More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2055 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2055  cobalamin B12-binding domain-containing protein  100 
 
 		 155 aa  302  1.0000000000000001e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0081  cobalamin B12-binding domain protein  78.72 
 
 		 141 aa  226  1e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1673  cobalamin B12-binding domain protein  65.15 
 
 		 153 aa  179  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2369  methylmalonyl-CoA mutase-like protein  64.57 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.308524  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1854  cobalamin B12-binding domain-containing protein  63.64 
 
 		 137 aa  167  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1574  cobalamin B12-binding domain-containing protein  63.41 
 
 		 137 aa  161  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0630027 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0550  cobalamin B12-binding domain-containing protein  60.15 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0289  cobalamin B12-binding domain protein  60.9 
 
 		 140 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4240  cobalamin B12-binding domain protein  56.3 
 
 		 139 aa  160  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1715  cobalamin B12-binding domain protein  57.58 
 
 		 139 aa  158  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1487  cobalamin B12-binding domain protein  61.72 
 
 		 135 aa  157  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.40083  normal  0.12756 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2691  cobalamin B12-binding domain protein  61.48 
 
 		 134 aa  156  9e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0118523  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1578  B12-binding protein  57.14 
 
 		 134 aa  156  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.432317  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0241  cobalamin B12-binding domain protein  54.01 
 
 		 139 aa  155  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.94 
 
 		 134 aa  155  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000031654  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1548  cobalamin B12-binding domain protein  60.66 
 
 		 134 aa  154  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166361 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1574  methylmalonyl-CoA mutase-like  57.94 
 
 		 134 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000332572  normal  0.305791 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2026  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.94 
 
 		 134 aa  153  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113125  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0582  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.62 
 
 		 133 aa  153  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7994  cobalamin B12-binding domain protein  59.84 
 
 		 135 aa  152  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1541  methylmalonyl-CoA mutase, alpha subunit  53.24 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0770461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1242  methylmalonyl-CoA mutase  58.91 
 
 		 135 aa  152  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4204  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.48 
 
 		 134 aa  152  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3814  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.48 
 
 		 134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0318  cobalamin B12-binding domain protein  64.66 
 
 		 162 aa  150  5e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1432  methylmalonyl-CoA mutase  62.5 
 
 		 140 aa  150  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.329321 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3482  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.69 
 
 		 134 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4641  cobalamin B12-binding domain protein  62.7 
 
 		 143 aa  149  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1832  methylmalonyl-CoA mutase  54.84 
 
 		 140 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436511  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0377  methylmalonyl-CoA mutase-like  51.85 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.99713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3774  cobalamin B12-binding domain protein  57.98 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137195  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1989  cobalamin B12-binding domain-containing protein  60 
 
 		 139 aa  147  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2028  cobalamin B12-binding domain protein  54.03 
 
 		 140 aa  147  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0587  cobalamin B12-binding domain protein  56.3 
 
 		 135 aa  147  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.901029 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1359  cobalamin B12-binding domain protein  57.14 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000160657  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1322  cobalamin B12-binding domain-containing protein  52.99 
 
 		 136 aa  147  5e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2098  cobalamin B12-binding domain protein  54.03 
 
 		 140 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6220  cobalamin B12-binding domain-containing protein  60.31 
 
 		 134 aa  147  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2024  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.89 
 
 		 134 aa  146  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000794891 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2998  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.89 
 
 		 134 aa  146  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.651513  normal  0.0337584 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0457  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.89 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.364165 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0510  cobalamin B12-binding domain protein  57.98 
 
 		 139 aa  144  6e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  0.90311 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3591  cobalamin B12-binding domain-containing protein  59.68 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0900  cobalamin B12-binding domain protein  56.49 
 
 		 138 aa  142  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4360  cobalamin B12-binding domain protein  54.96 
 
 		 138 aa  141  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.36975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1910  cobalamin B12-binding domain protein  49.61 
 
 		 134 aa  141  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.374857  normal  0.0962097 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2472  cobalamin B12-binding domain protein  54.96 
 
 		 152 aa  140  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2805  cobalamin B12-binding domain protein  49.62 
 
 		 142 aa  140  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.069341  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0059  cobalamin B12-binding domain protein  54.1 
 
 		 136 aa  140  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107152 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3836  cobalamin B12-binding domain protein  57.94 
 
 		 138 aa  140  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.692162  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4309  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.76 
 
 		 133 aa  140  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1769  cobalamin B12-binding domain-containing protein  50 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00734137  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2692  cobalamin B12-binding domain protein  53.79 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3987  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.38 
 
 		 137 aa  135  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195294  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5018  cobalamin B12-binding domain-containing protein  48.48 
 
 		 135 aa  134  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3825  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  55.28 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438631  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4373  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  49.24 
 
 		 735 aa  132  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3899  cobalamin B12-binding domain-containing protein  55.28 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3811  cobalamin B12-binding domain-containing protein  55.28 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0469463  normal  0.0948206 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3654  cobalamin B12-binding domain-containing protein  48.48 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.136466 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0538  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  49.22 
 
 		 136 aa  130  9e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000893241 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.03 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0044288 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5088  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.27 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4193  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  47.79 
 
 		 670 aa  128  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.669168  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4260  cobalamin B12-binding domain-containing protein  52.42 
 
 		 133 aa  128  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  52.85 
 
 		 133 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.698998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1263  cobalamin B12-binding domain protein  57.63 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.728671  normal  0.8637 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1034  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  42.18 
 
 		 666 aa  122  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.488774  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  47.62 
 
 		 1106 aa  120  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1772  methylmalonyl-CoA mutase  47.93 
 
 		 680 aa  120  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.292142  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2294  methylmalonyl-CoA mutase  48 
 
 		 731 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.895743  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0279  methylmalonyl-CoA mutase  47.97 
 
 		 731 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  46.09 
 
 		 714 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1197  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  50.89 
 
 		 657 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  45.31 
 
 		 714 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2199  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  45.74 
 
 		 727 aa  117  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  45.31 
 
 		 714 aa  116  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3244  methylmalonyl-CoA mutase  45.31 
 
 		 714 aa  116  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98625  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02748  methylmalonyl-CoA mutase  45.31 
 
 		 714 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2479  methylmalonyl-CoA mutase  45 
 
 		 732 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0793  methylmalonyl-CoA mutase  45.31 
 
 		 714 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02711  hypothetical protein  45.31 
 
 		 714 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3053  methylmalonyl-CoA mutase  45.31 
 
 		 714 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0875  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  47.5 
 
 		 1081 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.036821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3188  Methylmalonyl-CoA mutase  46.77 
 
 		 725 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.36577  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3062  methylmalonyl-CoA mutase  45.53 
 
 		 671 aa  115  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6418  methylmalonyl-CoA mutase  46.67 
 
 		 729 aa  114  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0388  methylmalonyl-CoA mutase  45.45 
 
 		 714 aa  115  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3398  methylmalonyl-CoA mutase  43.23 
 
 		 731 aa  115  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2128  cobalamin B12-binding domain-containing protein  46.92 
 
 		 172 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1320  methylmalonyl-CoA mutase  46.83 
 
 		 722 aa  114  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1221  methylmalonyl-CoA mutase  44.53 
 
 		 715 aa  114  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.584735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0545  methylmalonyl-CoA mutase  43.9 
 
 		 740 aa  114  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0868  methylmalonyl-CoA mutase  44.36 
 
 		 715 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3106  methylmalonyl-CoA mutase  44.03 
 
 		 661 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6511  methylmalonyl-CoA mutase  45.86 
 
 		 712 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3875  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  48.25 
 
 		 688 aa  114  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4006  methylmalonyl-CoA mutase  42.42 
 
 		 716 aa  113  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1625  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  42.31 
 
 		 667 aa  113  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  44.96 
 
 		 720 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>