296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0318 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0318  cobalamin B12-binding domain protein  100 
 
 		 162 aa  314  4e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3774  cobalamin B12-binding domain protein  57.46 
 
 		 157 aa  163  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137195  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2369  methylmalonyl-CoA mutase-like protein  62.6 
 
 		 133 aa  159  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.308524  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1673  cobalamin B12-binding domain protein  59.69 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1578  B12-binding protein  57.69 
 
 		 134 aa  156  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.432317  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1832  methylmalonyl-CoA mutase  56.15 
 
 		 140 aa  156  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7994  cobalamin B12-binding domain protein  59.52 
 
 		 135 aa  156  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0289  cobalamin B12-binding domain protein  57.78 
 
 		 140 aa  156  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1989  cobalamin B12-binding domain-containing protein  58.46 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4204  cobalamin B12-binding domain-containing protein  62.1 
 
 		 134 aa  155  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1487  cobalamin B12-binding domain protein  59.09 
 
 		 135 aa  155  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.40083  normal  0.12756 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3814  cobalamin B12-binding domain-containing protein  62.1 
 
 		 134 aa  155  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4641  cobalamin B12-binding domain protein  67.48 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2028  cobalamin B12-binding domain protein  55.38 
 
 		 140 aa  153  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  56.92 
 
 		 134 aa  153  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000031654  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0081  cobalamin B12-binding domain protein  59.06 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2098  cobalamin B12-binding domain protein  55.38 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1854  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53.85 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1242  methylmalonyl-CoA mutase  58.27 
 
 		 135 aa  150  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778509 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2055  cobalamin B12-binding domain-containing protein  64.66 
 
 		 155 aa  150  5.9999999999999996e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1548  cobalamin B12-binding domain protein  56.91 
 
 		 134 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166361 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2691  cobalamin B12-binding domain protein  56.91 
 
 		 134 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0118523  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0377  methylmalonyl-CoA mutase-like  54.81 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.99713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1910  cobalamin B12-binding domain protein  52.31 
 
 		 134 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.374857  normal  0.0962097 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4240  cobalamin B12-binding domain protein  53.85 
 
 		 139 aa  149  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2026  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53.85 
 
 		 134 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3482  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53.08 
 
 		 134 aa  148  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1769  cobalamin B12-binding domain-containing protein  52.67 
 
 		 134 aa  148  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00734137  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1574  methylmalonyl-CoA mutase-like  54.62 
 
 		 134 aa  148  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000332572  normal  0.305791 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1541  methylmalonyl-CoA mutase, alpha subunit  56.92 
 
 		 151 aa  147  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0770461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3591  cobalamin B12-binding domain-containing protein  64.17 
 
 		 143 aa  147  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1432  methylmalonyl-CoA mutase  56.69 
 
 		 140 aa  147  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.329321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0241  cobalamin B12-binding domain protein  58.54 
 
 		 139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2692  cobalamin B12-binding domain protein  51.94 
 
 		 140 aa  145  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6220  cobalamin B12-binding domain-containing protein  62.9 
 
 		 134 aa  144  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0059  cobalamin B12-binding domain protein  57.26 
 
 		 136 aa  144  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107152 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2998  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.96 
 
 		 134 aa  143  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.651513  normal  0.0337584 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0587  cobalamin B12-binding domain protein  58.14 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.901029 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2024  cobalamin B12-binding domain-containing protein  55.22 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000794891 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2805  cobalamin B12-binding domain protein  52.31 
 
 		 142 aa  140  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.069341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0510  cobalamin B12-binding domain protein  53.44 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  0.90311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  55.38 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.698998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0900  cobalamin B12-binding domain protein  52.34 
 
 		 138 aa  137  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1715  cobalamin B12-binding domain protein  57.26 
 
 		 139 aa  137  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1574  cobalamin B12-binding domain-containing protein  55.38 
 
 		 137 aa  136  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0630027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3987  cobalamin B12-binding domain-containing protein  52.59 
 
 		 137 aa  136  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195294  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4260  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.62 
 
 		 133 aa  136  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3825  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  58.33 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438631  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3899  cobalamin B12-binding domain-containing protein  58.33 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3811  cobalamin B12-binding domain-containing protein  58.33 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0469463  normal  0.0948206 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2472  cobalamin B12-binding domain protein  51.91 
 
 		 152 aa  134  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4309  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.84 
 
 		 133 aa  134  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0550  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53.72 
 
 		 133 aa  134  7.000000000000001e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3836  cobalamin B12-binding domain protein  50.38 
 
 		 138 aa  134  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.692162  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1322  cobalamin B12-binding domain-containing protein  52.07 
 
 		 136 aa  133  9e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0457  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.55 
 
 		 133 aa  133  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.364165 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0582  cobalamin B12-binding domain-containing protein  51.22 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1263  cobalamin B12-binding domain protein  63.03 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.728671  normal  0.8637 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4360  cobalamin B12-binding domain protein  50.78 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.36975  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1359  cobalamin B12-binding domain protein  52.54 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000160657  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5018  cobalamin B12-binding domain-containing protein  50 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0538  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  51.18 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000893241 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5088  cobalamin B12-binding domain-containing protein  52.76 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  50.81 
 
 		 140 aa  120  8e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0044288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2169  methylmalonyl-CoA mutase  48.44 
 
 		 692 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.485789  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1772  methylmalonyl-CoA mutase  53.85 
 
 		 680 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.292142  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1034  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  52.5 
 
 		 666 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.488774  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2128  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.55 
 
 		 172 aa  114  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4003  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  52.14 
 
 		 685 aa  114  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.446619  hitchhiker  0.000372138 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  46.61 
 
 		 1106 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3654  cobalamin B12-binding domain-containing protein  46.34 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.136466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3621  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  53.21 
 
 		 668 aa  112  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3875  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  46.77 
 
 		 688 aa  111  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0726  methylmalonyl-CoA mutase  45.76 
 
 		 712 aa  107  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.999011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4193  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  46.77 
 
 		 670 aa  107  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.669168  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3062  methylmalonyl-CoA mutase  46.09 
 
 		 671 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1164  methylmalonyl-CoA mutase  46.61 
 
 		 713 aa  107  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197015  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2479  methylmalonyl-CoA mutase  43.08 
 
 		 732 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0388  methylmalonyl-CoA mutase  48.31 
 
 		 714 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4573  methylmalonyl-CoA mutase  46.15 
 
 		 720 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  46.55 
 
 		 720 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3042  methylmalonyl-CoA mutase  46.15 
 
 		 720 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.057217 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  46.55 
 
 		 720 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4373  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  46.92 
 
 		 735 aa  105  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3122  methylmalonyl-CoA mutase  44.62 
 
 		 760 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.203405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3183  methylmalonyl-CoA mutase  44.62 
 
 		 760 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0724467 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  46.55 
 
 		 722 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3133  methylmalonyl-CoA mutase  44.62 
 
 		 760 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  43.97 
 
 		 709 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1223  methylmalonyl-CoA mutase  44.07 
 
 		 712 aa  104  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3106  methylmalonyl-CoA mutase  44.74 
 
 		 661 aa  104  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3398  methylmalonyl-CoA mutase  47.41 
 
 		 731 aa  105  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4006  methylmalonyl-CoA mutase  41.73 
 
 		 716 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2638  methylmalonyl-CoA mutase  43.85 
 
 		 720 aa  104  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  43.97 
 
 		 709 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0875  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  44.92 
 
 		 1081 aa  103  7e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.036821 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2762  methylmalonyl-CoA mutase  47.69 
 
 		 740 aa  103  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3188  Methylmalonyl-CoA mutase  46.46 
 
 		 725 aa  103  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.36577  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5337  methylmalonyl-CoA mutase  45.38 
 
 		 721 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.759699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1927  methylmalonyl-CoA mutase  42.31 
 
 		 719 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.273596  normal  0.727114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>