More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_27160 on replicon NC_009367
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009375  OSTLU_29749  predicted protein  100 
 
 
213 aa  431  1e-120  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0571734 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27160  predicted protein  100 
 
 
213 aa  431  1e-120  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0714983 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12586  predicted protein  43.87 
 
 
216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0473  RluA family pseudouridine synthase  42 
 
 
311 aa  106  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0458  RluA family pseudouridine synthase  42 
 
 
311 aa  105  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44844  predicted protein  38.86 
 
 
424 aa  97.4  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  38 
 
 
306 aa  95.1  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0375  RluA family pseudouridine synthase  36.18 
 
 
299 aa  94.4  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000429003  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0175  pseudouridine synthase, RluA family  37.21 
 
 
318 aa  89.4  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0492  pseudouridine synthase, RluA family  39.88 
 
 
325 aa  88.6  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113875 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1102  RluA family pseudouridine synthase  36.84 
 
 
314 aa  88.2  8e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3106  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  40.97 
 
 
219 aa  87.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.774477  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2363  pseudouridine synthase, RluA family  37.42 
 
 
305 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  40.91 
 
 
331 aa  86.7  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02735  hypothetical protein  35.77 
 
 
283 aa  86.3  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.469687  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1420  pseudouridine synthase, RluA family  36.57 
 
 
310 aa  85.9  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.276517 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0736  RluA family pseudouridine synthase  31.58 
 
 
319 aa  86.3  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4402  pseudouridine synthase  39.42 
 
 
570 aa  85.5  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.89 
 
 
300 aa  84.7  8e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3248  pseudouridine synthase, RluA family  36.76 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0949  RluA family pseudouridine synthase  37.59 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3427  RluA family pseudouridine synthase  37.04 
 
 
314 aa  84  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0544491 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3719  RluA family pseudouridine synthase  34.31 
 
 
302 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00132143  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1651  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  37.8 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2195  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  39.87 
 
 
213 aa  84  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0995  pseudouridine synthase, RluA family  36.67 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388874  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2197  pseudouridylate synthase  37.96 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2883  RluA family pseudouridine synthase  36.3 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08290  pseudouridine synthase, RluA family  34.56 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4000  pseudouridine synthase RluA family  36.76 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.782666 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3265  pseudouridine synthase, RluA family  36 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1248  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  34.31 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000362529  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2909  pseudouridine synthase  35.45 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.290818 
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.19 
 
 
300 aa  82  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000447138  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0791  pseudouridine synthase  40.46 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00896147  normal  0.0723816 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1044  pseudouridine synthase, RluA family  37.5 
 
 
346 aa  82  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5735  pseudouridine synthase, RluA family  37.31 
 
 
312 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4520  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  39.84 
 
 
227 aa  82  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2893  pseudouridine synthase  35.29 
 
 
212 aa  82  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5746  pseudouridine synthase, RluA family  36.57 
 
 
310 aa  81.6  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1156  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  37.5 
 
 
302 aa  81.3  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0116106  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0522  pseudouridine synthase, RluA family  30.14 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  35.25 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0763  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.58 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3937  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.58 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000762664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3743  RNA pseudouridylate synthase  33.58 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00315275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3634  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.58 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0043574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3651  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  33.58 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169242  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3993  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  33.58 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000288046  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4031  ribosomal large subunit pseudouridine synthase  33.58 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00039208  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1658  RluA family pseudouridine synthase  37.27 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.615207  normal  0.0770781 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1014  pseudouridine synthase  36 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3906  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  33.58 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000340417 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3345  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.04 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0072  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  38.69 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1630  pseudouridylate synthase  34.39 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.427552  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  33.58 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  33.58 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3944  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  33.58 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2541  RluA family pseudouridine synthase  33.58 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.15335  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3201  RluA family pseudouridine synthase  34.81 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.887852 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03700  pseudouridylate synthase for 23S rRNA (position 746) and tRNAphe(position 32), dual specificity  37.68 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2914  pseudouridine synthase  37.88 
 
 
551 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1014  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  30.99 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000716198  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0018  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D (rRNA-uridine isomerase D)  36.64 
 
 
326 aa  79.7  0.00000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0730  RluA family pseudouridine synthase  37.78 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0504919  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27270  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.07 
 
 
308 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.42777  normal  0.302751 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3182  pseudouridine synthase  37.88 
 
 
551 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.186572  normal  0.110581 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2950  suppressor of ftsH mutation  34.27 
 
 
326 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1515  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  34.01 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00972645  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1580  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.06 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0928054  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22700  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.76 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.17143 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1372  pseudouridine synthase, RluA family  32.78 
 
 
300 aa  79  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1100  pseudouridine synthase, RluA family  34.31 
 
 
297 aa  79  0.00000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1084  pseudouridine synthase, RluA family  37.31 
 
 
313 aa  78.6  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1281  RluA family pseudouridine synthase  32.85 
 
 
305 aa  78.6  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.71357  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4767  RluA family pseudouridine synthase  37.98 
 
 
364 aa  78.6  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305838  hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0447  pseudouridylate synthase  37.16 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129188  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1675  pseudouridine synthase  39.86 
 
 
234 aa  79  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1256  RluA family pseudouridine synthase  32.85 
 
 
305 aa  78.6  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0278  RluA family pseudouridine synthase  37.5 
 
 
468 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0556  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  35.11 
 
 
305 aa  78.6  0.00000000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0322  pseudouridine synthase, RluA family  37.5 
 
 
468 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.539792  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2804  pseudouridylate synthase  35.98 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.257511  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2774  RluA family pseudouridine synthase  35.71 
 
 
309 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.538883  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1394  pseudouridine synthase, RluD  36.42 
 
 
412 aa  78.6  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.377241  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1041  pseudouridine synthase, RluA family  33.33 
 
 
304 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000866742  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2822  RluA family pseudouridine synthase  39.13 
 
 
329 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000591979  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1581  pseudouridine synthase, RluA family  41.41 
 
 
308 aa  78.2  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6367  RluA family pseudouridine synthase  38.24 
 
 
469 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.129788  normal  0.347421 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0254  pseudouridine synthase  38.89 
 
 
249 aa  78.2  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2627  pseudouridine synthase, RluA family  34.81 
 
 
308 aa  78.2  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981062  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2377  RluA family pseudouridine synthase  31.58 
 
 
298 aa  78.2  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1440  pseudouridine synthase, RluA family  34.38 
 
 
347 aa  78.2  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.738263  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3606  predicted protein  35.51 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0259924  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3067  pseudouridine synthase  40.13 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0810  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  39.57 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.043607  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1506  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  36.26 
 
 
215 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0155  pseudouridine synthase  36.26 
 
 
215 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.62363 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0354  pseudouridine synthase, RluA family  37.23 
 
 
446 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115819  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>