294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3814 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3814  cobalamin B12-binding domain-containing protein  100 
 
 		 134 aa  266  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4204  cobalamin B12-binding domain-containing protein  99.25 
 
 		 134 aa  262  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6220  cobalamin B12-binding domain-containing protein  83.85 
 
 		 134 aa  208  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1242  methylmalonyl-CoA mutase  76.98 
 
 		 135 aa  202  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0059  cobalamin B12-binding domain protein  75.97 
 
 		 136 aa  197  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107152 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1989  cobalamin B12-binding domain-containing protein  71.2 
 
 		 139 aa  195  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7994  cobalamin B12-binding domain protein  71.76 
 
 		 135 aa  194  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3591  cobalamin B12-binding domain-containing protein  79.07 
 
 		 143 aa  193  6e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1574  methylmalonyl-CoA mutase-like  70.23 
 
 		 134 aa  191  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000332572  normal  0.305791 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2369  methylmalonyl-CoA mutase-like protein  68.94 
 
 		 133 aa  189  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.308524  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0377  methylmalonyl-CoA mutase-like  71.43 
 
 		 158 aa  187  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.99713  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1578  B12-binding protein  68.7 
 
 		 134 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.432317  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1541  methylmalonyl-CoA mutase, alpha subunit  67.97 
 
 		 151 aa  185  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0770461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1854  cobalamin B12-binding domain-containing protein  64.62 
 
 		 137 aa  186  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2028  cobalamin B12-binding domain protein  66.4 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1832  methylmalonyl-CoA mutase  66.4 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2098  cobalamin B12-binding domain protein  66.4 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0289  cobalamin B12-binding domain protein  64.12 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2026  cobalamin B12-binding domain-containing protein  68.25 
 
 		 134 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113125  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1673  cobalamin B12-binding domain protein  66.67 
 
 		 153 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  67.69 
 
 		 134 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000031654  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3482  cobalamin B12-binding domain-containing protein  64.62 
 
 		 134 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3774  cobalamin B12-binding domain protein  66.67 
 
 		 157 aa  180  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137195  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1574  cobalamin B12-binding domain-containing protein  67.18 
 
 		 137 aa  179  8.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0630027 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1715  cobalamin B12-binding domain protein  66.14 
 
 		 139 aa  179  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2691  cobalamin B12-binding domain protein  65.87 
 
 		 134 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0118523  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4641  cobalamin B12-binding domain protein  73.17 
 
 		 143 aa  177  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1263  cobalamin B12-binding domain protein  76.61 
 
 		 149 aa  176  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.728671  normal  0.8637 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2692  cobalamin B12-binding domain protein  63.36 
 
 		 140 aa  175  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1548  cobalamin B12-binding domain protein  65.08 
 
 		 134 aa  174  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166361 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0550  cobalamin B12-binding domain-containing protein  63.49 
 
 		 133 aa  170  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1487  cobalamin B12-binding domain protein  62.02 
 
 		 135 aa  169  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.40083  normal  0.12756 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4240  cobalamin B12-binding domain protein  57.25 
 
 		 139 aa  168  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1769  cobalamin B12-binding domain-containing protein  63.49 
 
 		 134 aa  168  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00734137  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0587  cobalamin B12-binding domain protein  60.9 
 
 		 135 aa  167  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.901029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1910  cobalamin B12-binding domain protein  62.7 
 
 		 134 aa  166  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.374857  normal  0.0962097 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0582  cobalamin B12-binding domain-containing protein  59.06 
 
 		 133 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3987  cobalamin B12-binding domain-containing protein  60.15 
 
 		 137 aa  163  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195294  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2024  cobalamin B12-binding domain-containing protein  60.77 
 
 		 134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000794891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0241  cobalamin B12-binding domain protein  61.6 
 
 		 139 aa  159  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1432  methylmalonyl-CoA mutase  58.73 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.329321 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2998  cobalamin B12-binding domain-containing protein  59.23 
 
 		 134 aa  157  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.651513  normal  0.0337584 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0457  cobalamin B12-binding domain-containing protein  55.04 
 
 		 133 aa  155  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.364165 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1322  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.25 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0318  cobalamin B12-binding domain protein  62.1 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0081  cobalamin B12-binding domain protein  55.56 
 
 		 141 aa  154  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2055  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.48 
 
 		 155 aa  151  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1359  cobalamin B12-binding domain protein  59.35 
 
 		 128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000160657  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0510  cobalamin B12-binding domain protein  53.91 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  0.90311 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2805  cobalamin B12-binding domain protein  54.76 
 
 		 142 aa  145  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.069341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4360  cobalamin B12-binding domain protein  53.91 
 
 		 138 aa  144  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.36975  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2472  cobalamin B12-binding domain protein  53.12 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5018  cobalamin B12-binding domain-containing protein  50.38 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0538  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  53.17 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000893241 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3654  cobalamin B12-binding domain-containing protein  52.03 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.136466 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0900  cobalamin B12-binding domain protein  52.34 
 
 		 138 aa  141  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5088  cobalamin B12-binding domain-containing protein  52.71 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3825  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  57.38 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438631  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3899  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.38 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3811  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.38 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0469463  normal  0.0948206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4309  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.02 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  47.69 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0044288 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3836  cobalamin B12-binding domain protein  50.78 
 
 		 138 aa  130  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.692162  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.02 
 
 		 133 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.698998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2128  cobalamin B12-binding domain-containing protein  49.24 
 
 		 172 aa  127  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4260  cobalamin B12-binding domain-containing protein  56.56 
 
 		 133 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1772  methylmalonyl-CoA mutase  50.38 
 
 		 680 aa  115  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.292142  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1771  cobalamin B12-binding domain-containing protein  44.8 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.379199  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2169  methylmalonyl-CoA mutase  52.73 
 
 		 692 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.485789  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4193  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  50 
 
 		 670 aa  108  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.669168  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1034  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  50 
 
 		 666 aa  107  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.488774  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2855  methylmalonyl-CoA mutase  44.74 
 
 		 657 aa  107  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1164  methylmalonyl-CoA mutase  50 
 
 		 713 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197015  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4003  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  50.44 
 
 		 685 aa  106  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.446619  hitchhiker  0.000372138 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3621  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  51.35 
 
 		 668 aa  106  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2208  methylmalonyl-CoA mutase-like  36.92 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000192903  normal  0.0126749 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3875  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  43.86 
 
 		 688 aa  104  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1197  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  45.95 
 
 		 657 aa  103  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3062  methylmalonyl-CoA mutase  46.49 
 
 		 671 aa  103  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0875  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  47.32 
 
 		 1081 aa  103  8e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.036821 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  47.32 
 
 		 1106 aa  103  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  45.31 
 
 		 709 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  45.31 
 
 		 709 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2697  methylmalonyl-CoA mutase  43.61 
 
 		 720 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.20812 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1167  methylmalonyl-CoA mutase  45.54 
 
 		 712 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.169366  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0388  methylmalonyl-CoA mutase  45 
 
 		 714 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  44.27 
 
 		 722 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1226  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  50.88 
 
 		 672 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6728  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  43.51 
 
 		 738 aa  101  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  44.53 
 
 		 709 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3008  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  46.43 
 
 		 652 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.842553  normal  0.248307 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1292  methylmalonyl-CoA mutase  47.32 
 
 		 714 aa  100  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0797  methylmalonyl-CoA mutase  44.74 
 
 		 654 aa  100  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4373  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  43.75 
 
 		 735 aa  100  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  41.48 
 
 		 720 aa  100  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  41.48 
 
 		 720 aa  100  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3260  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  46.43 
 
 		 713 aa  99.8  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1625  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  43.86 
 
 		 667 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6511  methylmalonyl-CoA mutase  44.44 
 
 		 712 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  45.54 
 
 		 714 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>