More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0882 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2092  peptide chain release factor 3  60.65 
 
 		 528 aa  667    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0882  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 558 aa  1139    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3801  peptide chain release factor 3  64.11 
 
 		 527 aa  681    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal  0.0495277 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2497  peptide chain release factor 3  59.81 
 
 		 530 aa  648    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0690  peptide chain release factor 3  63.51 
 
 		 507 aa  655    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217398  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0754  peptide chain release factor 3  61.16 
 
 		 549 aa  639    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.852788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3016  peptide chain release factor 3  59.1 
 
 		 530 aa  637    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0909  peptide chain release factor 3  58.2 
 
 		 542 aa  635    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.212809  normal  0.0162662 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0698  peptide chain release factor 3  60.04 
 
 		 526 aa  645    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.286373  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5127  peptide chain release factor 3  65.96 
 
 		 521 aa  702    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.166056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1678  peptide chain release factor 3  59.81 
 
 		 533 aa  642    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0068133  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1245  peptide chain release factor 3  60.98 
 
 		 533 aa  629  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236346  normal  0.0221222 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1359  peptide chain release factor 3  56.32 
 
 		 525 aa  623  1e-177  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3555  peptide chain release factor 3  57.69 
 
 		 527 aa  622  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3159  peptide chain release factor 3  57.33 
 
 		 541 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2337  peptide chain release factor 3  56.59 
 
 		 541 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.707548  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1193  peptide chain release factor 3  58.81 
 
 		 525 aa  619  1e-176  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4851  peptide chain release factor 3  56.37 
 
 		 539 aa  619  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.354411 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2944  peptide chain release factor 3  57.14 
 
 		 539 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0217278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1680  peptide chain release factor 3  57.43 
 
 		 539 aa  619  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0890826  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3762  peptide chain release factor 3  57.3 
 
 		 539 aa  620  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0113142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5540  peptide chain release factor 3  57.04 
 
 		 537 aa  620  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.073692  normal  0.0734795 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1321  peptide chain release factor 3  57.12 
 
 		 525 aa  619  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4375  peptide chain release factor 3  56.37 
 
 		 539 aa  619  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.607928  normal  0.322908 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1063  peptide chain release factor 3  56.73 
 
 		 525 aa  615  1e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438262  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2527  peptide chain release factor 3  58.08 
 
 		 541 aa  618  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0244653  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2027  peptide chain release factor 3  57.52 
 
 		 539 aa  614  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4059  peptide chain release factor 3  57.85 
 
 		 532 aa  614  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2307  peptide chain release factor 3  57.58 
 
 		 540 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452357  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4261  peptide chain release factor 3  57.31 
 
 		 539 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.3422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0369  peptide chain release factor 3  56.25 
 
 		 527 aa  609  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2646  peptide chain release factor 3  59.31 
 
 		 535 aa  610  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4612  peptide chain release factor 3  57.12 
 
 		 527 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472275  normal  0.461934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4181  peptide chain release factor 3  57.23 
 
 		 539 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4347  peptide chain release factor 3  56.74 
 
 		 527 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433833  normal  0.342451 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0417  peptide chain release factor 3  55.89 
 
 		 527 aa  591  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317239 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  54.08 
 
 		 524 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2537  peptide chain release factor 3  53.46 
 
 		 534 aa  568  1e-161  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478101  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1002  peptide chain release factor 3  53.46 
 
 		 504 aa  570  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1196  peptide chain release factor 3  53.46 
 
 		 534 aa  568  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.101228 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2514  peptide chain release factor 3  52.11 
 
 		 539 aa  567  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1203  peptide chain release factor 3  53.05 
 
 		 545 aa  567  1e-160  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.949342 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2144  peptide chain release factor 3  52.11 
 
 		 539 aa  567  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.280372  hitchhiker  0.00257154 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1393  peptide chain release factor 3  53.74 
 
 		 524 aa  565  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263078  normal  0.346403 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1986  peptide chain release factor 3  53.27 
 
 		 534 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.339407 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1336  peptide chain release factor 3  53.27 
 
 		 535 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0751595 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1990  peptide chain release factor 3  53.13 
 
 		 526 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4287  peptide chain release factor 3  51.9 
 
 		 533 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  52.38 
 
 		 524 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0922  peptide chain release factor 3  54.62 
 
 		 531 aa  565  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.763827  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0414  peptide chain release factor 3  51.15 
 
 		 531 aa  561  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1807  peptide chain release factor 3  53.46 
 
 		 562 aa  560  1e-158  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0541486 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  51.61 
 
 		 531 aa  560  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1821  peptide chain release factor 3  53.07 
 
 		 536 aa  559  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6925  peptide chain release factor 3  51.89 
 
 		 533 aa  556  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.209121  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01678  peptide chain release factor 3  51.98 
 
 		 534 aa  556  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790822  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3649  peptide chain release factor 3  50.95 
 
 		 528 aa  555  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0970  peptide chain release factor 3  52.09 
 
 		 524 aa  555  1e-157  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00550606  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2968  peptide chain release factor 3  51.71 
 
 		 533 aa  557  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.720802 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2372  peptide chain release factor 3  52.32 
 
 		 529 aa  556  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3858  peptide chain release factor 3  50.74 
 
 		 547 aa  553  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1490  peptide chain release factor 3  50.38 
 
 		 535 aa  553  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000251643  hitchhiker  0.00000000120572 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  51.04 
 
 		 542 aa  552  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  51.61 
 
 		 528 aa  553  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0192  peptide chain release factor 3  51.91 
 
 		 527 aa  554  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2819  peptide chain release factor 3  52.1 
 
 		 528 aa  552  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2330  peptide chain release factor 3  52.09 
 
 		 535 aa  554  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3808  peptide chain release factor 3  52.08 
 
 		 538 aa  552  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  52 
 
 		 530 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0882  peptide chain release factor 3  52.1 
 
 		 527 aa  552  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0138  peptide chain release factor 3  51.9 
 
 		 526 aa  549  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3219  peptide chain release factor 3  51.89 
 
 		 538 aa  551  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.76683  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1662  peptide chain release factor 3  51.89 
 
 		 533 aa  550  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.828617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4019  peptide chain release factor 3  51.5 
 
 		 526 aa  550  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5160199999999995e-20 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3872  peptide chain release factor 3  51.7 
 
 		 531 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3761  peptide chain release factor 3  51.7 
 
 		 531 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.106529 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3935  peptide chain release factor 3  51.69 
 
 		 526 aa  550  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1828  peptide chain release factor 3  50.09 
 
 		 544 aa  551  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5808  peptide chain release factor 3  52.33 
 
 		 530 aa  548  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0147  peptide chain release factor 3  50.95 
 
 		 535 aa  548  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3053  peptide chain release factor 3  52.27 
 
 		 534 aa  548  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5334  peptide chain release factor 3  52.24 
 
 		 533 aa  545  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490929  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  51.24 
 
 		 528 aa  546  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0435  peptide chain release factor 3  49.53 
 
 		 531 aa  544  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0147  peptide chain release factor 3  51.51 
 
 		 534 aa  542  1e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0935  peptide chain release factor 3  50.76 
 
 		 526 aa  540  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0905  peptide chain release factor 3  50.19 
 
 		 526 aa  540  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0130  peptide chain release factor 3  51.51 
 
 		 534 aa  541  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.174893  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1011  peptide chain release factor 3  50.38 
 
 		 528 aa  537  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0968  peptide chain release factor 3  50.65 
 
 		 543 aa  536  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0792  peptide chain release factor 3  51.15 
 
 		 527 aa  536  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0266  peptide chain release factor 3  50.57 
 
 		 529 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.580519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4306  peptide chain release factor 3  50.76 
 
 		 527 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.546945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0015  peptide chain release factor 3  51.9 
 
 		 517 aa  533  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4253  peptide chain release factor 3  49.9 
 
 		 527 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.995333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2519  peptide chain release factor 3  50.87 
 
 		 527 aa  533  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4412  peptide chain release factor 3  50.75 
 
 		 527 aa  535  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000888652  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13410  peptide chain release factor 3  50.19 
 
 		 527 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.898041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0877  peptide chain release factor 3  50.76 
 
 		 525 aa  534  1e-150  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2046  peptide chain release factor 3  49.24 
 
 		 531 aa  534  1e-150  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.840556  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>