More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1351 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1018  peptide chain release factor 3  62 
 
 		 520 aa  676    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0165348  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0609  peptide chain release factor 3  61.42 
 
 		 520 aa  669    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00905219  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0772  peptide chain release factor 3  68.27 
 
 		 514 aa  716    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00659018  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1037  peptide chain release factor 3  62 
 
 		 520 aa  676    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00273811  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0395  peptide chain release factor 3  69.19 
 
 		 523 aa  752    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.118943  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1267  peptide chain release factor 3  65.64 
 
 		 504 aa  698    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.551841  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1365  peptide chain release factor 3  72.17 
 
 		 522 aa  788    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000156295  hitchhiker  0.000000502816 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0140  peptide chain release factor 3  66.6 
 
 		 503 aa  709    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1532  peptide chain release factor 3  69.23 
 
 		 514 aa  729    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1351  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 525 aa  1089    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000276996  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0780  peptide chain release factor 3  54.3 
 
 		 543 aa  558  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.474397  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1434  peptide chain release factor 3  51.05 
 
 		 539 aa  535  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0328  peptide chain release factor 3  50.76 
 
 		 533 aa  533  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2904  peptide chain release factor 3  51.52 
 
 		 542 aa  531  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835611  normal  0.0349958 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1843  peptide chain release factor 3  50.66 
 
 		 540 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3298  peptide chain release factor 3  49.72 
 
 		 540 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4549  peptide chain release factor 3  49.81 
 
 		 563 aa  528  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0592  peptide chain release factor 3  50.28 
 
 		 531 aa  526  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0581  peptide chain release factor 3  50.28 
 
 		 531 aa  526  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0116263  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1056  peptide chain release factor 3  49.72 
 
 		 542 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448459 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1999  peptide chain release factor 3  49.72 
 
 		 539 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2024  peptide chain release factor 3  49.53 
 
 		 539 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1279  peptide chain release factor 3  50.57 
 
 		 548 aa  515  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2365  peptide chain release factor 3  48.86 
 
 		 556 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.100255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0398  peptide chain release factor 3  50.58 
 
 		 532 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3254  peptide chain release factor 3  50 
 
 		 529 aa  514  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000111312  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1490  peptide chain release factor 3  48.67 
 
 		 535 aa  510  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000251643  hitchhiker  0.00000000120572 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3596  peptide chain release factor 3  51.08 
 
 		 529 aa  508  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.750333  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  49.52 
 
 		 528 aa  507  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2474  peptide chain release factor 3  50.48 
 
 		 526 aa  503  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  48.02 
 
 		 542 aa  503  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1704  peptide chain release factor 3  48.57 
 
 		 542 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07361  peptide chain release factor 3  48.76 
 
 		 545 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.301095  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1198  peptide chain release factor 3  50.29 
 
 		 548 aa  499  1e-140  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07181  peptide chain release factor 3  49.71 
 
 		 545 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.55147  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  49.15 
 
 		 531 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07161  peptide chain release factor 3  49.9 
 
 		 545 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.651427  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1990  peptide chain release factor 3  47.72 
 
 		 526 aa  497  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1764  peptide chain release factor 3  46.68 
 
 		 541 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0663  peptide chain release factor 3  49.23 
 
 		 545 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.635496  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1844  peptide chain release factor 3  46.68 
 
 		 541 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1033  peptide chain release factor 3  49.23 
 
 		 526 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00526307  hitchhiker  0.0000000642839 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1098  peptide chain release factor 3  49.23 
 
 		 526 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00192369  unclonable  0.0000319314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1037  peptide chain release factor 3  49.04 
 
 		 526 aa  495  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00294724  unclonable  0.000000000176372 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02787  peptide chain release factor 3  49.06 
 
 		 529 aa  494  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0935  peptide chain release factor 3  47.79 
 
 		 526 aa  492  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0905  peptide chain release factor 3  48.08 
 
 		 526 aa  492  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  48.68 
 
 		 524 aa  494  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0095  peptide chain release factor 3  48.08 
 
 		 555 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  49.61 
 
 		 528 aa  492  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3633  peptide chain release factor 3  49.15 
 
 		 529 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0837  peptide chain release factor 3  49.15 
 
 		 529 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07731  peptide chain release factor 3  48.02 
 
 		 555 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107568 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0147  peptide chain release factor 3  48.02 
 
 		 535 aa  494  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2827  peptide chain release factor 3  49.23 
 
 		 526 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000333993  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07201  peptide chain release factor 3  48.08 
 
 		 555 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.577625  normal  0.0107792 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3371  peptide chain release factor 3  49.23 
 
 		 523 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0198312  hitchhiker  0.00795059 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3504  peptide chain release factor 3  49.15 
 
 		 529 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3232  peptide chain release factor 3  49.04 
 
 		 526 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0110977  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1135  peptide chain release factor 3  49.04 
 
 		 526 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000115855  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3382  peptide chain release factor 3  48.85 
 
 		 526 aa  490  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00211559  hitchhiker  0.00272137 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2112  peptide chain release factor 3  46.49 
 
 		 541 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3235  peptide chain release factor 3  49.04 
 
 		 523 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.458258  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  47.33 
 
 		 530 aa  490  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0435  peptide chain release factor 3  47.57 
 
 		 531 aa  491  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2820  peptide chain release factor 3  48.46 
 
 		 526 aa  489  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0200081  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0414  peptide chain release factor 3  48.94 
 
 		 531 aa  490  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3053  peptide chain release factor 3  48.85 
 
 		 526 aa  488  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00432214  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2144  peptide chain release factor 3  48.18 
 
 		 539 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.280372  hitchhiker  0.00257154 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2514  peptide chain release factor 3  48.18 
 
 		 539 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0970  peptide chain release factor 3  47.31 
 
 		 524 aa  486  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00550606  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3554  peptide chain release factor 3  48.56 
 
 		 526 aa  485  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.93604  decreased coverage  0.000001078 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2819  peptide chain release factor 3  51.92 
 
 		 528 aa  488  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2519  peptide chain release factor 3  47.06 
 
 		 527 aa  487  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1358  peptide chain release factor 3  47.92 
 
 		 528 aa  486  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3586  peptide chain release factor 3  48.39 
 
 		 529 aa  487  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0997  peptide chain release factor 3  48.85 
 
 		 526 aa  487  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0156098  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0652  peptide chain release factor 3  47.63 
 
 		 529 aa  485  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14191  peptide chain release factor 3  49.24 
 
 		 571 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3219  peptide chain release factor 3  46.05 
 
 		 538 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.76683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3466  peptide chain release factor 3  48.02 
 
 		 529 aa  484  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3808  peptide chain release factor 3  45.82 
 
 		 538 aa  482  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1828  peptide chain release factor 3  45.95 
 
 		 544 aa  484  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5808  peptide chain release factor 3  45.99 
 
 		 530 aa  484  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1011  peptide chain release factor 3  46.31 
 
 		 528 aa  485  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0384  peptide chain release factor 3  47.69 
 
 		 526 aa  484  1e-135  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0882  peptide chain release factor 3  50.96 
 
 		 527 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0806  peptide chain release factor 3  46.87 
 
 		 528 aa  484  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0794725  hitchhiker  0.00323143 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3624  peptide chain release factor 3  47.26 
 
 		 529 aa  480  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5887  peptide chain release factor 3  47.26 
 
 		 529 aa  480  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.397514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4918  peptide chain release factor 3  47.26 
 
 		 529 aa  480  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100391  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4971  peptide chain release factor 3  47.26 
 
 		 529 aa  480  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00185733  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5334  peptide chain release factor 3  46.59 
 
 		 533 aa  479  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490929  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3649  peptide chain release factor 3  48 
 
 		 528 aa  481  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1140  peptide chain release factor 3  50.85 
 
 		 525 aa  478  1e-134  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01678  peptide chain release factor 3  46.54 
 
 		 534 aa  478  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790822  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4922  peptide chain release factor 3  47.26 
 
 		 529 aa  480  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.55632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  46.8 
 
 		 524 aa  480  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4609  peptide chain release factor 3  47.26 
 
 		 529 aa  480  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00121865  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4881  peptide chain release factor 3  47.26 
 
 		 529 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>