More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3596 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0328  peptide chain release factor 3  61.27 
 
 		 533 aa  670    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3596  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 529 aa  1095    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.750333  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0592  peptide chain release factor 3  69.45 
 
 		 531 aa  789    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0581  peptide chain release factor 3  69.45 
 
 		 531 aa  789    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0116263  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1434  peptide chain release factor 3  59.46 
 
 		 539 aa  657    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157478  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3254  peptide chain release factor 3  55.04 
 
 		 529 aa  588  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000111312  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0398  peptide chain release factor 3  56.45 
 
 		 532 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0780  peptide chain release factor 3  52.83 
 
 		 543 aa  577  1.0000000000000001e-163  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.474397  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1056  peptide chain release factor 3  52.9 
 
 		 542 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448459 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2365  peptide chain release factor 3  53.06 
 
 		 556 aa  568  1e-161  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.100255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4549  peptide chain release factor 3  52.16 
 
 		 563 aa  560  1e-158  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3298  peptide chain release factor 3  52.02 
 
 		 540 aa  560  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1279  peptide chain release factor 3  51.54 
 
 		 548 aa  560  1e-158  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1843  peptide chain release factor 3  51.45 
 
 		 540 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2904  peptide chain release factor 3  52.03 
 
 		 542 aa  556  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835611  normal  0.0349958 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2024  peptide chain release factor 3  52.27 
 
 		 539 aa  551  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07361  peptide chain release factor 3  50.86 
 
 		 545 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.301095  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1704  peptide chain release factor 3  50.78 
 
 		 542 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1999  peptide chain release factor 3  52.27 
 
 		 539 aa  551  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1764  peptide chain release factor 3  50.68 
 
 		 541 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07181  peptide chain release factor 3  51.35 
 
 		 545 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.55147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1844  peptide chain release factor 3  50.68 
 
 		 541 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0095  peptide chain release factor 3  51.07 
 
 		 555 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07201  peptide chain release factor 3  51.07 
 
 		 555 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.577625  normal  0.0107792 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0663  peptide chain release factor 3  51.74 
 
 		 545 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.635496  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2112  peptide chain release factor 3  50.29 
 
 		 541 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07161  peptide chain release factor 3  51.16 
 
 		 545 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.651427  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1198  peptide chain release factor 3  52.55 
 
 		 548 aa  542  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14191  peptide chain release factor 3  52.31 
 
 		 571 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07731  peptide chain release factor 3  50.48 
 
 		 555 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107568 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  50.29 
 
 		 528 aa  514  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1351  peptide chain release factor 3  51.08 
 
 		 525 aa  508  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000276996  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1492  peptide chain release factor 3  49.7 
 
 		 567 aa  506  9.999999999999999e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0138  peptide chain release factor 3  48.85 
 
 		 526 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0609  peptide chain release factor 3  51.47 
 
 		 520 aa  504  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00905219  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  51.69 
 
 		 530 aa  504  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0192  peptide chain release factor 3  49.42 
 
 		 527 aa  504  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  51.54 
 
 		 524 aa  502  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02787  peptide chain release factor 3  52.84 
 
 		 529 aa  504  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  52.61 
 
 		 528 aa  504  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1821  peptide chain release factor 3  51.26 
 
 		 536 aa  499  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1037  peptide chain release factor 3  49.9 
 
 		 520 aa  500  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00273811  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3935  peptide chain release factor 3  48.85 
 
 		 526 aa  500  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1018  peptide chain release factor 3  49.9 
 
 		 520 aa  500  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0165348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4019  peptide chain release factor 3  49.05 
 
 		 526 aa  500  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5160199999999995e-20 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1990  peptide chain release factor 3  52.63 
 
 		 526 aa  496  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3371  peptide chain release factor 3  52.01 
 
 		 523 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0198312  hitchhiker  0.00795059 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3053  peptide chain release factor 3  51.37 
 
 		 534 aa  496  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1021  peptide chain release factor 3  52.09 
 
 		 527 aa  495  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000101004  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2827  peptide chain release factor 3  51.67 
 
 		 526 aa  497  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000333993  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1033  peptide chain release factor 3  51.67 
 
 		 526 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00526307  hitchhiker  0.0000000642839 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1098  peptide chain release factor 3  51.67 
 
 		 526 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00192369  unclonable  0.0000319314 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1393  peptide chain release factor 3  50.63 
 
 		 524 aa  496  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263078  normal  0.346403 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0882  peptide chain release factor 3  48.01 
 
 		 527 aa  497  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1135  peptide chain release factor 3  51.36 
 
 		 526 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000115855  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0935  peptide chain release factor 3  48.45 
 
 		 526 aa  495  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0190  peptide chain release factor 3  52.11 
 
 		 531 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2820  peptide chain release factor 3  51.66 
 
 		 526 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0200081  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3235  peptide chain release factor 3  51.8 
 
 		 523 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.458258  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  52.33 
 
 		 531 aa  494  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2474  peptide chain release factor 3  51.98 
 
 		 526 aa  492  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0435  peptide chain release factor 3  48.94 
 
 		 531 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0997  peptide chain release factor 3  51.15 
 
 		 526 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0156098  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0395  peptide chain release factor 3  52.93 
 
 		 523 aa  494  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.118943  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1532  peptide chain release factor 3  50.19 
 
 		 514 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1490  peptide chain release factor 3  50.1 
 
 		 535 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000251643  hitchhiker  0.00000000120572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1037  peptide chain release factor 3  51.46 
 
 		 526 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00294724  unclonable  0.000000000176372 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4412  peptide chain release factor 3  48.16 
 
 		 527 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000888652  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3232  peptide chain release factor 3  51.15 
 
 		 526 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0110977  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4916  peptide chain release factor 3  50.73 
 
 		 529 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.996004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2144  peptide chain release factor 3  49.7 
 
 		 539 aa  490  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.280372  hitchhiker  0.00257154 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1662  peptide chain release factor 3  50.51 
 
 		 533 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.828617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4968  peptide chain release factor 3  50.73 
 
 		 529 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0905  peptide chain release factor 3  47.96 
 
 		 526 aa  489  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3053  peptide chain release factor 3  50.73 
 
 		 526 aa  489  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00432214  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0968  peptide chain release factor 3  48.36 
 
 		 543 aa  490  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  51.79 
 
 		 542 aa  489  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0806  peptide chain release factor 3  50.95 
 
 		 528 aa  491  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0794725  hitchhiker  0.00323143 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4881  peptide chain release factor 3  50.73 
 
 		 529 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180345  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2514  peptide chain release factor 3  49.7 
 
 		 539 aa  490  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4974  peptide chain release factor 3  50.73 
 
 		 529 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.219451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4813  peptide chain release factor 3  50.73 
 
 		 529 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0968  peptide chain release factor 3  52.32 
 
 		 528 aa  490  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.463155  decreased coverage  0.000218803 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01678  peptide chain release factor 3  50 
 
 		 534 aa  487  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790822  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0613  peptide chain release factor 3  52.21 
 
 		 526 aa  487  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0772  peptide chain release factor 3  53.25 
 
 		 514 aa  487  1e-136  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00659018  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4253  peptide chain release factor 3  51.46 
 
 		 527 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.995333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  52.07 
 
 		 524 aa  488  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0807  peptide chain release factor 3  51.46 
 
 		 527 aa  488  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.986611  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0792  peptide chain release factor 3  50.2 
 
 		 527 aa  487  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0652  peptide chain release factor 3  50.52 
 
 		 529 aa  485  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3649  peptide chain release factor 3  48.36 
 
 		 528 aa  486  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0877  peptide chain release factor 3  52.42 
 
 		 525 aa  486  1e-136  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002625  peptide chain release factor 3  51.69 
 
 		 529 aa  485  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0414  peptide chain release factor 3  48.54 
 
 		 531 aa  486  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1140  peptide chain release factor 3  52.42 
 
 		 525 aa  486  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1358  peptide chain release factor 3  51.58 
 
 		 528 aa  486  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0384  peptide chain release factor 3  50.94 
 
 		 526 aa  486  1e-136  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13410  peptide chain release factor 3  51.77 
 
 		 527 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.898041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1267  peptide chain release factor 3  48.84 
 
 		 504 aa  488  1e-136  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.551841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>