264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3987 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3987  cobalamin B12-binding domain-containing protein  100 
 
 		 137 aa  272  9e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195294  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0587  cobalamin B12-binding domain protein  85.38 
 
 		 135 aa  221  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.901029 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2024  cobalamin B12-binding domain-containing protein  79.69 
 
 		 134 aa  212  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000794891 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2998  cobalamin B12-binding domain-containing protein  77.1 
 
 		 134 aa  206  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.651513  normal  0.0337584 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1673  cobalamin B12-binding domain protein  75.19 
 
 		 153 aa  187  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2028  cobalamin B12-binding domain protein  66.67 
 
 		 140 aa  174  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2098  cobalamin B12-binding domain protein  65.89 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1715  cobalamin B12-binding domain protein  64.84 
 
 		 139 aa  171  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1832  methylmalonyl-CoA mutase  65.12 
 
 		 140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436511  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1574  cobalamin B12-binding domain-containing protein  62.32 
 
 		 137 aa  170  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0630027 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1989  cobalamin B12-binding domain-containing protein  63.57 
 
 		 139 aa  170  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1854  cobalamin B12-binding domain-containing protein  63.08 
 
 		 137 aa  167  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3482  cobalamin B12-binding domain-containing protein  63.57 
 
 		 134 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2026  cobalamin B12-binding domain-containing protein  61.54 
 
 		 134 aa  163  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113125  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3814  cobalamin B12-binding domain-containing protein  60.15 
 
 		 134 aa  163  8e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1574  methylmalonyl-CoA mutase-like  59.69 
 
 		 134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000332572  normal  0.305791 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2691  cobalamin B12-binding domain protein  62.02 
 
 		 134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0118523  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4240  cobalamin B12-binding domain protein  57.89 
 
 		 139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4204  cobalamin B12-binding domain-containing protein  59.4 
 
 		 134 aa  161  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1548  cobalamin B12-binding domain protein  61.24 
 
 		 134 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166361 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  60.15 
 
 		 134 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000031654  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0241  cobalamin B12-binding domain protein  61.54 
 
 		 139 aa  160  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1432  methylmalonyl-CoA mutase  61.19 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.329321 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0059  cobalamin B12-binding domain protein  63.2 
 
 		 136 aa  158  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107152 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2369  methylmalonyl-CoA mutase-like protein  60.77 
 
 		 133 aa  158  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.308524  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1487  cobalamin B12-binding domain protein  57.58 
 
 		 135 aa  157  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.40083  normal  0.12756 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1578  B12-binding protein  57.36 
 
 		 134 aa  157  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.432317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2692  cobalamin B12-binding domain protein  58.46 
 
 		 140 aa  155  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0582  cobalamin B12-binding domain-containing protein  60.94 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7994  cobalamin B12-binding domain protein  57.25 
 
 		 135 aa  154  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1242  methylmalonyl-CoA mutase  58.73 
 
 		 135 aa  153  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778509 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1541  methylmalonyl-CoA mutase, alpha subunit  59.69 
 
 		 151 aa  153  7e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0770461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0457  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.62 
 
 		 133 aa  152  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.364165 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4360  cobalamin B12-binding domain protein  59.09 
 
 		 138 aa  150  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.36975  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0550  cobalamin B12-binding domain-containing protein  63.28 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6220  cobalamin B12-binding domain-containing protein  58.52 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0289  cobalamin B12-binding domain protein  57.89 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0377  methylmalonyl-CoA mutase-like  55.38 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.99713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3591  cobalamin B12-binding domain-containing protein  60.8 
 
 		 143 aa  146  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4641  cobalamin B12-binding domain protein  62.7 
 
 		 143 aa  146  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2805  cobalamin B12-binding domain protein  60.32 
 
 		 142 aa  146  9e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.069341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3774  cobalamin B12-binding domain protein  55.47 
 
 		 157 aa  145  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137195  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1910  cobalamin B12-binding domain protein  54.26 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.374857  normal  0.0962097 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1769  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53.91 
 
 		 134 aa  144  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00734137  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0081  cobalamin B12-binding domain protein  54.76 
 
 		 141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3836  cobalamin B12-binding domain protein  59.54 
 
 		 138 aa  144  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.692162  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2472  cobalamin B12-binding domain protein  59.38 
 
 		 152 aa  143  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0900  cobalamin B12-binding domain protein  58.14 
 
 		 138 aa  143  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1322  cobalamin B12-binding domain-containing protein  56.92 
 
 		 136 aa  141  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0510  cobalamin B12-binding domain protein  55.81 
 
 		 139 aa  141  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  0.90311 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0538  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  55.12 
 
 		 136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000893241 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0318  cobalamin B12-binding domain protein  52.59 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2055  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.38 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1263  cobalamin B12-binding domain protein  61.98 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.728671  normal  0.8637 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5018  cobalamin B12-binding domain-containing protein  50 
 
 		 135 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3654  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53.23 
 
 		 135 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.136466 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1359  cobalamin B12-binding domain protein  51.59 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000160657  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.69 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.698998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4260  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.55 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3825  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  53.6 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438631  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3899  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53.6 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3811  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53.6 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0469463  normal  0.0948206 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5088  cobalamin B12-binding domain-containing protein  63.16 
 
 		 153 aa  124  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4309  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.03 
 
 		 133 aa  123  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2128  cobalamin B12-binding domain-containing protein  45.99 
 
 		 172 aa  121  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  50 
 
 		 140 aa  121  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0044288 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1164  methylmalonyl-CoA mutase  56.52 
 
 		 713 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197015  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  49.63 
 
 		 1106 aa  114  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1772  methylmalonyl-CoA mutase  53.15 
 
 		 680 aa  114  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.292142  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1292  methylmalonyl-CoA mutase  53.04 
 
 		 714 aa  113  8.999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1167  methylmalonyl-CoA mutase  52.17 
 
 		 712 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.169366  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6098  methylmalonyl-CoA mutase  45.74 
 
 		 712 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23929  normal  0.554736 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0868  methylmalonyl-CoA mutase  53.91 
 
 		 715 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1223  methylmalonyl-CoA mutase  50.43 
 
 		 712 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6511  methylmalonyl-CoA mutase  45.04 
 
 		 712 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1226  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  47.69 
 
 		 672 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6728  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0388  methylmalonyl-CoA mutase  50.86 
 
 		 714 aa  107  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1034  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  48 
 
 		 666 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.488774  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4003  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  47.62 
 
 		 685 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.446619  hitchhiker  0.000372138 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2891  methylmalonyl-CoA mutase  48.28 
 
 		 716 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2169  methylmalonyl-CoA mutase  48.67 
 
 		 692 aa  105  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.485789  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1221  methylmalonyl-CoA mutase  48.31 
 
 		 715 aa  104  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.584735  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1190  methylmalonyl-CoA mutase  43.41 
 
 		 712 aa  104  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.942727  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  43.51 
 
 		 714 aa  104  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  46.15 
 
 		 709 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3621  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  49.55 
 
 		 668 aa  103  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4193  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  50.44 
 
 		 670 aa  103  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.669168  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3062  methylmalonyl-CoA mutase  49.56 
 
 		 671 aa  103  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2294  methylmalonyl-CoA mutase  49.57 
 
 		 731 aa  103  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.895743  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0545  methylmalonyl-CoA mutase  50.43 
 
 		 740 aa  102  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1197  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  50.44 
 
 		 657 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3872  methylmalonyl-CoA mutase  50.43 
 
 		 740 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.231489  normal  0.125312 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02748  methylmalonyl-CoA mutase  42.75 
 
 		 714 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  42.75 
 
 		 714 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1625  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  47.79 
 
 		 667 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3244  methylmalonyl-CoA mutase  42.75 
 
 		 714 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98625  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3053  methylmalonyl-CoA mutase  42.75 
 
 		 714 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1320  methylmalonyl-CoA mutase  50.43 
 
 		 722 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0793  methylmalonyl-CoA mutase  42.75 
 
 		 714 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02711  hypothetical protein  42.75 
 
 		 714 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>