More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5645 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5645  peptide chain release factor 3  100 
 
 
538 aa  1057    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1592  peptide chain release factor 3  55.79 
 
 
527 aa  557  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383837  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5464  peptide chain release factor 3  51.57 
 
 
540 aa  548  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.934757  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1328  peptide chain release factor 3  52.94 
 
 
556 aa  544  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.693943  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0359  peptide chain release factor 3  54.39 
 
 
542 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1494  peptide chain release factor 3  51.7 
 
 
545 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1516  peptide chain release factor 3  51.7 
 
 
545 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1492  peptide chain release factor 3  51.51 
 
 
569 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.473522  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4411  peptide chain release factor 3  51.72 
 
 
541 aa  533  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1338  peptide chain release factor 3  52.58 
 
 
528 aa  530  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.476931 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06080  peptide chain release factor 3  53.22 
 
 
544 aa  528  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38845  normal  0.36917 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0191  peptide chain release factor 3  50.94 
 
 
535 aa  530  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0346  peptide chain release factor 3  49.81 
 
 
537 aa  525  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3212  peptide chain release factor 3  51.39 
 
 
538 aa  522  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714231  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1529  peptide chain release factor 3  50.55 
 
 
540 aa  521  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.816656  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2802  peptide chain release factor 3  50.1 
 
 
521 aa  479  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2365  peptide chain release factor 3  46.82 
 
 
556 aa  470  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.100255  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1056  peptide chain release factor 3  45.83 
 
 
542 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00448459 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0079  small GTP-binding protein  47.19 
 
 
523 aa  469  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.125969  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2904  peptide chain release factor 3  43.2 
 
 
542 aa  466  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835611  normal  0.0349958 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07361  peptide chain release factor 3  44.02 
 
 
545 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.301095  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0780  peptide chain release factor 3  46.4 
 
 
543 aa  465  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.474397  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1279  peptide chain release factor 3  46.13 
 
 
548 aa  463  1e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1843  peptide chain release factor 3  44.36 
 
 
540 aa  465  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1999  peptide chain release factor 3  44.81 
 
 
539 aa  458  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4549  peptide chain release factor 3  45.75 
 
 
563 aa  461  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2024  peptide chain release factor 3  44.81 
 
 
539 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2700  peptide chain release factor 3  44.27 
 
 
583 aa  456  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0095  peptide chain release factor 3  44.55 
 
 
555 aa  458  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3298  peptide chain release factor 3  44.17 
 
 
540 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453885  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07731  peptide chain release factor 3  45.99 
 
 
555 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107568 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4207  peptide chain release factor 3  45.97 
 
 
544 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0348722 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07201  peptide chain release factor 3  44.55 
 
 
555 aa  458  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.577625  normal  0.0107792 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0663  peptide chain release factor 3  45.23 
 
 
545 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.635496  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07181  peptide chain release factor 3  44.32 
 
 
545 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.55147  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07161  peptide chain release factor 3  44.51 
 
 
545 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.651427  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1198  peptide chain release factor 3  46.21 
 
 
548 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3254  peptide chain release factor 3  47.41 
 
 
529 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000111312  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1492  peptide chain release factor 3  47.12 
 
 
567 aa  439  9.999999999999999e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14191  peptide chain release factor 3  46.04 
 
 
571 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3649  peptide chain release factor 3  45.63 
 
 
528 aa  431  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1704  peptide chain release factor 3  46.84 
 
 
542 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552912  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0398  peptide chain release factor 3  43.75 
 
 
532 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  43.26 
 
 
528 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1434  peptide chain release factor 3  40.96 
 
 
539 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0328  peptide chain release factor 3  41.85 
 
 
533 aa  425  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  47.69 
 
 
528 aa  422  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1662  peptide chain release factor 3  44.11 
 
 
533 aa  421  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.828617  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5808  peptide chain release factor 3  43.58 
 
 
530 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3761  peptide chain release factor 3  43.2 
 
 
531 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.106529 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  42.16 
 
 
524 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3808  peptide chain release factor 3  47.05 
 
 
538 aa  418  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3872  peptide chain release factor 3  43.2 
 
 
531 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1037  peptide chain release factor 3  41.94 
 
 
520 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00273811  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1490  peptide chain release factor 3  43.55 
 
 
535 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000251643  hitchhiker  0.00000000120572 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1018  peptide chain release factor 3  41.94 
 
 
520 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0165348  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6925  peptide chain release factor 3  46.72 
 
 
533 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.209121  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0698  peptide chain release factor 3  46.69 
 
 
526 aa  412  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.286373  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1990  peptide chain release factor 3  44.42 
 
 
526 aa  413  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5334  peptide chain release factor 3  42.8 
 
 
533 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490929  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2968  peptide chain release factor 3  46.94 
 
 
533 aa  415  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.720802 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1351  peptide chain release factor 3  41.29 
 
 
525 aa  413  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000276996  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0414  peptide chain release factor 3  46.27 
 
 
531 aa  415  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1764  peptide chain release factor 3  44.99 
 
 
541 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3858  peptide chain release factor 3  45.69 
 
 
547 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  45.15 
 
 
542 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4287  peptide chain release factor 3  46.5 
 
 
533 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3219  peptide chain release factor 3  46.44 
 
 
538 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.76683  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0592  peptide chain release factor 3  43.24 
 
 
531 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0581  peptide chain release factor 3  43.24 
 
 
531 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0116263  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1844  peptide chain release factor 3  45.2 
 
 
541 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3053  peptide chain release factor 3  44.58 
 
 
534 aa  410  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0609  peptide chain release factor 3  41.43 
 
 
520 aa  408  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00905219  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  42.05 
 
 
531 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1821  peptide chain release factor 3  44.02 
 
 
536 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  44.83 
 
 
524 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0807  peptide chain release factor 3  43 
 
 
527 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.986611  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0192  peptide chain release factor 3  43.57 
 
 
527 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000119387  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2112  peptide chain release factor 3  44.61 
 
 
541 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3762  peptide chain release factor 3  45.75 
 
 
539 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0113142  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01678  peptide chain release factor 3  44.65 
 
 
534 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790822  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0147  peptide chain release factor 3  45.58 
 
 
535 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0882  peptide chain release factor 3  44.68 
 
 
527 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3801  peptide chain release factor 3  46.12 
 
 
527 aa  403  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal  0.0495277 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0968  peptide chain release factor 3  46.17 
 
 
543 aa  405  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977047  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2819  peptide chain release factor 3  45.4 
 
 
528 aa  405  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2330  peptide chain release factor 3  45.28 
 
 
535 aa  405  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2497  peptide chain release factor 3  44.22 
 
 
530 aa  404  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0266  peptide chain release factor 3  44.07 
 
 
529 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.580519  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3159  peptide chain release factor 3  45.75 
 
 
541 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2092  peptide chain release factor 3  44.7 
 
 
528 aa  404  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.429177  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0435  peptide chain release factor 3  43.67 
 
 
531 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2944  peptide chain release factor 3  45.26 
 
 
539 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0217278  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2144  peptide chain release factor 3  43.08 
 
 
539 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.280372  hitchhiker  0.00257154 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2527  peptide chain release factor 3  45.85 
 
 
541 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0244653  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0140  peptide chain release factor 3  41.19 
 
 
503 aa  403  1e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2514  peptide chain release factor 3  43.08 
 
 
539 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0652  peptide chain release factor 3  43.89 
 
 
529 aa  402  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3596  peptide chain release factor 3  40.99 
 
 
529 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.750333  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2337  peptide chain release factor 3  45.28 
 
 
541 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.707548  normal  0.274882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>