More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0780 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0328  peptide chain release factor 3  61.01 
 
 		 533 aa  643    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0780  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 543 aa  1119    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.474397  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3254  peptide chain release factor 3  58.7 
 
 		 529 aa  623  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000111312  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0398  peptide chain release factor 3  59.61 
 
 		 532 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1434  peptide chain release factor 3  58.14 
 
 		 539 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0592  peptide chain release factor 3  56.42 
 
 		 531 aa  596  1e-169  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0581  peptide chain release factor 3  56.42 
 
 		 531 aa  596  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0116263  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3298  peptide chain release factor 3  55.95 
 
 		 540 aa  585  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2904  peptide chain release factor 3  53.77 
 
 		 542 aa  583  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835611  normal  0.0349958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1056  peptide chain release factor 3  54.49 
 
 		 542 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448459 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3596  peptide chain release factor 3  52.83 
 
 		 529 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.750333  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1843  peptide chain release factor 3  53.58 
 
 		 540 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4549  peptide chain release factor 3  54.14 
 
 		 563 aa  572  1.0000000000000001e-162  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2365  peptide chain release factor 3  53.67 
 
 		 556 aa  567  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.100255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1999  peptide chain release factor 3  53.49 
 
 		 539 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2024  peptide chain release factor 3  53.49 
 
 		 539 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07361  peptide chain release factor 3  53.2 
 
 		 545 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.301095  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1351  peptide chain release factor 3  54.3 
 
 		 525 aa  558  1e-158  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000276996  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1704  peptide chain release factor 3  53.13 
 
 		 542 aa  554  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07161  peptide chain release factor 3  52.82 
 
 		 545 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.651427  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07181  peptide chain release factor 3  52.82 
 
 		 545 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.55147  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0663  peptide chain release factor 3  52.62 
 
 		 545 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.635496  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1018  peptide chain release factor 3  53 
 
 		 520 aa  551  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0165348  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1764  peptide chain release factor 3  52.56 
 
 		 541 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1844  peptide chain release factor 3  52.56 
 
 		 541 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1037  peptide chain release factor 3  53 
 
 		 520 aa  551  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00273811  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1365  peptide chain release factor 3  53.31 
 
 		 522 aa  550  1e-155  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000156295  hitchhiker  0.000000502816 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0609  peptide chain release factor 3  52.44 
 
 		 520 aa  547  1e-154  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00905219  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2112  peptide chain release factor 3  52.37 
 
 		 541 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0414  peptide chain release factor 3  54.16 
 
 		 531 aa  546  1e-154  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1492  peptide chain release factor 3  53.53 
 
 		 567 aa  548  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01678  peptide chain release factor 3  53.05 
 
 		 534 aa  543  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790822  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07201  peptide chain release factor 3  52.32 
 
 		 555 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.577625  normal  0.0107792 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  53.23 
 
 		 524 aa  538  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0095  peptide chain release factor 3  52.32 
 
 		 555 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3053  peptide chain release factor 3  52.67 
 
 		 534 aa  540  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1279  peptide chain release factor 3  52.91 
 
 		 548 aa  539  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  53.09 
 
 		 524 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0435  peptide chain release factor 3  52.02 
 
 		 531 aa  537  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0395  peptide chain release factor 3  52.92 
 
 		 523 aa  536  1e-151  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.118943  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  53.1 
 
 		 528 aa  537  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07731  peptide chain release factor 3  52.25 
 
 		 555 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107568 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5808  peptide chain release factor 3  51.63 
 
 		 530 aa  531  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0140  peptide chain release factor 3  51.95 
 
 		 503 aa  533  1e-150  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1990  peptide chain release factor 3  51.84 
 
 		 526 aa  530  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0772  peptide chain release factor 3  53.1 
 
 		 514 aa  530  1e-149  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00659018  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0905  peptide chain release factor 3  54.04 
 
 		 526 aa  528  1e-149  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  52.42 
 
 		 528 aa  530  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1198  peptide chain release factor 3  53.85 
 
 		 548 aa  529  1e-149  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0192  peptide chain release factor 3  52.23 
 
 		 527 aa  529  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  52.61 
 
 		 530 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0882  peptide chain release factor 3  51.06 
 
 		 527 aa  531  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0935  peptide chain release factor 3  50.48 
 
 		 526 aa  527  1e-148  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  51.63 
 
 		 531 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1821  peptide chain release factor 3  51.34 
 
 		 536 aa  528  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1490  peptide chain release factor 3  52.32 
 
 		 535 aa  526  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000251643  hitchhiker  0.00000000120572 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0138  peptide chain release factor 3  51.84 
 
 		 526 aa  525  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1662  peptide chain release factor 3  52.68 
 
 		 533 aa  523  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.828617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  51.56 
 
 		 542 aa  522  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0147  peptide chain release factor 3  51.93 
 
 		 534 aa  522  1e-147  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3649  peptide chain release factor 3  52.23 
 
 		 528 aa  523  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0147  peptide chain release factor 3  52.43 
 
 		 535 aa  522  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0130  peptide chain release factor 3  51.84 
 
 		 534 aa  523  1e-147  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.174893  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1267  peptide chain release factor 3  50.58 
 
 		 504 aa  524  1e-147  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.551841  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1532  peptide chain release factor 3  52.13 
 
 		 514 aa  523  1e-147  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14191  peptide chain release factor 3  53.28 
 
 		 571 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4019  peptide chain release factor 3  51.46 
 
 		 526 aa  520  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5160199999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5334  peptide chain release factor 3  51.99 
 
 		 533 aa  521  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490929  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3761  peptide chain release factor 3  51.35 
 
 		 531 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.106529 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3935  peptide chain release factor 3  51.46 
 
 		 526 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3872  peptide chain release factor 3  51.35 
 
 		 531 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2514  peptide chain release factor 3  50.66 
 
 		 539 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2144  peptide chain release factor 3  50.66 
 
 		 539 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.280372  hitchhiker  0.00257154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4412  peptide chain release factor 3  51.97 
 
 		 527 aa  514  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000888652  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0791  peptide chain release factor 3  47.62 
 
 		 530 aa  513  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3808  peptide chain release factor 3  51.46 
 
 		 538 aa  512  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1828  peptide chain release factor 3  50.1 
 
 		 544 aa  509  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5540  peptide chain release factor 3  50.1 
 
 		 537 aa  508  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.073692  normal  0.0734795 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1393  peptide chain release factor 3  51.74 
 
 		 524 aa  511  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263078  normal  0.346403 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0877  peptide chain release factor 3  49.9 
 
 		 525 aa  508  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0205  peptide chain release factor 3  50.39 
 
 		 526 aa  507  9.999999999999999e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2819  peptide chain release factor 3  50.19 
 
 		 528 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2046  peptide chain release factor 3  48.88 
 
 		 531 aa  505  9.999999999999999e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.840556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1140  peptide chain release factor 3  49.9 
 
 		 525 aa  508  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0806  peptide chain release factor 3  49.03 
 
 		 528 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0794725  hitchhiker  0.00323143 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0754  peptide chain release factor 3  50.57 
 
 		 549 aa  505  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.852788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2700  peptide chain release factor 3  46.86 
 
 		 583 aa  506  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0384  peptide chain release factor 3  52.3 
 
 		 526 aa  506  9.999999999999999e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04250  peptide chain release factor 3  48.75 
 
 		 529 aa  501  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.631503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3624  peptide chain release factor 3  48.75 
 
 		 529 aa  501  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4974  peptide chain release factor 3  49.52 
 
 		 529 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.219451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3219  peptide chain release factor 3  50.29 
 
 		 538 aa  504  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.76683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5887  peptide chain release factor 3  48.75 
 
 		 529 aa  501  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.397514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04216  hypothetical protein  48.75 
 
 		 529 aa  501  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.659942  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4922  peptide chain release factor 3  48.75 
 
 		 529 aa  501  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.55632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4971  peptide chain release factor 3  48.75 
 
 		 529 aa  502  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00185733  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4881  peptide chain release factor 3  49.52 
 
 		 529 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180345  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3682  peptide chain release factor 3  48.75 
 
 		 529 aa  502  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.297475  hitchhiker  0.00075439 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1011  peptide chain release factor 3  48.96 
 
 		 528 aa  504  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1678  peptide chain release factor 3  51.07 
 
 		 533 aa  503  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0068133  normal  0.55837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>