More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0609 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0609  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 520 aa  1080    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00905219  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0772  peptide chain release factor 3  63.37 
 
 		 514 aa  668    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00659018  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1037  peptide chain release factor 3  93.65 
 
 		 520 aa  1019    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00273811  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1018  peptide chain release factor 3  93.65 
 
 		 520 aa  1019    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0165348  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1351  peptide chain release factor 3  61.42 
 
 		 525 aa  669    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000276996  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0395  peptide chain release factor 3  62.36 
 
 		 523 aa  679    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.118943  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1532  peptide chain release factor 3  63.18 
 
 		 514 aa  665    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1365  peptide chain release factor 3  57.69 
 
 		 522 aa  634  1e-180  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000156295  hitchhiker  0.000000502816 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0140  peptide chain release factor 3  58.25 
 
 		 503 aa  631  1e-180  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1267  peptide chain release factor 3  58 
 
 		 504 aa  617  1e-175  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.551841  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0780  peptide chain release factor 3  52.44 
 
 		 543 aa  547  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.474397  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1434  peptide chain release factor 3  52.48 
 
 		 539 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0328  peptide chain release factor 3  51.54 
 
 		 533 aa  534  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0398  peptide chain release factor 3  50.67 
 
 		 532 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0592  peptide chain release factor 3  51.75 
 
 		 531 aa  523  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0581  peptide chain release factor 3  51.75 
 
 		 531 aa  523  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0116263  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3254  peptide chain release factor 3  49.23 
 
 		 529 aa  510  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000111312  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3872  peptide chain release factor 3  49.43 
 
 		 531 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3596  peptide chain release factor 3  51.47 
 
 		 529 aa  504  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.750333  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2904  peptide chain release factor 3  48.85 
 
 		 542 aa  502  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835611  normal  0.0349958 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3761  peptide chain release factor 3  49.43 
 
 		 531 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.106529 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0935  peptide chain release factor 3  48.94 
 
 		 526 aa  498  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1490  peptide chain release factor 3  49.71 
 
 		 535 aa  500  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000251643  hitchhiker  0.00000000120572 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1662  peptide chain release factor 3  48.47 
 
 		 533 aa  497  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.828617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  48.6 
 
 		 542 aa  498  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2365  peptide chain release factor 3  47.33 
 
 		 556 aa  496  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.100255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  48.75 
 
 		 524 aa  495  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4686  peptide chain release factor 3  46.89 
 
 		 542 aa  492  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0905  peptide chain release factor 3  48.57 
 
 		 526 aa  494  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  48.66 
 
 		 531 aa  494  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  52.4 
 
 		 528 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1843  peptide chain release factor 3  46.98 
 
 		 540 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1279  peptide chain release factor 3  48.1 
 
 		 548 aa  494  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0970  peptide chain release factor 3  48.29 
 
 		 524 aa  494  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00550606  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1999  peptide chain release factor 3  49.51 
 
 		 539 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2024  peptide chain release factor 3  49.32 
 
 		 539 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1056  peptide chain release factor 3  48.24 
 
 		 542 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448459 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1358  peptide chain release factor 3  47.06 
 
 		 528 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1393  peptide chain release factor 3  48.54 
 
 		 524 aa  495  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263078  normal  0.346403 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0414  peptide chain release factor 3  49.14 
 
 		 531 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3935  peptide chain release factor 3  48.27 
 
 		 526 aa  489  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07201  peptide chain release factor 3  47.73 
 
 		 555 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.577625  normal  0.0107792 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4549  peptide chain release factor 3  47.17 
 
 		 563 aa  488  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0095  peptide chain release factor 3  47.73 
 
 		 555 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0968  peptide chain release factor 3  48.68 
 
 		 543 aa  490  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1821  peptide chain release factor 3  48.02 
 
 		 536 aa  489  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3858  peptide chain release factor 3  47.06 
 
 		 547 aa  489  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  47.25 
 
 		 528 aa  489  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2474  peptide chain release factor 3  46.4 
 
 		 526 aa  488  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1990  peptide chain release factor 3  48.57 
 
 		 526 aa  486  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0015  peptide chain release factor 3  48.36 
 
 		 517 aa  488  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0617  peptide chain release factor 3  46.53 
 
 		 541 aa  487  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3649  peptide chain release factor 3  49.32 
 
 		 528 aa  485  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0596  peptide chain release factor 3  46.34 
 
 		 541 aa  486  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0435  peptide chain release factor 3  47.62 
 
 		 531 aa  486  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0645  peptide chain release factor 3  46.7 
 
 		 543 aa  487  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.563471  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5926  peptide chain release factor 3  46.34 
 
 		 565 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07181  peptide chain release factor 3  48.47 
 
 		 545 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.55147  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3554  peptide chain release factor 3  47.14 
 
 		 526 aa  484  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.93604  decreased coverage  0.000001078 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  48.94 
 
 		 524 aa  482  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02787  peptide chain release factor 3  47.91 
 
 		 529 aa  483  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3298  peptide chain release factor 3  46.5 
 
 		 540 aa  483  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0130  peptide chain release factor 3  46.82 
 
 		 534 aa  482  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.174893  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4287  peptide chain release factor 3  52.03 
 
 		 533 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4062  peptide chain release factor 3  46.9 
 
 		 542 aa  483  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1011  peptide chain release factor 3  48.57 
 
 		 528 aa  485  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2519  peptide chain release factor 3  51.59 
 
 		 527 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2968  peptide chain release factor 3  51.91 
 
 		 533 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.720802 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03381  peptide chain release factor 3  47.7 
 
 		 529 aa  483  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0147  peptide chain release factor 3  46.82 
 
 		 534 aa  483  1e-135  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0806  peptide chain release factor 3  48.24 
 
 		 528 aa  484  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0794725  hitchhiker  0.00323143 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6925  peptide chain release factor 3  52.23 
 
 		 533 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.209121  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4019  peptide chain release factor 3  49.21 
 
 		 526 aa  485  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5160199999999995e-20 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07161  peptide chain release factor 3  48.46 
 
 		 545 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.651427  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01678  peptide chain release factor 3  46.08 
 
 		 534 aa  481  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790822  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0205  peptide chain release factor 3  47.3 
 
 		 526 aa  479  1e-134  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07361  peptide chain release factor 3  47.08 
 
 		 545 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.301095  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0657  peptide chain release factor 3  46.15 
 
 		 540 aa  478  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0802538 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5334  peptide chain release factor 3  48.01 
 
 		 533 aa  481  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490929  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1135  peptide chain release factor 3  46.86 
 
 		 526 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000115855  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0968  peptide chain release factor 3  48.3 
 
 		 528 aa  481  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.463155  decreased coverage  0.000218803 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0663  peptide chain release factor 3  48.26 
 
 		 545 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.635496  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3808  peptide chain release factor 3  46.11 
 
 		 538 aa  480  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5808  peptide chain release factor 3  47.71 
 
 		 530 aa  481  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3235  peptide chain release factor 3  47.04 
 
 		 523 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.458258  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3382  peptide chain release factor 3  47.14 
 
 		 526 aa  480  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00211559  hitchhiker  0.00272137 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3371  peptide chain release factor 3  47.23 
 
 		 523 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0198312  hitchhiker  0.00795059 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3219  peptide chain release factor 3  46.55 
 
 		 538 aa  478  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.76683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3232  peptide chain release factor 3  46.86 
 
 		 526 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0110977  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3633  peptide chain release factor 3  50.21 
 
 		 529 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2819  peptide chain release factor 3  50 
 
 		 528 aa  477  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0266  peptide chain release factor 3  49.58 
 
 		 529 aa  477  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.580519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3053  peptide chain release factor 3  46.26 
 
 		 534 aa  475  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0147  peptide chain release factor 3  46.95 
 
 		 535 aa  478  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4412  peptide chain release factor 3  47.88 
 
 		 527 aa  477  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000888652  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1033  peptide chain release factor 3  46.29 
 
 		 526 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00526307  hitchhiker  0.0000000642839 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1098  peptide chain release factor 3  46.29 
 
 		 526 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00192369  unclonable  0.0000319314 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0837  peptide chain release factor 3  50.21 
 
 		 529 aa  476  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3053  peptide chain release factor 3  46.95 
 
 		 526 aa  476  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00432214  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1037  peptide chain release factor 3  46.1 
 
 		 526 aa  475  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00294724  unclonable  0.000000000176372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>