255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0958 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  100 
 
 		 140 aa  279  1e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0044288 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4240  cobalamin B12-binding domain protein  54.14 
 
 		 139 aa  149  8.999999999999999e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1854  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53.44 
 
 		 137 aa  144  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1910  cobalamin B12-binding domain protein  54.33 
 
 		 134 aa  143  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.374857  normal  0.0962097 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1673  cobalamin B12-binding domain protein  52.59 
 
 		 153 aa  143  9e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1769  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.33 
 
 		 134 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00734137  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1574  methylmalonyl-CoA mutase-like  54.33 
 
 		 134 aa  141  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000332572  normal  0.305791 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0510  cobalamin B12-binding domain protein  51.11 
 
 		 139 aa  140  5e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  0.90311 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1578  B12-binding protein  55.91 
 
 		 134 aa  140  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.432317  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0457  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53.97 
 
 		 133 aa  140  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.364165 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0289  cobalamin B12-binding domain protein  52.27 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1432  methylmalonyl-CoA mutase  56 
 
 		 140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.329321 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0900  cobalamin B12-binding domain protein  50.76 
 
 		 138 aa  137  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2026  cobalamin B12-binding domain-containing protein  52.76 
 
 		 134 aa  137  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113125  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0241  cobalamin B12-binding domain protein  53.44 
 
 		 139 aa  136  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2369  methylmalonyl-CoA mutase-like protein  51.97 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.308524  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0081  cobalamin B12-binding domain protein  52.8 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4360  cobalamin B12-binding domain protein  47.45 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.36975  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1487  cobalamin B12-binding domain protein  54.84 
 
 		 135 aa  133  9e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.40083  normal  0.12756 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2692  cobalamin B12-binding domain protein  53.49 
 
 		 140 aa  133  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2805  cobalamin B12-binding domain protein  50 
 
 		 142 aa  132  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.069341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4204  cobalamin B12-binding domain-containing protein  47.69 
 
 		 134 aa  132  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1548  cobalamin B12-binding domain protein  51.97 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166361 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.47 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000031654  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0587  cobalamin B12-binding domain protein  53.12 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.901029 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1989  cobalamin B12-binding domain-containing protein  52.31 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3814  cobalamin B12-binding domain-containing protein  47.69 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3836  cobalamin B12-binding domain protein  48.15 
 
 		 138 aa  130  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.692162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2691  cobalamin B12-binding domain protein  51.18 
 
 		 134 aa  130  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0118523  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3482  cobalamin B12-binding domain-containing protein  51.97 
 
 		 134 aa  130  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3774  cobalamin B12-binding domain protein  51.18 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137195  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1832  methylmalonyl-CoA mutase  51.18 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436511  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2055  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.03 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2028  cobalamin B12-binding domain protein  49.25 
 
 		 140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1715  cobalamin B12-binding domain protein  51.61 
 
 		 139 aa  127  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2472  cobalamin B12-binding domain protein  50.78 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2098  cobalamin B12-binding domain protein  49.25 
 
 		 140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1574  cobalamin B12-binding domain-containing protein  52.42 
 
 		 137 aa  126  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0630027 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0377  methylmalonyl-CoA mutase-like  48.48 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.99713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1242  methylmalonyl-CoA mutase  47.58 
 
 		 135 aa  124  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778509 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1322  cobalamin B12-binding domain-containing protein  48.41 
 
 		 136 aa  123  8.000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  52.54 
 
 		 1106 aa  122  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7994  cobalamin B12-binding domain protein  47.24 
 
 		 135 aa  123  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2024  cobalamin B12-binding domain-containing protein  50.4 
 
 		 134 aa  123  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000794891 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2998  cobalamin B12-binding domain-containing protein  50.4 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.651513  normal  0.0337584 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0059  cobalamin B12-binding domain protein  48.39 
 
 		 136 aa  121  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107152 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0582  cobalamin B12-binding domain-containing protein  50.41 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4641  cobalamin B12-binding domain protein  51.15 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3987  cobalamin B12-binding domain-containing protein  50 
 
 		 137 aa  121  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195294  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3654  cobalamin B12-binding domain-containing protein  49.24 
 
 		 135 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.136466 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0318  cobalamin B12-binding domain protein  50.81 
 
 		 162 aa  120  6e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1541  methylmalonyl-CoA mutase, alpha subunit  45.8 
 
 		 151 aa  120  7e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0770461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5088  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.63 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1359  cobalamin B12-binding domain protein  49.19 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000160657  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0550  cobalamin B12-binding domain-containing protein  49.6 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0538  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  49.59 
 
 		 136 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000893241 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  47.24 
 
 		 709 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0875  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  51.69 
 
 		 1081 aa  117  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.036821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6220  cobalamin B12-binding domain-containing protein  50 
 
 		 134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  47.2 
 
 		 709 aa  117  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  47.2 
 
 		 709 aa  117  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0388  methylmalonyl-CoA mutase  50 
 
 		 714 aa  115  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  48.28 
 
 		 714 aa  114  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  45.45 
 
 		 719 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1167  methylmalonyl-CoA mutase  49.12 
 
 		 712 aa  114  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.169366  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2161  methylmalonyl-CoA mutase  45.45 
 
 		 723 aa  114  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385791  normal  0.481947 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1292  methylmalonyl-CoA mutase  50 
 
 		 714 aa  114  6e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1223  methylmalonyl-CoA mutase  50 
 
 		 712 aa  114  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0868  methylmalonyl-CoA mutase  48.28 
 
 		 715 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2127  methylmalonyl-CoA mutase  46.22 
 
 		 720 aa  113  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.063815  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2697  methylmalonyl-CoA mutase  44.96 
 
 		 720 aa  112  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.20812 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  44.63 
 
 		 722 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3260  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  48.31 
 
 		 713 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02748  methylmalonyl-CoA mutase  47.41 
 
 		 714 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  47.41 
 
 		 714 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0793  methylmalonyl-CoA mutase  47.41 
 
 		 714 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3053  methylmalonyl-CoA mutase  47.41 
 
 		 714 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02711  hypothetical protein  47.41 
 
 		 714 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1284  methylmalonyl-CoA mutase  45.9 
 
 		 723 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811968  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3244  methylmalonyl-CoA mutase  47.41 
 
 		 714 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98625  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3398  methylmalonyl-CoA mutase  47.06 
 
 		 731 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0910  methylmalonyl-CoA mutase  46.15 
 
 		 739 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.736612  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  47.01 
 
 		 720 aa  111  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5018  cobalamin B12-binding domain-containing protein  44.62 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3681  methylmalonyl-CoA mutase  46.67 
 
 		 714 aa  111  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  47.01 
 
 		 720 aa  111  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0932  methylmalonyl-CoA mutase  46.15 
 
 		 724 aa  111  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3367  methylmalonyl-CoA mutase  43.7 
 
 		 709 aa  111  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  46.15 
 
 		 738 aa  110  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1263  cobalamin B12-binding domain protein  50 
 
 		 149 aa  110  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.728671  normal  0.8637 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1014  methylmalonyl-CoA mutase  47.01 
 
 		 719 aa  110  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.856859 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  47.41 
 
 		 714 aa  110  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1164  methylmalonyl-CoA mutase  47.41 
 
 		 713 aa  110  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197015  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2383  methylmalonyl-CoA mutase  42.98 
 
 		 718 aa  110  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3825  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  44.96 
 
 		 132 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438631  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3899  cobalamin B12-binding domain-containing protein  44.96 
 
 		 132 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3811  cobalamin B12-binding domain-containing protein  44.96 
 
 		 132 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0469463  normal  0.0948206 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2294  methylmalonyl-CoA mutase  44 
 
 		 731 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.895743  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3304  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  43.75 
 
 		 719 aa  110  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00679496  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0726  methylmalonyl-CoA mutase  47.9 
 
 		 712 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.999011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>