More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2638 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2638  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 		 311 aa  639    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.482426 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  42.09 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  41.41 
 
 		 316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3914  D-alanine--D-alanine ligase  42.96 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3830  D-alanine--D-alanine ligase  42 
 
 		 308 aa  195  7e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0850  D-alanine--D-alanine ligase  40.83 
 
 		 314 aa  195  8.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.868675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0689  D-alanyl-alanine synthetase A  40.92 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000234965  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0665  D-alanyl-alanine synthetase A  39.74 
 
 		 303 aa  192  8e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619225  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  39.19 
 
 		 310 aa  191  9e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  41.75 
 
 		 305 aa  191  9e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3774  D-alanine--D-alanine ligase  41.32 
 
 		 308 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1136  D-alanine--D-alanine ligase  38.46 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  40.59 
 
 		 305 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1155  D-alanine--D-alanine ligase  37.86 
 
 		 309 aa  186  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.112058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  40 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1588  D-alanyl-alanine synthetase A  36.16 
 
 		 316 aa  186  4e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000341303  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3943  D-alanine--D-alanine ligase  38.04 
 
 		 312 aa  186  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  38.13 
 
 		 313 aa  186  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0360  D-alanine/D-alanine ligase  39.4 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  37.95 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0415  D-alanine--D-alanine ligase  39.6 
 
 		 627 aa  182  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2077  D-alanine--D-alanine ligase  39.68 
 
 		 308 aa  182  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  hitchhiker  0.00112188 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3114  D-alanine/D-alanine ligase  37.79 
 
 		 307 aa  182  7e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188134  hitchhiker  0.0000000168198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0203  D-alanine--D-alanine ligase  37.5 
 
 		 308 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43186  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0382  D-alanine/D-alanine ligase  37.5 
 
 		 308 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0398495  normal  0.161369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2589  D-alanine--D-alanine ligase  40.06 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1878  D-alanine--D-alanine ligase  38.06 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.063714 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  38.59 
 
 		 306 aa  179  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2848  D-alanine--D-alanine ligase  39.1 
 
 		 308 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67822  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0585  D-alanine--D-alanine ligase  36.7 
 
 		 313 aa  177  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.034882  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0816  D-alanine--D-alanine ligase  35.08 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4102  D-alanine--D-alanine ligase  36.18 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0085  D-alanine--D-alanine ligase  38.05 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.34447  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1244  D-alanine/D-alanine ligase  40.4 
 
 		 316 aa  176  5e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00234913  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  37.33 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00093  D-alanylalanine synthetase  37.71 
 
 		 306 aa  175  9e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.149308  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00092  hypothetical protein  37.71 
 
 		 306 aa  175  9e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.144888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3508  D-alanine/D-alanine ligase  37.71 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00134071  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0098  D-alanine--D-alanine ligase  37.71 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699622  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0420  D-alanine/D-alanine ligase  34.98 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000379989  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3565  D-alanine--D-alanine ligase  37.71 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00231129  hitchhiker  0.00551648 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2887  D-alanine--D-alanine ligase  40.2 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0094  D-alanine--D-alanine ligase  37.71 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000101829  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0097  D-alanine--D-alanine ligase  37.71 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0100  D-alanine--D-alanine ligase  37.37 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0814155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2004  D-alanine--D-alanine ligase  39.3 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2074  D-alanine--D-alanine ligase  40.19 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3130  D-alanine--D-alanine ligase  39.41 
 
 		 307 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.330245 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0084  D-alanine--D-alanine ligase  33.92 
 
 		 340 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0750  D-alanine--D-alanine ligase  37.95 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3286  D-alanine--D-alanine ligase  36.91 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1149  D-alanine--D-alanine ligase  36.84 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.917542 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0260  D-alanine/D-alanine ligase  34.33 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000015088  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  36.7 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4160  D-alanine/D-alanine ligase  36.54 
 
 		 333 aa  170  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0147  D-alanine--D-alanine ligase  37.37 
 
 		 306 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000287396  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0142  D-alanine--D-alanine ligase  37.71 
 
 		 306 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0090881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0136  D-alanine/D-alanine ligase  37.91 
 
 		 302 aa  169  7e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3492  D-alanine--D-alanine ligase  39.48 
 
 		 307 aa  169  8e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  34.97 
 
 		 309 aa  168  9e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1796  D-alanine--D-alanine ligase  34.62 
 
 		 312 aa  168  9e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1204  D-alanine--D-alanine ligase  40.66 
 
 		 301 aa  168  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3173  D-alanine--D-alanine ligase  38.76 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0466065  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3301  D-alanine--D-alanine ligase  38.16 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2406  D-alanine--D-alanine ligase  40.66 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0142  D-alanine--D-alanine ligase  37.37 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  hitchhiker  0.00000371528 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3778  D-alanine--D-alanine ligase  36.61 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3496  D-alanine--D-alanine ligase  37.41 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.303259  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28460  D-alanine--D-alanine ligase  34.97 
 
 		 317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289482  hitchhiker  0.00300353 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1747  D-alanine--D-alanine ligase  40.52 
 
 		 308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0137  D-alanine/D-alanine ligase  35.25 
 
 		 288 aa  167  2.9999999999999998e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000588497  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2946  D-alanine--D-alanine ligase  38.44 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.187089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0897  D-alanine-D-alanine ligase A  35.23 
 
 		 346 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09600  D-alanine-D-alanine ligase A  34.84 
 
 		 346 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2353  D-alanine--D-alanine ligase  37.79 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.452645 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4490  D-alanine--D-alanine ligase  39.47 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0146  D-alanine--D-alanine ligase  37.04 
 
 		 306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.302602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0695  D-alanine--D-alanine ligase  39.42 
 
 		 307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686209  normal  0.293576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3660  D-alanine--D-alanine ligase  40.07 
 
 		 322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2649  D-alanine--D-alanine ligase  38.67 
 
 		 303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2424  D-alanine--D-alanine ligase  37.17 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.060178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2266  D-alanine--D-alanine ligase  37.5 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.297566  hitchhiker  0.00504643 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1360  D-alanine/D-alanine ligase  36.93 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0763  D-alanine--D-alanine ligase  36.27 
 
 		 306 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2916  D-alanine--D-alanine ligase  37.12 
 
 		 306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.253667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3516  D-alanine--D-alanine ligase  37.12 
 
 		 306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3385  D-alanine--D-alanine ligase  37.12 
 
 		 306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0172099  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7439  D-alanine--D-alanine ligase  37.94 
 
 		 307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  33.87 
 
 		 314 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0604  D-alanine--D-alanine ligase  38.51 
 
 		 320 aa  162  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0366  D-alanine--D-alanine ligase  40.07 
 
 		 308 aa  162  9e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  31.46 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  36.7 
 
 		 336 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0947  D-alanine--D-alanine ligase  39 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0325942  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  34.42 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04365  D-alanine--D-alanine ligase  40.68 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0661  D-alanine/D-alanine ligase  34.21 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0066  D-alanine--D-alanine ligase  40.32 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2329  D-alanine--D-alanine ligase  33.97 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.304126  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  31.46 
 
 		 304 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>