More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1529 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1338  peptide chain release factor 3  59.33 
 
 		 528 aa  646    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.476931 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2802  peptide chain release factor 3  61.91 
 
 		 521 aa  665    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1592  peptide chain release factor 3  60.3 
 
 		 527 aa  655    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06080  peptide chain release factor 3  63.62 
 
 		 544 aa  689    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38845  normal  0.36917 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1529  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 540 aa  1099    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.816656  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0359  peptide chain release factor 3  61.52 
 
 		 542 aa  663    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4411  peptide chain release factor 3  62.69 
 
 		 541 aa  676    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1492  peptide chain release factor 3  66.79 
 
 		 569 aa  729    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.473522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1516  peptide chain release factor 3  66.79 
 
 		 545 aa  731    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1494  peptide chain release factor 3  66.79 
 
 		 545 aa  731    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3212  peptide chain release factor 3  82.19 
 
 		 538 aa  900    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714231  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5464  peptide chain release factor 3  66.67 
 
 		 540 aa  724    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.934757  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1328  peptide chain release factor 3  66.11 
 
 		 556 aa  720    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.693943  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0346  peptide chain release factor 3  56.99 
 
 		 537 aa  615  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0191  peptide chain release factor 3  56.02 
 
 		 535 aa  597  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4207  peptide chain release factor 3  54.09 
 
 		 544 aa  576  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0348722 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0079  small GTP-binding protein  52.78 
 
 		 523 aa  559  1e-158  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.125969  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5645  peptide chain release factor 3  50.18 
 
 		 538 aa  509  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0095  peptide chain release factor 3  44.89 
 
 		 555 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07201  peptide chain release factor 3  44.89 
 
 		 555 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.577625  normal  0.0107792 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1279  peptide chain release factor 3  45.69 
 
 		 548 aa  464  1e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1843  peptide chain release factor 3  44.36 
 
 		 540 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07731  peptide chain release factor 3  43.75 
 
 		 555 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107568 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1198  peptide chain release factor 3  46.63 
 
 		 548 aa  454  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2904  peptide chain release factor 3  42.15 
 
 		 542 aa  452  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835611  normal  0.0349958 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07361  peptide chain release factor 3  44.28 
 
 		 545 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.301095  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07161  peptide chain release factor 3  43.04 
 
 		 545 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.651427  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2024  peptide chain release factor 3  43.62 
 
 		 539 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07181  peptide chain release factor 3  42.67 
 
 		 545 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.55147  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2365  peptide chain release factor 3  43.38 
 
 		 556 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.100255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1999  peptide chain release factor 3  44.1 
 
 		 539 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0663  peptide chain release factor 3  42.31 
 
 		 545 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.635496  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1056  peptide chain release factor 3  43.49 
 
 		 542 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3298  peptide chain release factor 3  41.4 
 
 		 540 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4549  peptide chain release factor 3  41.71 
 
 		 563 aa  435  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0780  peptide chain release factor 3  44.47 
 
 		 543 aa  434  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.474397  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14191  peptide chain release factor 3  44.69 
 
 		 571 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2968  peptide chain release factor 3  44.6 
 
 		 533 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.720802 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1492  peptide chain release factor 3  42.94 
 
 		 567 aa  425  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27956  predicted protein  42.96 
 
 		 634 aa  425  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6925  peptide chain release factor 3  44.4 
 
 		 533 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.209121  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1704  peptide chain release factor 3  45.2 
 
 		 542 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3649  peptide chain release factor 3  42.59 
 
 		 528 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4287  peptide chain release factor 3  44.22 
 
 		 533 aa  411  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3254  peptide chain release factor 3  40.37 
 
 		 529 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000111312  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0328  peptide chain release factor 3  39.85 
 
 		 533 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1434  peptide chain release factor 3  39.41 
 
 		 539 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157478  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0609  peptide chain release factor 3  40.96 
 
 		 520 aa  403  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00905219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0192  peptide chain release factor 3  41.47 
 
 		 527 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1490  peptide chain release factor 3  42.72 
 
 		 535 aa  403  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000251643  hitchhiker  0.00000000120572 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2700  peptide chain release factor 3  39.8 
 
 		 583 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  41.62 
 
 		 528 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1844  peptide chain release factor 3  43.76 
 
 		 541 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2330  peptide chain release factor 3  41.79 
 
 		 535 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1764  peptide chain release factor 3  43.2 
 
 		 541 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1037  peptide chain release factor 3  40.6 
 
 		 520 aa  401  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00273811  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1018  peptide chain release factor 3  40.6 
 
 		 520 aa  401  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0165348  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0398  peptide chain release factor 3  39.77 
 
 		 532 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1351  peptide chain release factor 3  40.59 
 
 		 525 aa  398  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000276996  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2112  peptide chain release factor 3  43.2 
 
 		 541 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3808  peptide chain release factor 3  43.26 
 
 		 538 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0138  peptide chain release factor 3  40.89 
 
 		 526 aa  392  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0435  peptide chain release factor 3  39.7 
 
 		 531 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3219  peptide chain release factor 3  43.26 
 
 		 538 aa  392  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.76683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0882  peptide chain release factor 3  39.77 
 
 		 527 aa  391  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  39.96 
 
 		 528 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0266  peptide chain release factor 3  41.02 
 
 		 529 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.580519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0395  peptide chain release factor 3  40.11 
 
 		 523 aa  387  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.118943  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0140  peptide chain release factor 3  40.26 
 
 		 503 aa  388  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4019  peptide chain release factor 3  39.32 
 
 		 526 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5160199999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2819  peptide chain release factor 3  40.42 
 
 		 528 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0414  peptide chain release factor 3  39.93 
 
 		 531 aa  383  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3596  peptide chain release factor 3  39.02 
 
 		 529 aa  385  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.750333  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0592  peptide chain release factor 3  39.33 
 
 		 531 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0581  peptide chain release factor 3  39.33 
 
 		 531 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0116263  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1267  peptide chain release factor 3  37.64 
 
 		 504 aa  385  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.551841  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03381  peptide chain release factor 3  41.65 
 
 		 529 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1662  peptide chain release factor 3  42.62 
 
 		 533 aa  381  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.828617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002625  peptide chain release factor 3  41.57 
 
 		 529 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3935  peptide chain release factor 3  39.13 
 
 		 526 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02787  peptide chain release factor 3  41.73 
 
 		 529 aa  382  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1821  peptide chain release factor 3  41.41 
 
 		 536 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3858  peptide chain release factor 3  42.27 
 
 		 547 aa  382  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  40.36 
 
 		 542 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0968  peptide chain release factor 3  41.39 
 
 		 528 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.463155  decreased coverage  0.000218803 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1532  peptide chain release factor 3  40.6 
 
 		 514 aa  380  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3624  peptide chain release factor 3  41.49 
 
 		 529 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4922  peptide chain release factor 3  41.49 
 
 		 529 aa  375  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.55632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3872  peptide chain release factor 3  41.6 
 
 		 531 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0380  peptide chain release factor 3  38.42 
 
 		 531 aa  375  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.864644 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04216  hypothetical protein  41.49 
 
 		 529 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.659942  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1011  peptide chain release factor 3  39.88 
 
 		 528 aa  378  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  39.25 
 
 		 524 aa  375  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0806  peptide chain release factor 3  41.24 
 
 		 528 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0794725  hitchhiker  0.00323143 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0882  peptide chain release factor 3  40.91 
 
 		 558 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168442 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  41.36 
 
 		 531 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4306  peptide chain release factor 3  41.27 
 
 		 527 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.546945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1393  peptide chain release factor 3  40.15 
 
 		 524 aa  379  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263078  normal  0.346403 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3761  peptide chain release factor 3  41.6 
 
 		 531 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.106529 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13410  peptide chain release factor 3  40.75 
 
 		 527 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.898041  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>