More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4347 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4851  peptide chain release factor 3  68.63 
 
 		 539 aa  739    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.354411 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1063  peptide chain release factor 3  76.85 
 
 		 525 aa  832    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4181  peptide chain release factor 3  70.21 
 
 		 539 aa  756    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4375  peptide chain release factor 3  68.63 
 
 		 539 aa  739    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.607928  normal  0.322908 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2307  peptide chain release factor 3  70.31 
 
 		 540 aa  754    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452357  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2027  peptide chain release factor 3  66.86 
 
 		 539 aa  711    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0369  peptide chain release factor 3  89.75 
 
 		 527 aa  988    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4347  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 527 aa  1081    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433833  normal  0.342451 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5540  peptide chain release factor 3  70.69 
 
 		 537 aa  756    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.073692  normal  0.0734795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3016  peptide chain release factor 3  68.7 
 
 		 530 aa  734    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1359  peptide chain release factor 3  73.84 
 
 		 525 aa  800    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1002  peptide chain release factor 3  72.76 
 
 		 504 aa  779    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2527  peptide chain release factor 3  66.92 
 
 		 541 aa  711    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0244653  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1321  peptide chain release factor 3  76.11 
 
 		 525 aa  830    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3555  peptide chain release factor 3  88.24 
 
 		 527 aa  977    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3159  peptide chain release factor 3  67.88 
 
 		 541 aa  721    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2944  peptide chain release factor 3  67.3 
 
 		 539 aa  716    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0217278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2337  peptide chain release factor 3  67.12 
 
 		 541 aa  714    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.707548  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0417  peptide chain release factor 3  62.96 
 
 		 527 aa  661    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317239 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1680  peptide chain release factor 3  67.44 
 
 		 539 aa  716    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0890826  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1193  peptide chain release factor 3  69.23 
 
 		 525 aa  735    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4059  peptide chain release factor 3  77.82 
 
 		 532 aa  855    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4612  peptide chain release factor 3  98.86 
 
 		 527 aa  1073    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472275  normal  0.461934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3762  peptide chain release factor 3  66.86 
 
 		 539 aa  710    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0113142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4261  peptide chain release factor 3  69.77 
 
 		 539 aa  743    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.3422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2092  peptide chain release factor 3  55.95 
 
 		 528 aa  604  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0698  peptide chain release factor 3  58.15 
 
 		 526 aa  601  1.0000000000000001e-171  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.286373  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0882  peptide chain release factor 3  56.74 
 
 		 558 aa  589  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3801  peptide chain release factor 3  55.21 
 
 		 527 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal  0.0495277 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2497  peptide chain release factor 3  54.17 
 
 		 530 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5127  peptide chain release factor 3  55.3 
 
 		 521 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.166056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1678  peptide chain release factor 3  52.96 
 
 		 533 aa  577  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0068133  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2537  peptide chain release factor 3  53.7 
 
 		 534 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478101  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1196  peptide chain release factor 3  53.7 
 
 		 534 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.101228 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1986  peptide chain release factor 3  53.32 
 
 		 534 aa  569  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.339407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1245  peptide chain release factor 3  56.39 
 
 		 533 aa  565  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236346  normal  0.0221222 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0754  peptide chain release factor 3  56.08 
 
 		 549 aa  567  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.852788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0922  peptide chain release factor 3  53.33 
 
 		 531 aa  565  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.763827  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0690  peptide chain release factor 3  55.97 
 
 		 507 aa  561  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217398  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2646  peptide chain release factor 3  55.11 
 
 		 535 aa  561  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1807  peptide chain release factor 3  52.2 
 
 		 562 aa  553  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0541486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4306  peptide chain release factor 3  50.66 
 
 		 527 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.546945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0909  peptide chain release factor 3  53.75 
 
 		 542 aa  548  1e-154  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.212809  normal  0.0162662 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1336  peptide chain release factor 3  51.33 
 
 		 535 aa  545  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0751595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12250  peptide chain release factor 3  51.24 
 
 		 527 aa  542  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.882878  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0872  peptide chain release factor 3  49.72 
 
 		 527 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0916  peptide chain release factor 3  49.91 
 
 		 527 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0920838  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0902  peptide chain release factor 3  49.72 
 
 		 541 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.779467  normal  0.296207 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1203  peptide chain release factor 3  50.76 
 
 		 545 aa  541  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.949342 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2514  peptide chain release factor 3  50.95 
 
 		 539 aa  537  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4253  peptide chain release factor 3  49.44 
 
 		 527 aa  538  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.995333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0807  peptide chain release factor 3  49.53 
 
 		 527 aa  537  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.986611  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2144  peptide chain release factor 3  50.95 
 
 		 539 aa  537  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.280372  hitchhiker  0.00257154 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0792  peptide chain release factor 3  49.15 
 
 		 527 aa  535  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  51.24 
 
 		 530 aa  538  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4579  peptide chain release factor 3  49.44 
 
 		 527 aa  534  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  49.62 
 
 		 542 aa  532  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0970  peptide chain release factor 3  50.19 
 
 		 524 aa  531  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00550606  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1011  peptide chain release factor 3  49.34 
 
 		 528 aa  533  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  49.15 
 
 		 531 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13410  peptide chain release factor 3  49.53 
 
 		 527 aa  534  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.898041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0968  peptide chain release factor 3  50.67 
 
 		 543 aa  530  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5808  peptide chain release factor 3  49.15 
 
 		 530 aa  529  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1393  peptide chain release factor 3  51.15 
 
 		 524 aa  530  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263078  normal  0.346403 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1202  peptide chain release factor 3  48.96 
 
 		 527 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1990  peptide chain release factor 3  50 
 
 		 526 aa  525  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  49.71 
 
 		 524 aa  528  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1821  peptide chain release factor 3  49.43 
 
 		 536 aa  528  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5334  peptide chain release factor 3  48.23 
 
 		 533 aa  522  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490929  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03381  peptide chain release factor 3  50.29 
 
 		 529 aa  523  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3808  peptide chain release factor 3  48.86 
 
 		 538 aa  521  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002625  peptide chain release factor 3  50.38 
 
 		 529 aa  524  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3858  peptide chain release factor 3  48.85 
 
 		 547 aa  522  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1662  peptide chain release factor 3  49.25 
 
 		 533 aa  520  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.828617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2046  peptide chain release factor 3  48.67 
 
 		 531 aa  520  1e-146  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.840556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3872  peptide chain release factor 3  49.15 
 
 		 531 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2519  peptide chain release factor 3  48.87 
 
 		 527 aa  519  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3761  peptide chain release factor 3  49.15 
 
 		 531 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.106529 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3682  peptide chain release factor 3  48.76 
 
 		 529 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.297475  hitchhiker  0.00075439 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4609  peptide chain release factor 3  48.76 
 
 		 529 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00121865  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2330  peptide chain release factor 3  49.24 
 
 		 535 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3219  peptide chain release factor 3  48.67 
 
 		 538 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.76683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3053  peptide chain release factor 3  49.53 
 
 		 534 aa  515  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4918  peptide chain release factor 3  48.76 
 
 		 529 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100391  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0190  peptide chain release factor 3  49.81 
 
 		 531 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0384  peptide chain release factor 3  47.72 
 
 		 526 aa  515  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4971  peptide chain release factor 3  48.76 
 
 		 529 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00185733  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0414  peptide chain release factor 3  49.23 
 
 		 531 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0147  peptide chain release factor 3  49.52 
 
 		 535 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04250  peptide chain release factor 3  48.76 
 
 		 529 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.631503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3624  peptide chain release factor 3  48.76 
 
 		 529 aa  514  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0877  peptide chain release factor 3  48.49 
 
 		 525 aa  514  1e-144  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5887  peptide chain release factor 3  48.76 
 
 		 529 aa  514  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.397514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0015  peptide chain release factor 3  50.58 
 
 		 517 aa  513  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1490  peptide chain release factor 3  48.22 
 
 		 535 aa  512  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000251643  hitchhiker  0.00000000120572 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01678  peptide chain release factor 3  48.77 
 
 		 534 aa  512  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790822  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0905  peptide chain release factor 3  48.85 
 
 		 526 aa  513  1e-144  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  48.85 
 
 		 524 aa  514  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1140  peptide chain release factor 3  48.49 
 
 		 525 aa  514  1e-144  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  50.29 
 
 		 528 aa  514  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>