More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2307 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1193  peptide chain release factor 3  77.04 
 
 		 525 aa  816    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0369  peptide chain release factor 3  70.31 
 
 		 527 aa  746    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3016  peptide chain release factor 3  78.29 
 
 		 530 aa  825    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1063  peptide chain release factor 3  74.33 
 
 		 525 aa  801    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438262  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2527  peptide chain release factor 3  69.83 
 
 		 541 aa  747    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0244653  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1002  peptide chain release factor 3  70.72 
 
 		 504 aa  755    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2027  peptide chain release factor 3  69.3 
 
 		 539 aa  747    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4347  peptide chain release factor 3  70.31 
 
 		 527 aa  754    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433833  normal  0.342451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4375  peptide chain release factor 3  87.78 
 
 		 539 aa  973    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.607928  normal  0.322908 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4612  peptide chain release factor 3  70.11 
 
 		 527 aa  753    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472275  normal  0.461934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3801  peptide chain release factor 3  61.97 
 
 		 527 aa  638    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal  0.0495277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3762  peptide chain release factor 3  68.2 
 
 		 539 aa  739    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0113142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1321  peptide chain release factor 3  74.14 
 
 		 525 aa  800    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2092  peptide chain release factor 3  59.96 
 
 		 528 aa  637    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1359  peptide chain release factor 3  70.11 
 
 		 525 aa  749    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2307  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 540 aa  1093    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452357  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3159  peptide chain release factor 3  69.26 
 
 		 541 aa  743    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4851  peptide chain release factor 3  87.78 
 
 		 539 aa  973    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.354411 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2944  peptide chain release factor 3  68.76 
 
 		 539 aa  741    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0217278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4181  peptide chain release factor 3  94.42 
 
 		 539 aa  1035    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2337  peptide chain release factor 3  68.77 
 
 		 541 aa  743    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.707548  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1680  peptide chain release factor 3  70.94 
 
 		 539 aa  754    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0890826  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0417  peptide chain release factor 3  63.21 
 
 		 527 aa  653    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317239 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4059  peptide chain release factor 3  75.76 
 
 		 532 aa  801    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3555  peptide chain release factor 3  72.8 
 
 		 527 aa  771    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4261  peptide chain release factor 3  87.41 
 
 		 539 aa  969    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.3422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1678  peptide chain release factor 3  59.39 
 
 		 533 aa  636    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0068133  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5540  peptide chain release factor 3  87.22 
 
 		 537 aa  964    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.073692  normal  0.0734795 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5127  peptide chain release factor 3  60 
 
 		 521 aa  615  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.166056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0698  peptide chain release factor 3  60.19 
 
 		 526 aa  618  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.286373  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2497  peptide chain release factor 3  58.21 
 
 		 530 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0882  peptide chain release factor 3  57.58 
 
 		 558 aa  595  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168442 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0690  peptide chain release factor 3  58.91 
 
 		 507 aa  581  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217398  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0754  peptide chain release factor 3  58.63 
 
 		 549 aa  578  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.852788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2646  peptide chain release factor 3  57.96 
 
 		 535 aa  580  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2537  peptide chain release factor 3  54.44 
 
 		 534 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478101  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1807  peptide chain release factor 3  54.61 
 
 		 562 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0541486 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1196  peptide chain release factor 3  54.44 
 
 		 534 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.101228 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0968  peptide chain release factor 3  53.93 
 
 		 543 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1203  peptide chain release factor 3  55.37 
 
 		 545 aa  573  1.0000000000000001e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.949342 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2330  peptide chain release factor 3  52.95 
 
 		 535 aa  569  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1490  peptide chain release factor 3  52.39 
 
 		 535 aa  568  1e-161  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000251643  hitchhiker  0.00000000120572 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1336  peptide chain release factor 3  54.62 
 
 		 535 aa  568  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0751595 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1986  peptide chain release factor 3  54.25 
 
 		 534 aa  570  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.339407 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1990  peptide chain release factor 3  53.85 
 
 		 526 aa  565  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0922  peptide chain release factor 3  54.65 
 
 		 531 aa  567  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.763827  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0414  peptide chain release factor 3  52.87 
 
 		 531 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  52.69 
 
 		 524 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1821  peptide chain release factor 3  52.22 
 
 		 536 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1393  peptide chain release factor 3  53.93 
 
 		 524 aa  560  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263078  normal  0.346403 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2144  peptide chain release factor 3  51.49 
 
 		 539 aa  556  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.280372  hitchhiker  0.00257154 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2514  peptide chain release factor 3  51.49 
 
 		 539 aa  556  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  53.36 
 
 		 524 aa  555  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0909  peptide chain release factor 3  54.33 
 
 		 542 aa  558  1e-157  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.212809  normal  0.0162662 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3858  peptide chain release factor 3  51.2 
 
 		 547 aa  554  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1662  peptide chain release factor 3  52.76 
 
 		 533 aa  555  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.828617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  51.52 
 
 		 531 aa  554  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0970  peptide chain release factor 3  52.22 
 
 		 524 aa  555  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00550606  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5808  peptide chain release factor 3  52.67 
 
 		 530 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4287  peptide chain release factor 3  52.46 
 
 		 533 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01678  peptide chain release factor 3  52.17 
 
 		 534 aa  551  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790822  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002625  peptide chain release factor 3  53.17 
 
 		 529 aa  553  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6925  peptide chain release factor 3  52.38 
 
 		 533 aa  549  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.209121  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5334  peptide chain release factor 3  51.99 
 
 		 533 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490929  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  51.63 
 
 		 530 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2968  peptide chain release factor 3  52.57 
 
 		 533 aa  551  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.720802 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1245  peptide chain release factor 3  54.58 
 
 		 533 aa  550  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236346  normal  0.0221222 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03381  peptide chain release factor 3  52.98 
 
 		 529 aa  547  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4019  peptide chain release factor 3  50.87 
 
 		 526 aa  545  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5160199999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  51.15 
 
 		 528 aa  547  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0015  peptide chain release factor 3  53.46 
 
 		 517 aa  545  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2519  peptide chain release factor 3  52.4 
 
 		 527 aa  545  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  52.69 
 
 		 528 aa  547  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0138  peptide chain release factor 3  51.82 
 
 		 526 aa  543  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0837  peptide chain release factor 3  51.63 
 
 		 529 aa  543  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3872  peptide chain release factor 3  52.47 
 
 		 531 aa  544  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0192  peptide chain release factor 3  51.33 
 
 		 527 aa  541  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3761  peptide chain release factor 3  52.47 
 
 		 531 aa  544  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.106529 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0147  peptide chain release factor 3  51.73 
 
 		 535 aa  544  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3808  peptide chain release factor 3  50.57 
 
 		 538 aa  541  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3504  peptide chain release factor 3  51.63 
 
 		 529 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3633  peptide chain release factor 3  51.63 
 
 		 529 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2474  peptide chain release factor 3  52.77 
 
 		 526 aa  542  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3935  peptide chain release factor 3  50.67 
 
 		 526 aa  543  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0882  peptide chain release factor 3  50.1 
 
 		 527 aa  545  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4579  peptide chain release factor 3  50.66 
 
 		 527 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4253  peptide chain release factor 3  50.09 
 
 		 527 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.995333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  50.29 
 
 		 542 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0190  peptide chain release factor 3  51.58 
 
 		 531 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1828  peptide chain release factor 3  50.28 
 
 		 544 aa  540  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0266  peptide chain release factor 3  51.44 
 
 		 529 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.580519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0384  peptide chain release factor 3  51.34 
 
 		 526 aa  540  9.999999999999999e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0806  peptide chain release factor 3  51.24 
 
 		 528 aa  540  9.999999999999999e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0794725  hitchhiker  0.00323143 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04250  peptide chain release factor 3  51.25 
 
 		 529 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.631503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3624  peptide chain release factor 3  51.25 
 
 		 529 aa  535  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4609  peptide chain release factor 3  51.25 
 
 		 529 aa  536  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00121865  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0807  peptide chain release factor 3  49.35 
 
 		 527 aa  535  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.986611  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4974  peptide chain release factor 3  51.25 
 
 		 529 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.219451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4971  peptide chain release factor 3  51.25 
 
 		 529 aa  536  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00185733  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4881  peptide chain release factor 3  51.25 
 
 		 529 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>