More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1056 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1999  peptide chain release factor 3  78.92 
 
 		 539 aa  900    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07361  peptide chain release factor 3  65.66 
 
 		 545 aa  747    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.301095  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07181  peptide chain release factor 3  66.54 
 
 		 545 aa  749    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.55147  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0095  peptide chain release factor 3  66.97 
 
 		 555 aa  769    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3298  peptide chain release factor 3  83.7 
 
 		 540 aa  949    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1198  peptide chain release factor 3  70.11 
 
 		 548 aa  780    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1279  peptide chain release factor 3  70.32 
 
 		 548 aa  796    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2024  peptide chain release factor 3  78.92 
 
 		 539 aa  899    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07201  peptide chain release factor 3  66.97 
 
 		 555 aa  769    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.577625  normal  0.0107792 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0663  peptide chain release factor 3  66.79 
 
 		 545 aa  739    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.635496  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2365  peptide chain release factor 3  76.44 
 
 		 556 aa  885    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.100255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4549  peptide chain release factor 3  82.9 
 
 		 563 aa  929    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1843  peptide chain release factor 3  79.78 
 
 		 540 aa  912    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07161  peptide chain release factor 3  67.17 
 
 		 545 aa  750    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.651427  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14191  peptide chain release factor 3  69.52 
 
 		 571 aa  762    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07731  peptide chain release factor 3  68.04 
 
 		 555 aa  768    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2904  peptide chain release factor 3  79.7 
 
 		 542 aa  937    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835611  normal  0.0349958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1056  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 542 aa  1119    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448459 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27956  predicted protein  54.98 
 
 		 634 aa  589  1e-167  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0592  peptide chain release factor 3  53.42 
 
 		 531 aa  590  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0581  peptide chain release factor 3  53.42 
 
 		 531 aa  590  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0116263  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0780  peptide chain release factor 3  54.49 
 
 		 543 aa  580  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.474397  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1434  peptide chain release factor 3  52.93 
 
 		 539 aa  581  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0328  peptide chain release factor 3  53.03 
 
 		 533 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3596  peptide chain release factor 3  52.9 
 
 		 529 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.750333  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2700  peptide chain release factor 3  49.65 
 
 		 583 aa  564  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0398  peptide chain release factor 3  53.06 
 
 		 532 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3254  peptide chain release factor 3  51.75 
 
 		 529 aa  552  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000111312  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1704  peptide chain release factor 3  49.91 
 
 		 542 aa  538  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1492  peptide chain release factor 3  52.02 
 
 		 567 aa  536  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1764  peptide chain release factor 3  48.39 
 
 		 541 aa  524  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1844  peptide chain release factor 3  48.39 
 
 		 541 aa  525  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1351  peptide chain release factor 3  49.72 
 
 		 525 aa  522  1e-147  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000276996  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1990  peptide chain release factor 3  50.1 
 
 		 526 aa  521  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2112  peptide chain release factor 3  48.02 
 
 		 541 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1490  peptide chain release factor 3  49.24 
 
 		 535 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000251643  hitchhiker  0.00000000120572 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0935  peptide chain release factor 3  53.21 
 
 		 526 aa  513  1e-144  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  50.49 
 
 		 528 aa  513  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0905  peptide chain release factor 3  52.56 
 
 		 526 aa  508  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0435  peptide chain release factor 3  48.76 
 
 		 531 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01678  peptide chain release factor 3  51.59 
 
 		 534 aa  505  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790822  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  52.22 
 
 		 542 aa  505  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  51.92 
 
 		 530 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0882  peptide chain release factor 3  51.05 
 
 		 527 aa  504  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0205  peptide chain release factor 3  46.81 
 
 		 526 aa  499  1e-140  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3053  peptide chain release factor 3  48 
 
 		 534 aa  499  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  48.75 
 
 		 524 aa  499  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  52.41 
 
 		 531 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  48.55 
 
 		 528 aa  499  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3935  peptide chain release factor 3  51.06 
 
 		 526 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1018  peptide chain release factor 3  48.34 
 
 		 520 aa  496  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0165348  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1037  peptide chain release factor 3  48.34 
 
 		 520 aa  496  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00273811  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0414  peptide chain release factor 3  49.14 
 
 		 531 aa  496  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1365  peptide chain release factor 3  48.3 
 
 		 522 aa  496  1e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000156295  hitchhiker  0.000000502816 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0609  peptide chain release factor 3  48.24 
 
 		 520 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00905219  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2819  peptide chain release factor 3  47.6 
 
 		 528 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  47.22 
 
 		 524 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3219  peptide chain release factor 3  51.04 
 
 		 538 aa  492  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.76683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4019  peptide chain release factor 3  50.85 
 
 		 526 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5160199999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0147  peptide chain release factor 3  50.74 
 
 		 534 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0395  peptide chain release factor 3  47.05 
 
 		 523 aa  493  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.118943  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1267  peptide chain release factor 3  47.61 
 
 		 504 aa  491  9.999999999999999e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.551841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0130  peptide chain release factor 3  50.74 
 
 		 534 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.174893  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3761  peptide chain release factor 3  50.63 
 
 		 531 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.106529 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3649  peptide chain release factor 3  47.81 
 
 		 528 aa  489  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0970  peptide chain release factor 3  50.85 
 
 		 524 aa  490  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00550606  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3872  peptide chain release factor 3  50.63 
 
 		 531 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1393  peptide chain release factor 3  50.43 
 
 		 524 aa  491  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263078  normal  0.346403 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13410  peptide chain release factor 3  51.5 
 
 		 527 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.898041  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0138  peptide chain release factor 3  49.47 
 
 		 526 aa  488  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0147  peptide chain release factor 3  48.48 
 
 		 535 aa  486  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1118  peptide chain release factor 3  45.02 
 
 		 531 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950984  normal  0.664681 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2497  peptide chain release factor 3  48.16 
 
 		 530 aa  486  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3808  peptide chain release factor 3  50.42 
 
 		 538 aa  486  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1828  peptide chain release factor 3  49.16 
 
 		 544 aa  487  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1202  peptide chain release factor 3  51.71 
 
 		 527 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2092  peptide chain release factor 3  46.93 
 
 		 528 aa  486  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1678  peptide chain release factor 3  47.87 
 
 		 533 aa  487  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0068133  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2514  peptide chain release factor 3  50 
 
 		 539 aa  484  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0772  peptide chain release factor 3  47.79 
 
 		 514 aa  483  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00659018  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0613  peptide chain release factor 3  50.21 
 
 		 526 aa  484  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3504  peptide chain release factor 3  50.42 
 
 		 529 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0837  peptide chain release factor 3  50.42 
 
 		 529 aa  484  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3633  peptide chain release factor 3  50.42 
 
 		 529 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0792  peptide chain release factor 3  51.28 
 
 		 527 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4412  peptide chain release factor 3  50.11 
 
 		 527 aa  484  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000888652  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1821  peptide chain release factor 3  49.79 
 
 		 536 aa  484  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2144  peptide chain release factor 3  50 
 
 		 539 aa  484  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.280372  hitchhiker  0.00257154 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0652  peptide chain release factor 3  50.63 
 
 		 529 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4306  peptide chain release factor 3  51.07 
 
 		 527 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.546945  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1662  peptide chain release factor 3  50.21 
 
 		 533 aa  480  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.828617  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00010  peptide chain release factor 3  45.14 
 
 		 533 aa  480  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.417378  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0877  peptide chain release factor 3  50.21 
 
 		 525 aa  479  1e-134  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0806  peptide chain release factor 3  49.47 
 
 		 528 aa  480  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0794725  hitchhiker  0.00323143 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0266  peptide chain release factor 3  47.54 
 
 		 529 aa  481  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.580519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0807  peptide chain release factor 3  51.17 
 
 		 527 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.986611  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0192  peptide chain release factor 3  45.95 
 
 		 527 aa  481  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1140  peptide chain release factor 3  50.21 
 
 		 525 aa  479  1e-134  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4201  peptide chain release factor 3  45.11 
 
 		 526 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.159171  normal  0.787104 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1532  peptide chain release factor 3  47.98 
 
 		 514 aa  479  1e-134  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>