More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1492 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1492  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 567 aa  1166    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0780  peptide chain release factor 3  53.53 
 
 		 543 aa  548  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.474397  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2365  peptide chain release factor 3  51.71 
 
 		 556 aa  540  9.999999999999999e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.100255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3298  peptide chain release factor 3  51.15 
 
 		 540 aa  537  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1056  peptide chain release factor 3  52.02 
 
 		 542 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2904  peptide chain release factor 3  50.86 
 
 		 542 aa  537  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835611  normal  0.0349958 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3254  peptide chain release factor 3  49.81 
 
 		 529 aa  527  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000111312  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0592  peptide chain release factor 3  50.38 
 
 		 531 aa  527  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0581  peptide chain release factor 3  50.38 
 
 		 531 aa  527  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0116263  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4549  peptide chain release factor 3  50.28 
 
 		 563 aa  525  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1843  peptide chain release factor 3  49.62 
 
 		 540 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1704  peptide chain release factor 3  51.33 
 
 		 542 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1434  peptide chain release factor 3  49.14 
 
 		 539 aa  513  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157478  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0095  peptide chain release factor 3  50.1 
 
 		 555 aa  515  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1279  peptide chain release factor 3  51.45 
 
 		 548 aa  514  1e-144  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1490  peptide chain release factor 3  50.38 
 
 		 535 aa  512  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000251643  hitchhiker  0.00000000120572 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07201  peptide chain release factor 3  50.1 
 
 		 555 aa  515  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.577625  normal  0.0107792 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0398  peptide chain release factor 3  48.29 
 
 		 532 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1198  peptide chain release factor 3  52.12 
 
 		 548 aa  510  1e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0328  peptide chain release factor 3  48.96 
 
 		 533 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3596  peptide chain release factor 3  49.7 
 
 		 529 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.750333  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1999  peptide chain release factor 3  48.65 
 
 		 539 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1828  peptide chain release factor 3  49.15 
 
 		 544 aa  507  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2024  peptide chain release factor 3  48.65 
 
 		 539 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0882  peptide chain release factor 3  50.19 
 
 		 527 aa  502  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0192  peptide chain release factor 3  49.9 
 
 		 527 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1990  peptide chain release factor 3  50.1 
 
 		 526 aa  500  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2112  peptide chain release factor 3  49.81 
 
 		 541 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1844  peptide chain release factor 3  49.81 
 
 		 541 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1764  peptide chain release factor 3  50 
 
 		 541 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07731  peptide chain release factor 3  49.62 
 
 		 555 aa  498  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107568 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0138  peptide chain release factor 3  49.52 
 
 		 526 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0435  peptide chain release factor 3  47.98 
 
 		 531 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  49.81 
 
 		 542 aa  495  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1021  peptide chain release factor 3  48.64 
 
 		 527 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000101004  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2827  peptide chain release factor 3  48.84 
 
 		 526 aa  489  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000333993  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  49.81 
 
 		 530 aa  491  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3466  peptide chain release factor 3  49.42 
 
 		 529 aa  489  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  49.22 
 
 		 528 aa  490  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3649  peptide chain release factor 3  49.03 
 
 		 528 aa  489  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  50 
 
 		 531 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07181  peptide chain release factor 3  47.96 
 
 		 545 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.55147  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0414  peptide chain release factor 3  49.43 
 
 		 531 aa  488  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3235  peptide chain release factor 3  48.64 
 
 		 523 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.458258  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3371  peptide chain release factor 3  48.45 
 
 		 523 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0198312  hitchhiker  0.00795059 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3232  peptide chain release factor 3  48.45 
 
 		 526 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0110977  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2092  peptide chain release factor 3  48.28 
 
 		 528 aa  485  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3586  peptide chain release factor 3  48.56 
 
 		 529 aa  485  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07161  peptide chain release factor 3  47.77 
 
 		 545 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.651427  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0652  peptide chain release factor 3  48.75 
 
 		 529 aa  488  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  49.43 
 
 		 528 aa  486  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1037  peptide chain release factor 3  48.45 
 
 		 526 aa  485  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00294724  unclonable  0.000000000176372 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04250  peptide chain release factor 3  48.55 
 
 		 529 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.631503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3624  peptide chain release factor 3  48.55 
 
 		 529 aa  484  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4609  peptide chain release factor 3  48.36 
 
 		 529 aa  483  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00121865  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4881  peptide chain release factor 3  48.55 
 
 		 529 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180345  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0968  peptide chain release factor 3  48.26 
 
 		 528 aa  484  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.463155  decreased coverage  0.000218803 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3682  peptide chain release factor 3  48.36 
 
 		 529 aa  483  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.297475  hitchhiker  0.00075439 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2474  peptide chain release factor 3  47.31 
 
 		 526 aa  484  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4971  peptide chain release factor 3  48.36 
 
 		 529 aa  483  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00185733  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0453  peptide chain release factor 3  48.37 
 
 		 529 aa  482  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.267512  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4974  peptide chain release factor 3  48.55 
 
 		 529 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.219451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1011  peptide chain release factor 3  49.52 
 
 		 528 aa  483  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1821  peptide chain release factor 3  47.58 
 
 		 536 aa  482  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0970  peptide chain release factor 3  47.78 
 
 		 524 aa  484  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00550606  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4916  peptide chain release factor 3  48.55 
 
 		 529 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.996004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2497  peptide chain release factor 3  48.27 
 
 		 530 aa  483  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5887  peptide chain release factor 3  48.55 
 
 		 529 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.397514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2519  peptide chain release factor 3  49.51 
 
 		 527 aa  485  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4968  peptide chain release factor 3  48.55 
 
 		 529 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1135  peptide chain release factor 3  48.26 
 
 		 526 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000115855  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4813  peptide chain release factor 3  48.55 
 
 		 529 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1358  peptide chain release factor 3  48.28 
 
 		 528 aa  485  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04216  hypothetical protein  48.55 
 
 		 529 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.659942  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1033  peptide chain release factor 3  48.45 
 
 		 526 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00526307  hitchhiker  0.0000000642839 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1098  peptide chain release factor 3  48.45 
 
 		 526 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00192369  unclonable  0.0000319314 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4922  peptide chain release factor 3  48.55 
 
 		 529 aa  484  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.55632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4918  peptide chain release factor 3  48.36 
 
 		 529 aa  483  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100391  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07361  peptide chain release factor 3  47.65 
 
 		 545 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.301095  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2820  peptide chain release factor 3  48.45 
 
 		 526 aa  482  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0200081  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3504  peptide chain release factor 3  48.64 
 
 		 529 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2700  peptide chain release factor 3  44.21 
 
 		 583 aa  479  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2514  peptide chain release factor 3  49.9 
 
 		 539 aa  480  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02787  peptide chain release factor 3  47.5 
 
 		 529 aa  479  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0837  peptide chain release factor 3  48.64 
 
 		 529 aa  479  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3633  peptide chain release factor 3  48.64 
 
 		 529 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3016  peptide chain release factor 3  47.01 
 
 		 530 aa  479  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0663  peptide chain release factor 3  47.57 
 
 		 545 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.635496  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2144  peptide chain release factor 3  49.9 
 
 		 539 aa  480  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.280372  hitchhiker  0.00257154 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3159  peptide chain release factor 3  48.04 
 
 		 541 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0551  peptide chain release factor 3  48.28 
 
 		 529 aa  479  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2819  peptide chain release factor 3  49.71 
 
 		 528 aa  481  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03381  peptide chain release factor 3  47.49 
 
 		 529 aa  481  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0997  peptide chain release factor 3  47.48 
 
 		 526 aa  482  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0156098  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0534  peptide chain release factor 3  47.78 
 
 		 529 aa  479  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.319663  hitchhiker  0.0098421 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2527  peptide chain release factor 3  47.99 
 
 		 541 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0244653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3382  peptide chain release factor 3  47.67 
 
 		 526 aa  479  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00211559  hitchhiker  0.00272137 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1365  peptide chain release factor 3  46.18 
 
 		 522 aa  480  1e-134  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000156295  hitchhiker  0.000000502816 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2027  peptide chain release factor 3  48.86 
 
 		 539 aa  475  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3053  peptide chain release factor 3  47.48 
 
 		 526 aa  478  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00432214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>