More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1198 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_4549  peptide chain release factor 3  69.53 
 
 		 563 aa  772    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07181  peptide chain release factor 3  77.2 
 
 		 545 aa  862    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.55147  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14191  peptide chain release factor 3  85.56 
 
 		 571 aa  931    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0095  peptide chain release factor 3  82.16 
 
 		 555 aa  927    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3298  peptide chain release factor 3  68.6 
 
 		 540 aa  769    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1198  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 548 aa  1121    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2024  peptide chain release factor 3  71.54 
 
 		 539 aa  807    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1279  peptide chain release factor 3  90.33 
 
 		 548 aa  1035    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07201  peptide chain release factor 3  82.16 
 
 		 555 aa  927    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.577625  normal  0.0107792 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0663  peptide chain release factor 3  77.2 
 
 		 545 aa  852    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.635496  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2365  peptide chain release factor 3  73.84 
 
 		 556 aa  827    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.100255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1056  peptide chain release factor 3  70.11 
 
 		 542 aa  796    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448459 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1999  peptide chain release factor 3  71.54 
 
 		 539 aa  807    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07731  peptide chain release factor 3  80.11 
 
 		 555 aa  909    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2904  peptide chain release factor 3  69.56 
 
 		 542 aa  804    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835611  normal  0.0349958 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07161  peptide chain release factor 3  77.01 
 
 		 545 aa  859    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.651427  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07361  peptide chain release factor 3  75.18 
 
 		 545 aa  871    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.301095  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1843  peptide chain release factor 3  70.5 
 
 		 540 aa  814    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27956  predicted protein  54.73 
 
 		 634 aa  584  1.0000000000000001e-165  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0592  peptide chain release factor 3  52.48 
 
 		 531 aa  568  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0581  peptide chain release factor 3  52.48 
 
 		 531 aa  568  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0116263  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3596  peptide chain release factor 3  52.55 
 
 		 529 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.750333  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0328  peptide chain release factor 3  51.89 
 
 		 533 aa  560  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1434  peptide chain release factor 3  51.23 
 
 		 539 aa  558  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0780  peptide chain release factor 3  53.85 
 
 		 543 aa  545  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.474397  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2700  peptide chain release factor 3  49.74 
 
 		 583 aa  539  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0398  peptide chain release factor 3  53.91 
 
 		 532 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1704  peptide chain release factor 3  53.2 
 
 		 542 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3254  peptide chain release factor 3  50.96 
 
 		 529 aa  531  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000111312  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1844  peptide chain release factor 3  51.33 
 
 		 541 aa  525  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1764  peptide chain release factor 3  51.52 
 
 		 541 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2112  peptide chain release factor 3  51.33 
 
 		 541 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1492  peptide chain release factor 3  52.12 
 
 		 567 aa  521  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1351  peptide chain release factor 3  50.29 
 
 		 525 aa  516  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000276996  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0882  peptide chain release factor 3  49.8 
 
 		 527 aa  499  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1018  peptide chain release factor 3  48.82 
 
 		 520 aa  488  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0165348  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1037  peptide chain release factor 3  48.82 
 
 		 520 aa  488  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00273811  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1490  peptide chain release factor 3  48.03 
 
 		 535 aa  488  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000251643  hitchhiker  0.00000000120572 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  49.61 
 
 		 528 aa  485  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0138  peptide chain release factor 3  48.42 
 
 		 526 aa  484  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0609  peptide chain release factor 3  48.43 
 
 		 520 aa  484  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00905219  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0772  peptide chain release factor 3  48.95 
 
 		 514 aa  484  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00659018  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  49.52 
 
 		 524 aa  484  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4019  peptide chain release factor 3  49.01 
 
 		 526 aa  482  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5160199999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0192  peptide chain release factor 3  48.05 
 
 		 527 aa  483  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3935  peptide chain release factor 3  48.81 
 
 		 526 aa  482  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2144  peptide chain release factor 3  49.15 
 
 		 539 aa  484  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.280372  hitchhiker  0.00257154 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0140  peptide chain release factor 3  47.61 
 
 		 503 aa  484  1e-135  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2514  peptide chain release factor 3  49.15 
 
 		 539 aa  484  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  48.36 
 
 		 524 aa  479  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2819  peptide chain release factor 3  47.32 
 
 		 528 aa  479  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5127  peptide chain release factor 3  47.67 
 
 		 521 aa  479  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.166056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1532  peptide chain release factor 3  48.37 
 
 		 514 aa  480  1e-134  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0147  peptide chain release factor 3  52.79 
 
 		 534 aa  475  1e-133  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0414  peptide chain release factor 3  48.75 
 
 		 531 aa  477  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01678  peptide chain release factor 3  51.06 
 
 		 534 aa  475  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790822  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3219  peptide chain release factor 3  48.28 
 
 		 538 aa  475  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.76683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1828  peptide chain release factor 3  46.74 
 
 		 544 aa  477  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3053  peptide chain release factor 3  50.74 
 
 		 534 aa  476  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3016  peptide chain release factor 3  46.86 
 
 		 530 aa  475  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2092  peptide chain release factor 3  47.78 
 
 		 528 aa  478  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0395  peptide chain release factor 3  47.32 
 
 		 523 aa  476  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.118943  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1267  peptide chain release factor 3  46.69 
 
 		 504 aa  475  1e-133  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.551841  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1678  peptide chain release factor 3  47.21 
 
 		 533 aa  478  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0068133  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0130  peptide chain release factor 3  52.79 
 
 		 534 aa  474  1e-132  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.174893  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3504  peptide chain release factor 3  51.37 
 
 		 529 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0935  peptide chain release factor 3  46.82 
 
 		 526 aa  473  1e-132  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  51.68 
 
 		 531 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0837  peptide chain release factor 3  51.37 
 
 		 529 aa  473  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  48.77 
 
 		 528 aa  474  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3808  peptide chain release factor 3  48.66 
 
 		 538 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0652  peptide chain release factor 3  48.17 
 
 		 529 aa  472  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3633  peptide chain release factor 3  51.37 
 
 		 529 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4411  peptide chain release factor 3  48.92 
 
 		 541 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1579  peptide chain release factor 3  45.57 
 
 		 529 aa  474  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1135  peptide chain release factor 3  47.01 
 
 		 526 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000115855  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3212  peptide chain release factor 3  47.08 
 
 		 538 aa  470  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714231  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0359  peptide chain release factor 3  48.28 
 
 		 542 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0792  peptide chain release factor 3  49.68 
 
 		 527 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0968  peptide chain release factor 3  50.7 
 
 		 543 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4412  peptide chain release factor 3  46.67 
 
 		 527 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000888652  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3232  peptide chain release factor 3  47.31 
 
 		 526 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0110977  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2827  peptide chain release factor 3  47.49 
 
 		 526 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000333993  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3235  peptide chain release factor 3  46.92 
 
 		 523 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.458258  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2646  peptide chain release factor 3  47.49 
 
 		 535 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1021  peptide chain release factor 3  47.4 
 
 		 527 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000101004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1592  peptide chain release factor 3  48.44 
 
 		 527 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  50.97 
 
 		 530 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0968  peptide chain release factor 3  46.02 
 
 		 528 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.463155  decreased coverage  0.000218803 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1990  peptide chain release factor 3  47.88 
 
 		 526 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4579  peptide chain release factor 3  49.79 
 
 		 527 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  50.53 
 
 		 542 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0807  peptide chain release factor 3  49.48 
 
 		 527 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.986611  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0970  peptide chain release factor 3  46.63 
 
 		 524 aa  465  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00550606  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03381  peptide chain release factor 3  46.81 
 
 		 529 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13410  peptide chain release factor 3  49.89 
 
 		 527 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.898041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1365  peptide chain release factor 3  47.08 
 
 		 522 aa  467  9.999999999999999e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000156295  hitchhiker  0.000000502816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1037  peptide chain release factor 3  47.31 
 
 		 526 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00294724  unclonable  0.000000000176372 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3371  peptide chain release factor 3  46.82 
 
 		 523 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0198312  hitchhiker  0.00795059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2307  peptide chain release factor 3  47.89 
 
 		 540 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>