More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1673 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1673  cobalamin B12-binding domain protein  100 
 
 		 153 aa  306  6.999999999999999e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1854  cobalamin B12-binding domain-containing protein  76.92 
 
 		 137 aa  206  8e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0587  cobalamin B12-binding domain protein  76.69 
 
 		 135 aa  201  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.901029 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1832  methylmalonyl-CoA mutase  69.47 
 
 		 140 aa  192  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436511  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2028  cobalamin B12-binding domain protein  68.7 
 
 		 140 aa  191  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2098  cobalamin B12-binding domain protein  68.7 
 
 		 140 aa  191  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1574  cobalamin B12-binding domain-containing protein  72 
 
 		 137 aa  191  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0630027 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1715  cobalamin B12-binding domain protein  71.2 
 
 		 139 aa  189  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2998  cobalamin B12-binding domain-containing protein  72.87 
 
 		 134 aa  187  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.651513  normal  0.0337584 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1432  methylmalonyl-CoA mutase  69.53 
 
 		 140 aa  188  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.329321 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3987  cobalamin B12-binding domain-containing protein  75.19 
 
 		 137 aa  187  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195294  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2024  cobalamin B12-binding domain-containing protein  72.87 
 
 		 134 aa  187  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000794891 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1989  cobalamin B12-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 139 aa  185  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1541  methylmalonyl-CoA mutase, alpha subunit  63.31 
 
 		 151 aa  183  8e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0770461  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0081  cobalamin B12-binding domain protein  64.44 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2369  methylmalonyl-CoA mutase-like protein  66.41 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.308524  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4240  cobalamin B12-binding domain protein  66.15 
 
 		 139 aa  181  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3814  cobalamin B12-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 134 aa  181  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0241  cobalamin B12-binding domain protein  67.44 
 
 		 139 aa  179  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4204  cobalamin B12-binding domain-containing protein  65.87 
 
 		 134 aa  179  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2055  cobalamin B12-binding domain-containing protein  65.15 
 
 		 155 aa  179  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0582  cobalamin B12-binding domain-containing protein  70.4 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0457  cobalamin B12-binding domain-containing protein  61.54 
 
 		 133 aa  178  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.364165 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  65.62 
 
 		 134 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000031654  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2026  cobalamin B12-binding domain-containing protein  64.34 
 
 		 134 aa  177  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113125  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2691  cobalamin B12-binding domain protein  65.12 
 
 		 134 aa  176  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0118523  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0377  methylmalonyl-CoA mutase-like  60.15 
 
 		 158 aa  176  9e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.99713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1487  cobalamin B12-binding domain protein  64.57 
 
 		 135 aa  176  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.40083  normal  0.12756 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1578  B12-binding protein  61.72 
 
 		 134 aa  175  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.432317  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0059  cobalamin B12-binding domain protein  65.32 
 
 		 136 aa  175  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107152 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0550  cobalamin B12-binding domain-containing protein  71.54 
 
 		 133 aa  174  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1769  cobalamin B12-binding domain-containing protein  62.99 
 
 		 134 aa  174  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00734137  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6220  cobalamin B12-binding domain-containing protein  66.41 
 
 		 134 aa  174  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1574  methylmalonyl-CoA mutase-like  62.5 
 
 		 134 aa  174  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000332572  normal  0.305791 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1548  cobalamin B12-binding domain protein  64.34 
 
 		 134 aa  174  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166361 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1910  cobalamin B12-binding domain protein  61.24 
 
 		 134 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.374857  normal  0.0962097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1242  methylmalonyl-CoA mutase  64.29 
 
 		 135 aa  172  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3774  cobalamin B12-binding domain protein  58.33 
 
 		 157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137195  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2692  cobalamin B12-binding domain protein  62.04 
 
 		 140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0289  cobalamin B12-binding domain protein  62.88 
 
 		 140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7994  cobalamin B12-binding domain protein  61.54 
 
 		 135 aa  171  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3482  cobalamin B12-binding domain-containing protein  63.28 
 
 		 134 aa  170  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4360  cobalamin B12-binding domain protein  65.38 
 
 		 138 aa  169  9e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.36975  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4641  cobalamin B12-binding domain protein  63.91 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2472  cobalamin B12-binding domain protein  64.8 
 
 		 152 aa  167  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1322  cobalamin B12-binding domain-containing protein  65.35 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0900  cobalamin B12-binding domain protein  62.79 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2805  cobalamin B12-binding domain protein  58.09 
 
 		 142 aa  165  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.069341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1359  cobalamin B12-binding domain protein  62.99 
 
 		 128 aa  161  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000160657  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0510  cobalamin B12-binding domain protein  59.54 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  0.90311 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0318  cobalamin B12-binding domain protein  59.69 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3591  cobalamin B12-binding domain-containing protein  64.75 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3836  cobalamin B12-binding domain protein  58.78 
 
 		 138 aa  154  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.692162  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1263  cobalamin B12-binding domain protein  64.23 
 
 		 149 aa  150  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.728671  normal  0.8637 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3654  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.33 
 
 		 135 aa  147  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.136466 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5018  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.02 
 
 		 135 aa  146  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4309  cobalamin B12-binding domain-containing protein  58.73 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5088  cobalamin B12-binding domain-containing protein  65.74 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0538  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  56 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000893241 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  52.59 
 
 		 140 aa  143  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0044288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  59.02 
 
 		 133 aa  140  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.698998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3825  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  59.5 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438631  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3899  cobalamin B12-binding domain-containing protein  59.5 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4260  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.72 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3811  cobalamin B12-binding domain-containing protein  59.5 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0469463  normal  0.0948206 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2128  cobalamin B12-binding domain-containing protein  51.13 
 
 		 172 aa  138  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1772  methylmalonyl-CoA mutase  54.26 
 
 		 680 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.292142  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1034  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  48.85 
 
 		 666 aa  124  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.488774  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  47.01 
 
 		 714 aa  122  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1167  methylmalonyl-CoA mutase  52.14 
 
 		 712 aa  122  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.169366  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2697  methylmalonyl-CoA mutase  47.69 
 
 		 720 aa  121  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.20812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2127  methylmalonyl-CoA mutase  46.27 
 
 		 720 aa  121  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.063815  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1320  methylmalonyl-CoA mutase  50 
 
 		 722 aa  121  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1197  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  53.57 
 
 		 657 aa  120  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282186  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02748  methylmalonyl-CoA mutase  46.27 
 
 		 714 aa  120  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3053  methylmalonyl-CoA mutase  46.27 
 
 		 714 aa  120  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4193  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  54.05 
 
 		 670 aa  120  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.669168  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02711  hypothetical protein  46.27 
 
 		 714 aa  120  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0793  methylmalonyl-CoA mutase  46.27 
 
 		 714 aa  120  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  46.27 
 
 		 714 aa  120  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  51.28 
 
 		 1106 aa  120  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3244  methylmalonyl-CoA mutase  46.27 
 
 		 714 aa  120  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98625  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1292  methylmalonyl-CoA mutase  53.1 
 
 		 714 aa  120  9e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2891  methylmalonyl-CoA mutase  51.33 
 
 		 716 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2192  methylmalonyl-CoA mutase  46.76 
 
 		 709 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172259  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2161  methylmalonyl-CoA mutase  45.52 
 
 		 723 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385791  normal  0.481947 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1164  methylmalonyl-CoA mutase  52.99 
 
 		 713 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197015  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0867  methylmalonyl-CoA mutase  46.76 
 
 		 709 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1625  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  50.45 
 
 		 667 aa  118  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0388  methylmalonyl-CoA mutase  53.91 
 
 		 714 aa  119  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  45.8 
 
 		 722 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2300  methylmalonyl-CoA mutase  48.03 
 
 		 709 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  45.52 
 
 		 714 aa  118  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  46.46 
 
 		 738 aa  118  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3681  methylmalonyl-CoA mutase  47.66 
 
 		 714 aa  118  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  45.04 
 
 		 719 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0932  methylmalonyl-CoA mutase  46.92 
 
 		 724 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  45.67 
 
 		 720 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  45.67 
 
 		 720 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0868  methylmalonyl-CoA mutase  52.21 
 
 		 715 aa  117  6e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>