		 527 aa  646    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0130  peptide chain release factor 3  60.57 
 
 		 534 aa  655    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.174893  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  60.23 
 
 		 524 aa  646    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1821  peptide chain release factor 3  60.86 
 
 		 536 aa  672    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4019  peptide chain release factor 3  60.34 
 
 		 526 aa  640    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5160199999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3761  peptide chain release factor 3  60.15 
 
 		 531 aa  643    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.106529 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1828  peptide chain release factor 3  58.03 
 
 		 544 aa  640    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0422  peptide chain release factor 3  57.5 
 
 		 531 aa  636    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5808  peptide chain release factor 3  61.86 
 
 		 530 aa  648    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3858  peptide chain release factor 3  57.92 
 
 		 547 aa  643    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0877  peptide chain release factor 3  60.47 
 
 		 525 aa  664    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3382  peptide chain release factor 3  58.46 
 
 		 526 aa  646    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00211559  hitchhiker  0.00272137 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2820  peptide chain release factor 3  58.08 
 
 		 526 aa  639    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0200081  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12250  peptide chain release factor 3  59.23 
 
 		 527 aa  646    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.882878  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1033  peptide chain release factor 3  57.82 
 
 		 526 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00526307  hitchhiker  0.0000000642839 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1098  peptide chain release factor 3  57.82 
 
 		 526 aa  639    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00192369  unclonable  0.0000319314 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1393  peptide chain release factor 3  62.19 
 
 		 524 aa  666    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263078  normal  0.346403 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13410  peptide chain release factor 3  59.04 
 
 		 527 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.898041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0792  peptide chain release factor 3  58.46 
 
 		 527 aa  646    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0902  peptide chain release factor 3  58.46 
 
 		 541 aa  643    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.779467  normal  0.296207 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  63.15 
 
 		 531 aa  684    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01678  peptide chain release factor 3  62 
 
 		 534 aa  663    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790822  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1037  peptide chain release factor 3  57.82 
 
 		 526 aa  639    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00294724  unclonable  0.000000000176372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3935  peptide chain release factor 3  60.92 
 
 		 526 aa  645    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0882  peptide chain release factor 3  60.8 
 
 		 527 aa  642    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4306  peptide chain release factor 3  59.42 
 
 		 527 aa  653    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.546945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1140  peptide chain release factor 3  60.47 
 
 		 525 aa  664    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0414  peptide chain release factor 3  60.77 
 
 		 531 aa  662    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3872  peptide chain release factor 3  60.15 
 
 		 531 aa  643    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0551  peptide chain release factor 3  58.48 
 
 		 529 aa  636    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3053  peptide chain release factor 3  57.88 
 
 		 526 aa  635    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00432214  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0190  peptide chain release factor 3  58.35 
 
 		 531 aa  632  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3219  peptide chain release factor 3  58.67 
 
 		 538 aa  631  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.76683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3808  peptide chain release factor 3  59.05 
 
 		 538 aa  634  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0997  peptide chain release factor 3  56.95 
 
 		 526 aa  632  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0156098  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2827  peptide chain release factor 3  56.87 
 
 		 526 aa  632  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000333993  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3232  peptide chain release factor 3  56.49 
 
 		 526 aa  628  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0110977  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3586  peptide chain release factor 3  58.06 
 
 		 529 aa  631  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4412  peptide chain release factor 3  59.77 
 
 		 527 aa  628  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000888652  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0652  peptide chain release factor 3  57.5 
 
 		 529 aa  630  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3371  peptide chain release factor 3  56.49 
 
 		 523 aa  628  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0198312  hitchhiker  0.00795059 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1358  peptide chain release factor 3  56.81 
 
 		 528 aa  629  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3466  peptide chain release factor 3  57.87 
 
 		 529 aa  631  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0534  peptide chain release factor 3  57.22 
 
 		 529 aa  629  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.319663  hitchhiker  0.0098421 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04250  peptide chain release factor 3  56.66 
 
 		 529 aa  627  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.631503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3624  peptide chain release factor 3  56.66 
 
 		 529 aa  627  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3633  peptide chain release factor 3  56.93 
 
 		 529 aa  625  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04216  hypothetical protein  56.66 
 
 		 529 aa  627  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.659942  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3682  peptide chain release factor 3  56.66 
 
 		 529 aa  627  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.297475  hitchhiker  0.00075439 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2819  peptide chain release factor 3  59.81 
 
 		 528 aa  625  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0837  peptide chain release factor 3  56.93 
 
 		 529 aa  625  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4922  peptide chain release factor 3  56.66 
 
 		 529 aa  627  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.55632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3235  peptide chain release factor 3  56.3 
 
 		 523 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.458258  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1135  peptide chain release factor 3  56.73 
 
 		 526 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000115855  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4609  peptide chain release factor 3  56.66 
 
 		 529 aa  627  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00121865  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3504  peptide chain release factor 3  56.93 
 
 		 529 aa  625  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4918  peptide chain release factor 3  56.66 
 
 		 529 aa  627  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100391  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002625  peptide chain release factor 3  56.85 
 
 		 529 aa  625  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4971  peptide chain release factor 3  56.66 
 
 		 529 aa  627  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00185733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5887  peptide chain release factor 3  56.66 
 
 		 529 aa  627  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.397514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4974  peptide chain release factor 3  56.66 
 
 		 529 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.219451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2046  peptide chain release factor 3  56.55 
 
 		 531 aa  624  1e-177  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.840556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4881  peptide chain release factor 3  56.66 
 
 		 529 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180345  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4813  peptide chain release factor 3  56.66 
 
 		 529 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4287  peptide chain release factor 3  58.43 
 
 		 533 aa  621  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4968  peptide chain release factor 3  56.66 
 
 		 529 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0384  peptide chain release factor 3  57.31 
 
 		 526 aa  622  1e-177  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  58.27 
 
 		 528 aa  623  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>