More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5540 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3016  peptide chain release factor 3  77.1 
 
 		 530 aa  825    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5540  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 537 aa  1092    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.073692  normal  0.0734795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3762  peptide chain release factor 3  68.96 
 
 		 539 aa  744    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0113142  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1063  peptide chain release factor 3  73.57 
 
 		 525 aa  799    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438262  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0417  peptide chain release factor 3  63.58 
 
 		 527 aa  655    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317239 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3555  peptide chain release factor 3  73.18 
 
 		 527 aa  781    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0369  peptide chain release factor 3  70.31 
 
 		 527 aa  749    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2027  peptide chain release factor 3  70.69 
 
 		 539 aa  757    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1002  peptide chain release factor 3  69.96 
 
 		 504 aa  753    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1321  peptide chain release factor 3  73.95 
 
 		 525 aa  796    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3801  peptide chain release factor 3  61.58 
 
 		 527 aa  640    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal  0.0495277 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1359  peptide chain release factor 3  69.54 
 
 		 525 aa  751    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1193  peptide chain release factor 3  76.91 
 
 		 525 aa  826    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2092  peptide chain release factor 3  59.96 
 
 		 528 aa  640    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4261  peptide chain release factor 3  90.72 
 
 		 539 aa  1001    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.3422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4851  peptide chain release factor 3  89.8 
 
 		 539 aa  999    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.354411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3159  peptide chain release factor 3  69.64 
 
 		 541 aa  743    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2944  peptide chain release factor 3  68.96 
 
 		 539 aa  739    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0217278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2337  peptide chain release factor 3  69.04 
 
 		 541 aa  743    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.707548  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1680  peptide chain release factor 3  71.06 
 
 		 539 aa  764    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0890826  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4059  peptide chain release factor 3  74.24 
 
 		 532 aa  800    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4181  peptide chain release factor 3  87.43 
 
 		 539 aa  964    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2307  peptide chain release factor 3  87.22 
 
 		 540 aa  964    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452357  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4612  peptide chain release factor 3  70.5 
 
 		 527 aa  756    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472275  normal  0.461934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4375  peptide chain release factor 3  89.8 
 
 		 539 aa  999    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.607928  normal  0.322908 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2527  peptide chain release factor 3  69.64 
 
 		 541 aa  743    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0244653  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1678  peptide chain release factor 3  60.15 
 
 		 533 aa  647    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0068133  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4347  peptide chain release factor 3  70.69 
 
 		 527 aa  756    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433833  normal  0.342451 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5127  peptide chain release factor 3  60 
 
 		 521 aa  627  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.166056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0698  peptide chain release factor 3  59.58 
 
 		 526 aa  624  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.286373  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2497  peptide chain release factor 3  57.36 
 
 		 530 aa  610  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0882  peptide chain release factor 3  57.04 
 
 		 558 aa  601  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168442 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0690  peptide chain release factor 3  59.5 
 
 		 507 aa  597  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217398  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0754  peptide chain release factor 3  58.95 
 
 		 549 aa  597  1e-169  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.852788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2646  peptide chain release factor 3  57.17 
 
 		 535 aa  588  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1490  peptide chain release factor 3  53.35 
 
 		 535 aa  578  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000251643  hitchhiker  0.00000000120572 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0968  peptide chain release factor 3  54.32 
 
 		 543 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2537  peptide chain release factor 3  53.56 
 
 		 534 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478101  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1203  peptide chain release factor 3  53.54 
 
 		 545 aa  575  1.0000000000000001e-163  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.949342 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1986  peptide chain release factor 3  53.75 
 
 		 534 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.339407 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0922  peptide chain release factor 3  54.84 
 
 		 531 aa  575  1.0000000000000001e-163  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.763827  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1196  peptide chain release factor 3  53.56 
 
 		 534 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.101228 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1807  peptide chain release factor 3  53.83 
 
 		 562 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0541486 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1990  peptide chain release factor 3  53.85 
 
 		 526 aa  571  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3858  peptide chain release factor 3  50.92 
 
 		 547 aa  570  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  53.27 
 
 		 524 aa  569  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  53.28 
 
 		 524 aa  569  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5808  peptide chain release factor 3  53.24 
 
 		 530 aa  568  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1336  peptide chain release factor 3  53.93 
 
 		 535 aa  565  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0751595 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0970  peptide chain release factor 3  53.07 
 
 		 524 aa  565  1e-160  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00550606  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2330  peptide chain release factor 3  51.81 
 
 		 535 aa  565  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0414  peptide chain release factor 3  52.44 
 
 		 531 aa  565  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1393  peptide chain release factor 3  54.51 
 
 		 524 aa  568  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263078  normal  0.346403 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5334  peptide chain release factor 3  52.56 
 
 		 533 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490929  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002625  peptide chain release factor 3  53.74 
 
 		 529 aa  560  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1828  peptide chain release factor 3  52.9 
 
 		 544 aa  559  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0384  peptide chain release factor 3  52.67 
 
 		 526 aa  560  1e-158  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2514  peptide chain release factor 3  52.2 
 
 		 539 aa  555  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03381  peptide chain release factor 3  53.74 
 
 		 529 aa  557  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0190  peptide chain release factor 3  53.36 
 
 		 531 aa  557  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0147  peptide chain release factor 3  52 
 
 		 535 aa  555  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1821  peptide chain release factor 3  52.02 
 
 		 536 aa  556  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0909  peptide chain release factor 3  55.51 
 
 		 542 aa  556  1e-157  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.212809  normal  0.0162662 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4287  peptide chain release factor 3  52.4 
 
 		 533 aa  555  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2144  peptide chain release factor 3  52.2 
 
 		 539 aa  555  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.280372  hitchhiker  0.00257154 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  51.7 
 
 		 531 aa  557  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1662  peptide chain release factor 3  52.57 
 
 		 533 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.828617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3053  peptide chain release factor 3  52.56 
 
 		 534 aa  551  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6925  peptide chain release factor 3  52.02 
 
 		 533 aa  552  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.209121  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02787  peptide chain release factor 3  52.27 
 
 		 529 aa  552  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2968  peptide chain release factor 3  51.72 
 
 		 533 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.720802 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3761  peptide chain release factor 3  52.19 
 
 		 531 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.106529 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3872  peptide chain release factor 3  52.19 
 
 		 531 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0015  peptide chain release factor 3  53.65 
 
 		 517 aa  553  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  51.44 
 
 		 530 aa  551  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2474  peptide chain release factor 3  54.11 
 
 		 526 aa  554  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04250  peptide chain release factor 3  52.4 
 
 		 529 aa  549  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.631503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3624  peptide chain release factor 3  52.4 
 
 		 529 aa  549  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3682  peptide chain release factor 3  52.4 
 
 		 529 aa  550  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.297475  hitchhiker  0.00075439 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0935  peptide chain release factor 3  51.15 
 
 		 526 aa  551  1e-155  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0837  peptide chain release factor 3  52.21 
 
 		 529 aa  549  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  51.06 
 
 		 542 aa  551  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01678  peptide chain release factor 3  52.35 
 
 		 534 aa  550  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790822  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  51.15 
 
 		 528 aa  550  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04216  hypothetical protein  52.4 
 
 		 529 aa  549  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.659942  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4609  peptide chain release factor 3  52.4 
 
 		 529 aa  550  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00121865  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3633  peptide chain release factor 3  52.21 
 
 		 529 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4971  peptide chain release factor 3  52.4 
 
 		 529 aa  550  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00185733  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3586  peptide chain release factor 3  52.67 
 
 		 529 aa  548  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3808  peptide chain release factor 3  50.47 
 
 		 538 aa  549  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4922  peptide chain release factor 3  52.4 
 
 		 529 aa  549  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.55632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3466  peptide chain release factor 3  52.86 
 
 		 529 aa  550  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3504  peptide chain release factor 3  52.21 
 
 		 529 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  52.5 
 
 		 528 aa  548  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4918  peptide chain release factor 3  52.4 
 
 		 529 aa  550  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5887  peptide chain release factor 3  52.4 
 
 		 529 aa  549  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.397514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2046  peptide chain release factor 3  51.06 
 
 		 531 aa  546  1e-154  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.840556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2519  peptide chain release factor 3  52.31 
 
 		 527 aa  547  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2820  peptide chain release factor 3  52.5 
 
 		 526 aa  546  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0200081  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0613  peptide chain release factor 3  52.78 
 
 		 526 aa  546  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>