More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1328 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_06080  peptide chain release factor 3  64.8 
 
 		 544 aa  704    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38845  normal  0.36917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1338  peptide chain release factor 3  62.74 
 
 		 528 aa  663    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.476931 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1529  peptide chain release factor 3  66.11 
 
 		 540 aa  726    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.816656  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0359  peptide chain release factor 3  62.27 
 
 		 542 aa  679    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1516  peptide chain release factor 3  85.64 
 
 		 545 aa  960    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1592  peptide chain release factor 3  62.86 
 
 		 527 aa  666    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4411  peptide chain release factor 3  60.3 
 
 		 541 aa  647    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5464  peptide chain release factor 3  92.55 
 
 		 540 aa  1028    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.934757  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1494  peptide chain release factor 3  85.64 
 
 		 545 aa  960    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1328  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 556 aa  1140    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.693943  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3212  peptide chain release factor 3  65.03 
 
 		 538 aa  714    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714231  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0346  peptide chain release factor 3  61.76 
 
 		 537 aa  649    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0191  peptide chain release factor 3  61.57 
 
 		 535 aa  638    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1492  peptide chain release factor 3  85.27 
 
 		 569 aa  967    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.473522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2802  peptide chain release factor 3  66.67 
 
 		 521 aa  686    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4207  peptide chain release factor 3  54.29 
 
 		 544 aa  582  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0348722 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0079  small GTP-binding protein  55.19 
 
 		 523 aa  570  1e-161  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.125969  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5645  peptide chain release factor 3  52.56 
 
 		 538 aa  536  1e-151  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0780  peptide chain release factor 3  46.53 
 
 		 543 aa  459  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.474397  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1279  peptide chain release factor 3  45.35 
 
 		 548 aa  454  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2365  peptide chain release factor 3  45.42 
 
 		 556 aa  454  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.100255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07361  peptide chain release factor 3  43.68 
 
 		 545 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.301095  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2904  peptide chain release factor 3  44.72 
 
 		 542 aa  454  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835611  normal  0.0349958 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3298  peptide chain release factor 3  45.95 
 
 		 540 aa  450  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07161  peptide chain release factor 3  45.04 
 
 		 545 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.651427  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1843  peptide chain release factor 3  45.64 
 
 		 540 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07181  peptide chain release factor 3  45.04 
 
 		 545 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.55147  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2024  peptide chain release factor 3  45.52 
 
 		 539 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4549  peptide chain release factor 3  44.59 
 
 		 563 aa  446  1.0000000000000001e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1999  peptide chain release factor 3  45.63 
 
 		 539 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0095  peptide chain release factor 3  45.52 
 
 		 555 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0663  peptide chain release factor 3  44.66 
 
 		 545 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.635496  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07201  peptide chain release factor 3  45.52 
 
 		 555 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.577625  normal  0.0107792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1056  peptide chain release factor 3  44.4 
 
 		 542 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448459 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1198  peptide chain release factor 3  44.58 
 
 		 548 aa  434  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2700  peptide chain release factor 3  42.29 
 
 		 583 aa  431  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07731  peptide chain release factor 3  43.49 
 
 		 555 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107568 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1704  peptide chain release factor 3  44.57 
 
 		 542 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2968  peptide chain release factor 3  45.45 
 
 		 533 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.720802 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3596  peptide chain release factor 3  42.31 
 
 		 529 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.750333  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6925  peptide chain release factor 3  43.43 
 
 		 533 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.209121  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1844  peptide chain release factor 3  43.54 
 
 		 541 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1434  peptide chain release factor 3  41.24 
 
 		 539 aa  415  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157478  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3254  peptide chain release factor 3  45.4 
 
 		 529 aa  414  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000111312  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2112  peptide chain release factor 3  43.36 
 
 		 541 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1764  peptide chain release factor 3  43.36 
 
 		 541 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4287  peptide chain release factor 3  45.38 
 
 		 533 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0328  peptide chain release factor 3  40.38 
 
 		 533 aa  411  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0398  peptide chain release factor 3  42.69 
 
 		 532 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14191  peptide chain release factor 3  46.05 
 
 		 571 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1492  peptide chain release factor 3  42.83 
 
 		 567 aa  410  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  44.1 
 
 		 542 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1490  peptide chain release factor 3  42.57 
 
 		 535 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000251643  hitchhiker  0.00000000120572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3762  peptide chain release factor 3  46.31 
 
 		 539 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0113142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  43.92 
 
 		 524 aa  403  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1202  peptide chain release factor 3  42.15 
 
 		 527 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  40.83 
 
 		 530 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13410  peptide chain release factor 3  42.34 
 
 		 527 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.898041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0882  peptide chain release factor 3  41.94 
 
 		 527 aa  405  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1011  peptide chain release factor 3  42.92 
 
 		 528 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1662  peptide chain release factor 3  43.1 
 
 		 533 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.828617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4253  peptide chain release factor 3  41.76 
 
 		 527 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.995333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0807  peptide chain release factor 3  41.25 
 
 		 527 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.986611  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3649  peptide chain release factor 3  42.15 
 
 		 528 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4306  peptide chain release factor 3  41.57 
 
 		 527 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.546945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  42.45 
 
 		 524 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3808  peptide chain release factor 3  44.97 
 
 		 538 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1680  peptide chain release factor 3  46.52 
 
 		 539 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0890826  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4579  peptide chain release factor 3  41.81 
 
 		 527 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0916  peptide chain release factor 3  42.18 
 
 		 527 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0920838  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3219  peptide chain release factor 3  44.47 
 
 		 538 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.76683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0192  peptide chain release factor 3  41.33 
 
 		 527 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2330  peptide chain release factor 3  44.92 
 
 		 535 aa  397  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2819  peptide chain release factor 3  40.93 
 
 		 528 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0872  peptide chain release factor 3  41.98 
 
 		 527 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5334  peptide chain release factor 3  42.48 
 
 		 533 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490929  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2027  peptide chain release factor 3  46.31 
 
 		 539 aa  395  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  41.44 
 
 		 528 aa  395  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3872  peptide chain release factor 3  42.21 
 
 		 531 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0902  peptide chain release factor 3  41.98 
 
 		 541 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.779467  normal  0.296207 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3761  peptide chain release factor 3  42.21 
 
 		 531 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.106529 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3159  peptide chain release factor 3  45.77 
 
 		 541 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3858  peptide chain release factor 3  41.03 
 
 		 547 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2337  peptide chain release factor 3  46.19 
 
 		 541 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.707548  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2527  peptide chain release factor 3  46.12 
 
 		 541 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0244653  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5808  peptide chain release factor 3  42.72 
 
 		 530 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0792  peptide chain release factor 3  41.38 
 
 		 527 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0592  peptide chain release factor 3  40.95 
 
 		 531 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0581  peptide chain release factor 3  40.95 
 
 		 531 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0116263  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  41.71 
 
 		 531 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  41.73 
 
 		 528 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0138  peptide chain release factor 3  40.69 
 
 		 526 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1990  peptide chain release factor 3  40.92 
 
 		 526 aa  392  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0380  peptide chain release factor 3  43.79 
 
 		 531 aa  391  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.864644 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0968  peptide chain release factor 3  42.06 
 
 		 543 aa  391  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12250  peptide chain release factor 3  41.03 
 
 		 527 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.882878  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0266  peptide chain release factor 3  41.45 
 
 		 529 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.580519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0422  peptide chain release factor 3  43.99 
 
 		 531 aa  391  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5540  peptide chain release factor 3  45.45 
 
 		 537 aa  385  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.073692  normal  0.0734795 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1018  peptide chain release factor 3  41.94 
 
 		 520 aa  388  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0165348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>