More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0191 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0346  peptide chain release factor 3  93.67 
 
 		 537 aa  1042    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5464  peptide chain release factor 3  59.59 
 
 		 540 aa  634    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.934757  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06080  peptide chain release factor 3  65.38 
 
 		 544 aa  688    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38845  normal  0.36917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1328  peptide chain release factor 3  61.57 
 
 		 556 aa  636    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.693943  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1592  peptide chain release factor 3  61.55 
 
 		 527 aa  644    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1338  peptide chain release factor 3  59.69 
 
 		 528 aa  637    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.476931 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0191  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 535 aa  1094    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1516  peptide chain release factor 3  59.73 
 
 		 545 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1494  peptide chain release factor 3  59.73 
 
 		 545 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1492  peptide chain release factor 3  59.54 
 
 		 569 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.473522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0359  peptide chain release factor 3  58.73 
 
 		 542 aa  626  1e-178  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3212  peptide chain release factor 3  57.98 
 
 		 538 aa  612  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714231  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4411  peptide chain release factor 3  56.45 
 
 		 541 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2802  peptide chain release factor 3  59.45 
 
 		 521 aa  600  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1529  peptide chain release factor 3  56.02 
 
 		 540 aa  597  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.816656  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0079  small GTP-binding protein  55.41 
 
 		 523 aa  574  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.125969  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4207  peptide chain release factor 3  50.48 
 
 		 544 aa  521  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0348722 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5645  peptide chain release factor 3  50.75 
 
 		 538 aa  518  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2365  peptide chain release factor 3  45.51 
 
 		 556 aa  451  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.100255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4549  peptide chain release factor 3  43.61 
 
 		 563 aa  443  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1843  peptide chain release factor 3  43.56 
 
 		 540 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6925  peptide chain release factor 3  48.93 
 
 		 533 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.209121  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2968  peptide chain release factor 3  48.93 
 
 		 533 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.720802 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1056  peptide chain release factor 3  44.23 
 
 		 542 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2904  peptide chain release factor 3  42.69 
 
 		 542 aa  437  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835611  normal  0.0349958 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0095  peptide chain release factor 3  43.02 
 
 		 555 aa  435  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3298  peptide chain release factor 3  42.99 
 
 		 540 aa  434  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1279  peptide chain release factor 3  44.25 
 
 		 548 aa  433  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07201  peptide chain release factor 3  43.02 
 
 		 555 aa  435  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.577625  normal  0.0107792 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0780  peptide chain release factor 3  44.92 
 
 		 543 aa  431  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.474397  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1999  peptide chain release factor 3  43.18 
 
 		 539 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4287  peptide chain release factor 3  48.08 
 
 		 533 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2024  peptide chain release factor 3  43.18 
 
 		 539 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1198  peptide chain release factor 3  43.15 
 
 		 548 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14191  peptide chain release factor 3  45.33 
 
 		 571 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07181  peptide chain release factor 3  43.29 
 
 		 545 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.55147  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1704  peptide chain release factor 3  44.7 
 
 		 542 aa  425  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07161  peptide chain release factor 3  42.72 
 
 		 545 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.651427  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0663  peptide chain release factor 3  42.99 
 
 		 545 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.635496  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07731  peptide chain release factor 3  42.38 
 
 		 555 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107568 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1844  peptide chain release factor 3  44.55 
 
 		 541 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07361  peptide chain release factor 3  42.42 
 
 		 545 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.301095  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2112  peptide chain release factor 3  44.36 
 
 		 541 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1434  peptide chain release factor 3  40.15 
 
 		 539 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157478  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1764  peptide chain release factor 3  44.17 
 
 		 541 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1492  peptide chain release factor 3  42.97 
 
 		 567 aa  413  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3649  peptide chain release factor 3  44.79 
 
 		 528 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3808  peptide chain release factor 3  46.2 
 
 		 538 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3219  peptide chain release factor 3  42.59 
 
 		 538 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.76683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2046  peptide chain release factor 3  44.04 
 
 		 531 aa  408  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.840556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3858  peptide chain release factor 3  45.28 
 
 		 547 aa  404  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2700  peptide chain release factor 3  40 
 
 		 583 aa  402  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  41.76 
 
 		 524 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2330  peptide chain release factor 3  42.23 
 
 		 535 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3254  peptide chain release factor 3  41.78 
 
 		 529 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000111312  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0328  peptide chain release factor 3  39.54 
 
 		 533 aa  398  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1011  peptide chain release factor 3  43.68 
 
 		 528 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  41.12 
 
 		 524 aa  399  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0422  peptide chain release factor 3  42.17 
 
 		 531 aa  398  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0398  peptide chain release factor 3  38.61 
 
 		 532 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3761  peptide chain release factor 3  41.79 
 
 		 531 aa  395  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.106529 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0380  peptide chain release factor 3  41.96 
 
 		 531 aa  394  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.864644 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3596  peptide chain release factor 3  39.27 
 
 		 529 aa  395  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.750333  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3872  peptide chain release factor 3  41.79 
 
 		 531 aa  395  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3555  peptide chain release factor 3  40.64 
 
 		 527 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13410  peptide chain release factor 3  44.39 
 
 		 527 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.898041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0698  peptide chain release factor 3  43.6 
 
 		 526 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.286373  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0138  peptide chain release factor 3  40.42 
 
 		 526 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1662  peptide chain release factor 3  40.61 
 
 		 533 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.828617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0266  peptide chain release factor 3  42.05 
 
 		 529 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.580519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3762  peptide chain release factor 3  45.11 
 
 		 539 aa  391  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0113142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  40.83 
 
 		 528 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0645  peptide chain release factor 3  41.78 
 
 		 543 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.563471  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1202  peptide chain release factor 3  43.5 
 
 		 527 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4686  peptide chain release factor 3  41.7 
 
 		 542 aa  388  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1821  peptide chain release factor 3  42.95 
 
 		 536 aa  388  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0652  peptide chain release factor 3  42.8 
 
 		 529 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0917468 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  43.71 
 
 		 542 aa  388  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0807  peptide chain release factor 3  39.39 
 
 		 527 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.986611  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3801  peptide chain release factor 3  43.24 
 
 		 527 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal  0.0495277 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  42.89 
 
 		 530 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4306  peptide chain release factor 3  43.72 
 
 		 527 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.546945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  43.48 
 
 		 528 aa  388  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0435  peptide chain release factor 3  38.53 
 
 		 531 aa  385  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0916  peptide chain release factor 3  43.27 
 
 		 527 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0920838  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0617  peptide chain release factor 3  40.61 
 
 		 541 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1321  peptide chain release factor 3  43.88 
 
 		 525 aa  385  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0596  peptide chain release factor 3  40.61 
 
 		 541 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0968  peptide chain release factor 3  44.92 
 
 		 543 aa  384  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0453  peptide chain release factor 3  41.27 
 
 		 529 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.267512  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2497  peptide chain release factor 3  40.73 
 
 		 530 aa  383  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2514  peptide chain release factor 3  43.97 
 
 		 539 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4062  peptide chain release factor 3  43.51 
 
 		 542 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2819  peptide chain release factor 3  38.36 
 
 		 528 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1393  peptide chain release factor 3  42.68 
 
 		 524 aa  383  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263078  normal  0.346403 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0882  peptide chain release factor 3  43.37 
 
 		 558 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168442 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2144  peptide chain release factor 3  43.97 
 
 		 539 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.280372  hitchhiker  0.00257154 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4579  peptide chain release factor 3  43.05 
 
 		 527 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4922  peptide chain release factor 3  43.3 
 
 		 529 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.55632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4609  peptide chain release factor 3  43.3 
 
 		 529 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00121865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>