More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12586 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_12586  predicted protein  100 
 
 		 216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.74 
 
 		 301 aa  116  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29749  predicted protein  43.87 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0571734 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27160  predicted protein  43.87 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0714983 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1751  pseudouridine synthase  33.78 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0485075  normal  0.0112767 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  34.06 
 
 		 331 aa  111  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1675  pseudouridine synthase  35.02 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0554  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.28 
 
 		 296 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0069072  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1014  pseudouridine synthase  34.68 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02735  hypothetical protein  31.8 
 
 		 283 aa  106  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.469687  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2620  RluA family pseudouridine synthase  32.35 
 
 		 347 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2896  pseudouridine synthase  36.97 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.76004  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1658  RluA family pseudouridine synthase  34.07 
 
 		 329 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.615207  normal  0.0770781 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3403  pseudouridine synthase RluD  34.07 
 
 		 501 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0666836  normal  0.0916306 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0738  pseudouridine synthase  32.46 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0390511  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1420  pseudouridine synthase, RluA family  31.58 
 
 		 310 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276517 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1365  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.14 
 
 		 296 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00766831  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4520  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  35.5 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0553  pseudouridine synthase, RluA family  31.94 
 
 		 352 aa  103  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2335  pseudouridine synthase RluD  34.98 
 
 		 453 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.134936 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0917  pseudouridine synthase  34.06 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2541  RluA family pseudouridine synthase  30.87 
 
 		 302 aa  102  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.15335  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  31.44 
 
 		 306 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1394  pseudouridine synthase, RluD  33.18 
 
 		 412 aa  102  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.377241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3129  pseudouridine synthase RluD  34.98 
 
 		 444 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411663  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  30.57 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1911  pseudouridine synthase, RluA family  35.08 
 
 		 356 aa  102  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.743404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1014  RluA family pseudouridine synthase  31.3 
 
 		 307 aa  101  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1162  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.45 
 
 		 276 aa  100  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0658766  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0857  RluA family pseudouridine synthase  32.91 
 
 		 471 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295039 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2363  pseudouridine synthase, RluA family  30.43 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3345  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.22 
 
 		 333 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2234  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C (rRNA uridine isomerase C) (rRNA pseudouridylate synthase C)  33.19 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0928032  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2706  pseudouridine synthase  31.17 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0399435  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3624  pseudouridine synthase, RluA family  33.18 
 
 		 455 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.62 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000447138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3937  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000762664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3993  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  31 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000288046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3743  RNA pseudouridylate synthase  31 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00315275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3634  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0043574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3651  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  31 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169242  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1248  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  31 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000362529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3944  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  31 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2811  pseudouridine synthase  33.19 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0225697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3906  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  31 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000340417 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2197  pseudouridylate synthase  38.38 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0354  pseudouridine synthase, RluA family  32.47 
 
 		 446 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0821  pseudouridylate synthase  31.44 
 
 		 225 aa  99.4  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0454843 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0278  RluA family pseudouridine synthase  32.91 
 
 		 468 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.05 
 
 		 300 aa  99.4  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0322  pseudouridine synthase, RluA family  32.91 
 
 		 468 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.539792  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1630  pseudouridylate synthase  33.18 
 
 		 223 aa  99  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.427552  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08006  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  27.39 
 
 		 356 aa  99.4  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1096  pseudouridylate synthase  34.65 
 
 		 232 aa  99  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3139  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  33.19 
 
 		 225 aa  99  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3719  RluA family pseudouridine synthase  31 
 
 		 302 aa  99  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00132143  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6367  RluA family pseudouridine synthase  32.91 
 
 		 469 aa  99  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.129788  normal  0.347421 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0291  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  32.24 
 
 		 348 aa  99  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0827  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  33.19 
 
 		 225 aa  98.6  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000100067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002989  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  32.31 
 
 		 314 aa  98.6  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02917  rRNA ribosomal pseudouridine synthase  32.31 
 
 		 339 aa  98.2  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0869  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.19 
 
 		 306 aa  98.6  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2133  RluA family pseudouridine synthase  32.03 
 
 		 318 aa  98.6  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0458  RluA family pseudouridine synthase  31.65 
 
 		 311 aa  98.2  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0799  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  33.19 
 
 		 225 aa  98.2  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.603428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1566  pseudouridine synthase  32.03 
 
 		 223 aa  98.2  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.232461  hitchhiker  0.00000912019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2791  pseudouridine synthase  32.03 
 
 		 223 aa  98.2  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1575  pseudouridine synthase, RluD  32.74 
 
 		 411 aa  98.2  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286446  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2909  pseudouridine synthase  30.87 
 
 		 215 aa  98.2  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290818 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4022  pseudouridine synthase, RluA family  29.91 
 
 		 334 aa  97.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000767359  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1115  pseudouridine synthase, RluA family  31.11 
 
 		 321 aa  97.4  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.494763 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0345  pseudouridine synthase  29.52 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4031  ribosomal large subunit pseudouridine synthase  30.57 
 
 		 302 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00039208  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1467  pseudouridine synthase  37.02 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3127  pseudouridine synthase, RluA family  33.48 
 
 		 327 aa  97.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1281  RluA family pseudouridine synthase  30.09 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.71357  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2659  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  33.33 
 
 		 330 aa  96.7  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1256  RluA family pseudouridine synthase  30.09 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0568  pseudouridine synthase  31.51 
 
 		 217 aa  97.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.494043  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2886  pseudouridine synthase  32.03 
 
 		 223 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0714  23S rRNA pseudouridylate synthase C  30.74 
 
 		 326 aa  97.1  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0733  pseudouridine synthase  32.75 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3706  pseudouridine synthase  32.75 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.143352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3583  pseudouridine synthase  32.75 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7124  pseudouridine synthase, RluA family  32.91 
 
 		 457 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0665  hypothetical protein  29.05 
 
 		 341 aa  96.3  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2728  pseudouridine synthase  32.75 
 
 		 305 aa  96.3  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3515  pseudouridine synthase  32.75 
 
 		 225 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.18243 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1372  pseudouridine synthase, RluA family  31.28 
 
 		 300 aa  96.3  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1312  RluA family pseudouridine synthase  30.77 
 
 		 350 aa  96.3  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1446  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  30.57 
 
 		 307 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3303  pseudouridine synthase  32.9 
 
 		 244 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0834  pseudouridylate synthase  33.62 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2883  RluA family pseudouridine synthase  30.57 
 
 		 309 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0473  RluA family pseudouridine synthase  29.46 
 
 		 311 aa  95.9  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2488  pseudouridylate synthase  31.91 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177305  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1515  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  29.41 
 
 		 221 aa  95.9  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00972645  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03674  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  30.43 
 
 		 250 aa  95.9  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0607  pseudouridine synthase  31.36 
 
 		 217 aa  95.5  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  29.52 
 
 		 305 aa  95.5  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>