296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1263 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1263  cobalamin B12-binding domain protein  100 
 
 		 149 aa  289  9e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.728671  normal  0.8637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4204  cobalamin B12-binding domain-containing protein  77.34 
 
 		 134 aa  197  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3814  cobalamin B12-binding domain-containing protein  74.81 
 
 		 134 aa  195  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1242  methylmalonyl-CoA mutase  70.54 
 
 		 135 aa  185  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0059  cobalamin B12-binding domain protein  74.22 
 
 		 136 aa  186  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107152 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0377  methylmalonyl-CoA mutase-like  67.67 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.99713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6220  cobalamin B12-binding domain-containing protein  75.38 
 
 		 134 aa  179  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1989  cobalamin B12-binding domain-containing protein  66.41 
 
 		 139 aa  178  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0289  cobalamin B12-binding domain protein  63.85 
 
 		 140 aa  177  4e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1541  methylmalonyl-CoA mutase, alpha subunit  68.94 
 
 		 151 aa  177  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0770461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7994  cobalamin B12-binding domain protein  66.93 
 
 		 135 aa  176  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2028  cobalamin B12-binding domain protein  63.64 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1832  methylmalonyl-CoA mutase  62.88 
 
 		 140 aa  171  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2098  cobalamin B12-binding domain protein  62.88 
 
 		 140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1673  cobalamin B12-binding domain protein  62.12 
 
 		 153 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3591  cobalamin B12-binding domain-containing protein  75.41 
 
 		 143 aa  171  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1715  cobalamin B12-binding domain protein  62.69 
 
 		 139 aa  169  7.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3482  cobalamin B12-binding domain-containing protein  63.57 
 
 		 134 aa  169  9e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  64.84 
 
 		 134 aa  169  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000031654  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1578  B12-binding protein  63.28 
 
 		 134 aa  168  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.432317  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2026  cobalamin B12-binding domain-containing protein  62.79 
 
 		 134 aa  168  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1574  methylmalonyl-CoA mutase-like  64.06 
 
 		 134 aa  168  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000332572  normal  0.305791 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2692  cobalamin B12-binding domain protein  60.9 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2369  methylmalonyl-CoA mutase-like protein  65.6 
 
 		 133 aa  169  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.308524  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1574  cobalamin B12-binding domain-containing protein  65.15 
 
 		 137 aa  168  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0630027 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1854  cobalamin B12-binding domain-containing protein  61.24 
 
 		 137 aa  167  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4641  cobalamin B12-binding domain protein  68.25 
 
 		 143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1769  cobalamin B12-binding domain-containing protein  60.47 
 
 		 134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00734137  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3774  cobalamin B12-binding domain protein  59.4 
 
 		 157 aa  159  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137195  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1910  cobalamin B12-binding domain protein  59.69 
 
 		 134 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.374857  normal  0.0962097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0457  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.69 
 
 		 133 aa  157  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.364165 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2691  cobalamin B12-binding domain protein  60.32 
 
 		 134 aa  157  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0118523  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0241  cobalamin B12-binding domain protein  57.46 
 
 		 139 aa  156  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0582  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.14 
 
 		 133 aa  156  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1322  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.03 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1432  methylmalonyl-CoA mutase  56.49 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.329321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4240  cobalamin B12-binding domain protein  55.81 
 
 		 139 aa  155  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1548  cobalamin B12-binding domain protein  59.52 
 
 		 134 aa  154  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166361 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1487  cobalamin B12-binding domain protein  55.73 
 
 		 135 aa  153  8e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.40083  normal  0.12756 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2024  cobalamin B12-binding domain-containing protein  59.69 
 
 		 134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000794891 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0318  cobalamin B12-binding domain protein  60.63 
 
 		 162 aa  150  4e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3987  cobalamin B12-binding domain-containing protein  60.16 
 
 		 137 aa  150  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195294  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0081  cobalamin B12-binding domain protein  54.62 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0550  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.72 
 
 		 133 aa  146  7e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0587  cobalamin B12-binding domain protein  57.25 
 
 		 135 aa  144  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.901029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2998  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.36 
 
 		 134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.651513  normal  0.0337584 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2055  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53.85 
 
 		 155 aa  143  8.000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3654  cobalamin B12-binding domain-containing protein  50.39 
 
 		 135 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.136466 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1359  cobalamin B12-binding domain protein  52.8 
 
 		 128 aa  135  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000160657  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0510  cobalamin B12-binding domain protein  51.16 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  0.90311 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0538  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  51.15 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000893241 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5018  cobalamin B12-binding domain-containing protein  52.34 
 
 		 135 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0900  cobalamin B12-binding domain protein  50.76 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4360  cobalamin B12-binding domain protein  51.52 
 
 		 138 aa  130  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.36975  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4309  cobalamin B12-binding domain-containing protein  56.56 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3825  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  57.02 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438631  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3899  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.02 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3811  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.02 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0469463  normal  0.0948206 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  47.69 
 
 		 140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0044288 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2805  cobalamin B12-binding domain protein  50 
 
 		 142 aa  127  5.0000000000000004e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.069341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5088  cobalamin B12-binding domain-containing protein  47.45 
 
 		 153 aa  127  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2472  cobalamin B12-binding domain protein  49.61 
 
 		 152 aa  124  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  56.56 
 
 		 133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.698998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3836  cobalamin B12-binding domain protein  49.24 
 
 		 138 aa  123  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.692162  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4260  cobalamin B12-binding domain-containing protein  55.28 
 
 		 133 aa  122  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2128  cobalamin B12-binding domain-containing protein  46.58 
 
 		 172 aa  120  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1772  methylmalonyl-CoA mutase  53.57 
 
 		 680 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.292142  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2169  methylmalonyl-CoA mutase  53.64 
 
 		 692 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.485789  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1034  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  49.21 
 
 		 666 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.488774  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1771  cobalamin B12-binding domain-containing protein  45.11 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.379199  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4193  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  50.45 
 
 		 670 aa  107  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.669168  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1197  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  47.75 
 
 		 657 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2855  methylmalonyl-CoA mutase  45.05 
 
 		 657 aa  103  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  47.32 
 
 		 720 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  48.21 
 
 		 738 aa  102  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  48.21 
 
 		 722 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  47.32 
 
 		 720 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1625  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  46.85 
 
 		 667 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4003  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  50 
 
 		 685 aa  101  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.446619  hitchhiker  0.000372138 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3062  methylmalonyl-CoA mutase  47.75 
 
 		 671 aa  101  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3260  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  43.2 
 
 		 713 aa  100  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3621  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  50 
 
 		 668 aa  100  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3486  methylmalonyl-CoA mutase  48.21 
 
 		 721 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  45.95 
 
 		 1106 aa  99.4  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2127  methylmalonyl-CoA mutase  46.43 
 
 		 720 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.063815  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2697  methylmalonyl-CoA mutase  48.21 
 
 		 720 aa  99.8  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.20812 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0797  methylmalonyl-CoA mutase  45.05 
 
 		 654 aa  98.6  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1164  methylmalonyl-CoA mutase  46.09 
 
 		 713 aa  98.6  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197015  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3875  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  44.14 
 
 		 688 aa  98.6  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3398  methylmalonyl-CoA mutase  48.21 
 
 		 731 aa  99.4  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2383  methylmalonyl-CoA mutase  46.43 
 
 		 718 aa  97.4  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  45.54 
 
 		 719 aa  97.4  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1014  methylmalonyl-CoA mutase  46.43 
 
 		 719 aa  97.4  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.856859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2161  methylmalonyl-CoA mutase  45.54 
 
 		 723 aa  97.1  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385791  normal  0.481947 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4006  methylmalonyl-CoA mutase  45.45 
 
 		 716 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0910  methylmalonyl-CoA mutase  44.64 
 
 		 739 aa  95.5  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.736612  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1167  methylmalonyl-CoA mutase  41.41 
 
 		 712 aa  95.5  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.169366  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3008  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  44.64 
 
 		 652 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.842553  normal  0.248307 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0932  methylmalonyl-CoA mutase  44.64 
 
 		 724 aa  95.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0868  methylmalonyl-CoA mutase  44.55 
 
 		 715 aa  94.7  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>