283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6220 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6220  cobalamin B12-binding domain-containing protein  100 
 
 
134 aa  264  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4204  cobalamin B12-binding domain-containing protein  83.85 
 
 
134 aa  221  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3814  cobalamin B12-binding domain-containing protein  83.85 
 
 
134 aa  221  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1989  cobalamin B12-binding domain-containing protein  70.31 
 
 
139 aa  192  9e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2028  cobalamin B12-binding domain protein  67.19 
 
 
140 aa  191  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1242  methylmalonyl-CoA mutase  73.02 
 
 
135 aa  190  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00778509 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1832  methylmalonyl-CoA mutase  67.19 
 
 
140 aa  190  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2098  cobalamin B12-binding domain protein  67.19 
 
 
140 aa  189  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0059  cobalamin B12-binding domain protein  75 
 
 
136 aa  188  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107152 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1574  methylmalonyl-CoA mutase-like  68.99 
 
 
134 aa  187  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000332572  normal  0.305791 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1673  cobalamin B12-binding domain protein  66.41 
 
 
153 aa  187  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  69.53 
 
 
134 aa  185  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000031654  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1541  methylmalonyl-CoA mutase, alpha subunit  67.69 
 
 
151 aa  184  4e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0770461  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1578  B12-binding protein  67.44 
 
 
134 aa  184  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.432317  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7994  cobalamin B12-binding domain protein  69.05 
 
 
135 aa  183  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3774  cobalamin B12-binding domain protein  67.46 
 
 
157 aa  183  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137195  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1854  cobalamin B12-binding domain-containing protein  66.41 
 
 
137 aa  183  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2369  methylmalonyl-CoA mutase-like protein  67.44 
 
 
133 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.308524  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1715  cobalamin B12-binding domain protein  68 
 
 
139 aa  181  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2026  cobalamin B12-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
134 aa  181  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113125  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2691  cobalamin B12-binding domain protein  66.67 
 
 
134 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0118523  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0289  cobalamin B12-binding domain protein  64.62 
 
 
140 aa  180  6e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1574  cobalamin B12-binding domain-containing protein  69.6 
 
 
137 aa  180  6e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0630027 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3482  cobalamin B12-binding domain-containing protein  64.06 
 
 
134 aa  179  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0377  methylmalonyl-CoA mutase-like  65.38 
 
 
158 aa  179  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.99713  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3591  cobalamin B12-binding domain-containing protein  75.59 
 
 
143 aa  178  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1548  cobalamin B12-binding domain protein  65.12 
 
 
134 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166361 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1487  cobalamin B12-binding domain protein  63.57 
 
 
135 aa  176  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.40083  normal  0.12756 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1769  cobalamin B12-binding domain-containing protein  64.57 
 
 
134 aa  176  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00734137  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2692  cobalamin B12-binding domain protein  63.85 
 
 
140 aa  174  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1263  cobalamin B12-binding domain protein  76.61 
 
 
149 aa  174  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.728671  normal  0.8637 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1910  cobalamin B12-binding domain protein  62.79 
 
 
134 aa  173  9e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.374857  normal  0.0962097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0587  cobalamin B12-binding domain protein  63.85 
 
 
135 aa  171  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.901029 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4641  cobalamin B12-binding domain protein  66.92 
 
 
143 aa  166  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0550  cobalamin B12-binding domain-containing protein  63.2 
 
 
133 aa  163  6.9999999999999995e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0081  cobalamin B12-binding domain protein  62.6 
 
 
141 aa  161  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0241  cobalamin B12-binding domain protein  58.02 
 
 
139 aa  161  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4240  cobalamin B12-binding domain protein  58.59 
 
 
139 aa  161  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3987  cobalamin B12-binding domain-containing protein  58.52 
 
 
137 aa  160  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195294  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2055  cobalamin B12-binding domain-containing protein  60.31 
 
 
155 aa  159  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1432  methylmalonyl-CoA mutase  58.59 
 
 
140 aa  158  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.329321 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2998  cobalamin B12-binding domain-containing protein  59.09 
 
 
134 aa  157  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.651513  normal  0.0337584 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2024  cobalamin B12-binding domain-containing protein  59.09 
 
 
134 aa  156  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000794891 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0318  cobalamin B12-binding domain protein  62.9 
 
 
162 aa  154  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0582  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.6 
 
 
133 aa  154  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0457  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.36 
 
 
133 aa  154  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.364165 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5018  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.72 
 
 
135 aa  147  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622944  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1322  cobalamin B12-binding domain-containing protein  55.81 
 
 
136 aa  144  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1359  cobalamin B12-binding domain protein  57.94 
 
 
128 aa  144  5e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000160657  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0538  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  54.76 
 
 
136 aa  143  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000893241 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3654  cobalamin B12-binding domain-containing protein  50 
 
 
135 aa  140  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.136466 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2805  cobalamin B12-binding domain protein  52.76 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.069341  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4360  cobalamin B12-binding domain protein  53.91 
 
 
138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.36975  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2472  cobalamin B12-binding domain protein  53.6 
 
 
152 aa  137  7e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0900  cobalamin B12-binding domain protein  52.34 
 
 
138 aa  136  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5088  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.1 
 
 
153 aa  133  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0510  cobalamin B12-binding domain protein  51.91 
 
 
139 aa  133  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  0.90311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3825  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  58.33 
 
 
132 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438631  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3899  cobalamin B12-binding domain-containing protein  58.33 
 
 
132 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3811  cobalamin B12-binding domain-containing protein  58.33 
 
 
132 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0469463  normal  0.0948206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4309  cobalamin B12-binding domain-containing protein  56.35 
 
 
133 aa  130  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2128  cobalamin B12-binding domain-containing protein  55.28 
 
 
172 aa  130  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1772  methylmalonyl-CoA mutase  58.56 
 
 
680 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.292142  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3836  cobalamin B12-binding domain protein  51.59 
 
 
138 aa  128  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.692162  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  56.56 
 
 
133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.698998  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  50 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0044288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4260  cobalamin B12-binding domain-containing protein  55.28 
 
 
133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1034  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  55.86 
 
 
666 aa  117  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.488774  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3875  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  50.45 
 
 
688 aa  117  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2169  methylmalonyl-CoA mutase  56.36 
 
 
692 aa  117  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.485789  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0797  methylmalonyl-CoA mutase  53.15 
 
 
654 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1197  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  51.35 
 
 
657 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282186  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4193  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  53.15 
 
 
670 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.669168  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3062  methylmalonyl-CoA mutase  51.35 
 
 
671 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  50 
 
 
1106 aa  111  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2855  methylmalonyl-CoA mutase  47.75 
 
 
657 aa  110  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4373  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  48.21 
 
 
735 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3106  methylmalonyl-CoA mutase  42.42 
 
 
661 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2127  methylmalonyl-CoA mutase  45.8 
 
 
720 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.063815  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3008  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  50 
 
 
652 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.842553  normal  0.248307 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1625  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  47.75 
 
 
667 aa  107  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2161  methylmalonyl-CoA mutase  45.38 
 
 
723 aa  107  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385791  normal  0.481947 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1164  methylmalonyl-CoA mutase  50 
 
 
713 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197015  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3621  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  53.15 
 
 
668 aa  107  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1226  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  56.76 
 
 
672 aa  106  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6728  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0875  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  49.11 
 
 
1081 aa  106  9.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.036821 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4003  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  52.25 
 
 
685 aa  106  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.446619  hitchhiker  0.000372138 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2697  methylmalonyl-CoA mutase  45.04 
 
 
720 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.20812 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0961  methylmalonyl-CoA mutase  50.89 
 
 
652 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1223  methylmalonyl-CoA mutase  47.32 
 
 
712 aa  105  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  50.89 
 
 
738 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  49.11 
 
 
719 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6511  methylmalonyl-CoA mutase  47.86 
 
 
712 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  49.11 
 
 
722 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  50 
 
 
720 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  50 
 
 
720 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2621  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  50.89 
 
 
652 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4128  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  55.86 
 
 
667 aa  104  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2383  methylmalonyl-CoA mutase  44.53 
 
 
718 aa  104  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1292  methylmalonyl-CoA mutase  48.21 
 
 
714 aa  104  5e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.816153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>