More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2112 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_1704  peptide chain release factor 3  85.13 
 
 		 542 aa  946    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2112  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 541 aa  1100    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1844  peptide chain release factor 3  99.26 
 
 		 541 aa  1094    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1764  peptide chain release factor 3  98.71 
 
 		 541 aa  1089    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0328  peptide chain release factor 3  51.69 
 
 		 533 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1434  peptide chain release factor 3  50.19 
 
 		 539 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0592  peptide chain release factor 3  50.95 
 
 		 531 aa  558  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0581  peptide chain release factor 3  50.95 
 
 		 531 aa  558  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0116263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0398  peptide chain release factor 3  51.61 
 
 		 532 aa  552  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3596  peptide chain release factor 3  50.29 
 
 		 529 aa  548  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.750333  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0780  peptide chain release factor 3  52.37 
 
 		 543 aa  548  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.474397  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1843  peptide chain release factor 3  48.48 
 
 		 540 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0882  peptide chain release factor 3  48.61 
 
 		 527 aa  533  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0138  peptide chain release factor 3  53.77 
 
 		 526 aa  528  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1999  peptide chain release factor 3  48.67 
 
 		 539 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2024  peptide chain release factor 3  48.86 
 
 		 539 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1393  peptide chain release factor 3  53.7 
 
 		 524 aa  530  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263078  normal  0.346403 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1990  peptide chain release factor 3  51.33 
 
 		 526 aa  526  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0192  peptide chain release factor 3  53.14 
 
 		 527 aa  526  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  50.66 
 
 		 524 aa  528  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2904  peptide chain release factor 3  48.48 
 
 		 542 aa  526  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835611  normal  0.0349958 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  51.52 
 
 		 530 aa  528  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3254  peptide chain release factor 3  48.58 
 
 		 529 aa  525  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000111312  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  50.47 
 
 		 524 aa  523  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0095  peptide chain release factor 3  50.19 
 
 		 555 aa  524  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07201  peptide chain release factor 3  50.19 
 
 		 555 aa  524  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.577625  normal  0.0107792 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4412  peptide chain release factor 3  53.05 
 
 		 527 aa  522  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000888652  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1662  peptide chain release factor 3  50.19 
 
 		 533 aa  518  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.828617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0435  peptide chain release factor 3  48.96 
 
 		 531 aa  521  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3761  peptide chain release factor 3  50.94 
 
 		 531 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.106529 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07181  peptide chain release factor 3  50.98 
 
 		 545 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.55147  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01678  peptide chain release factor 3  49.35 
 
 		 534 aa  518  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790822  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1279  peptide chain release factor 3  50.19 
 
 		 548 aa  519  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3872  peptide chain release factor 3  50.94 
 
 		 531 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1056  peptide chain release factor 3  48.02 
 
 		 542 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448459 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07731  peptide chain release factor 3  48.87 
 
 		 555 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107568 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07161  peptide chain release factor 3  50.98 
 
 		 545 aa  518  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.651427  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3053  peptide chain release factor 3  49.91 
 
 		 534 aa  516  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  51.97 
 
 		 542 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  48.86 
 
 		 531 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07361  peptide chain release factor 3  50.59 
 
 		 545 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.301095  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5808  peptide chain release factor 3  50 
 
 		 530 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1821  peptide chain release factor 3  50 
 
 		 536 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0266  peptide chain release factor 3  50.09 
 
 		 529 aa  511  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.580519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3298  peptide chain release factor 3  47.46 
 
 		 540 aa  512  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4019  peptide chain release factor 3  48.65 
 
 		 526 aa  514  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5160199999999995e-20 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2474  peptide chain release factor 3  49.53 
 
 		 526 aa  512  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3649  peptide chain release factor 3  49.81 
 
 		 528 aa  514  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2365  peptide chain release factor 3  49.43 
 
 		 556 aa  514  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.100255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3935  peptide chain release factor 3  50.41 
 
 		 526 aa  513  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  48.79 
 
 		 528 aa  513  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0935  peptide chain release factor 3  47.92 
 
 		 526 aa  509  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  49.34 
 
 		 528 aa  510  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0663  peptide chain release factor 3  50.68 
 
 		 545 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.635496  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1828  peptide chain release factor 3  52.06 
 
 		 544 aa  509  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0414  peptide chain release factor 3  48.41 
 
 		 531 aa  511  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04250  peptide chain release factor 3  48.2 
 
 		 529 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.631503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3624  peptide chain release factor 3  48.2 
 
 		 529 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0877  peptide chain release factor 3  50.93 
 
 		 525 aa  506  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4922  peptide chain release factor 3  48.2 
 
 		 529 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.55632  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0905  peptide chain release factor 3  47.74 
 
 		 526 aa  507  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5334  peptide chain release factor 3  48.79 
 
 		 533 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490929  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04216  hypothetical protein  48.2 
 
 		 529 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.659942  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5887  peptide chain release factor 3  48.2 
 
 		 529 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.397514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1198  peptide chain release factor 3  51.33 
 
 		 548 aa  508  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3682  peptide chain release factor 3  48.2 
 
 		 529 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.297475  hitchhiker  0.00075439 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4181  peptide chain release factor 3  49.91 
 
 		 539 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1140  peptide chain release factor 3  50.93 
 
 		 525 aa  506  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4918  peptide chain release factor 3  48.2 
 
 		 529 aa  505  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100391  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0130  peptide chain release factor 3  49.62 
 
 		 534 aa  507  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.174893  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1358  peptide chain release factor 3  48.2 
 
 		 528 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0147  peptide chain release factor 3  49.81 
 
 		 534 aa  507  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2820  peptide chain release factor 3  51.97 
 
 		 526 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0200081  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4971  peptide chain release factor 3  48.2 
 
 		 529 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00185733  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2819  peptide chain release factor 3  49.16 
 
 		 528 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4609  peptide chain release factor 3  48.2 
 
 		 529 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00121865  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2372  peptide chain release factor 3  50.38 
 
 		 529 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0205  peptide chain release factor 3  46.12 
 
 		 526 aa  501  1e-141  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1490  peptide chain release factor 3  48.02 
 
 		 535 aa  503  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000251643  hitchhiker  0.00000000120572 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4549  peptide chain release factor 3  47.73 
 
 		 563 aa  504  1e-141  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2700  peptide chain release factor 3  45.83 
 
 		 583 aa  504  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3808  peptide chain release factor 3  48.59 
 
 		 538 aa  503  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3371  peptide chain release factor 3  52.17 
 
 		 523 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0198312  hitchhiker  0.00795059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5122  peptide chain release factor 3  46.42 
 
 		 531 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.535643  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5540  peptide chain release factor 3  49.34 
 
 		 537 aa  501  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.073692  normal  0.0734795 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1279  peptide chain release factor 3  45.76 
 
 		 529 aa  499  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2307  peptide chain release factor 3  49.34 
 
 		 540 aa  500  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452357  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3053  peptide chain release factor 3  51.14 
 
 		 526 aa  498  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00432214  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1579  peptide chain release factor 3  45.56 
 
 		 529 aa  500  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3586  peptide chain release factor 3  48.3 
 
 		 529 aa  499  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3554  peptide chain release factor 3  51.35 
 
 		 526 aa  498  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.93604  decreased coverage  0.000001078 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1135  peptide chain release factor 3  51.35 
 
 		 526 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000115855  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1492  peptide chain release factor 3  49.81 
 
 		 567 aa  499  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2827  peptide chain release factor 3  51.97 
 
 		 526 aa  501  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000333993  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1033  peptide chain release factor 3  51.97 
 
 		 526 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00526307  hitchhiker  0.0000000642839 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1098  peptide chain release factor 3  51.97 
 
 		 526 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00192369  unclonable  0.0000319314 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3232  peptide chain release factor 3  51.76 
 
 		 526 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0110977  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0791  peptide chain release factor 3  44.99 
 
 		 530 aa  500  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3235  peptide chain release factor 3  51.97 
 
 		 523 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.458258  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14191  peptide chain release factor 3  51.23 
 
 		 571 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>