287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2692 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2692  cobalamin B12-binding domain protein  100 
 
 		 140 aa  280  7.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1854  cobalamin B12-binding domain-containing protein  66.92 
 
 		 137 aa  181  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2691  cobalamin B12-binding domain protein  67.72 
 
 		 134 aa  178  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0118523  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1989  cobalamin B12-binding domain-containing protein  64.34 
 
 		 139 aa  177  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1548  cobalamin B12-binding domain protein  66.93 
 
 		 134 aa  176  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4204  cobalamin B12-binding domain-containing protein  62.69 
 
 		 134 aa  175  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1574  methylmalonyl-CoA mutase-like  63.57 
 
 		 134 aa  174  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000332572  normal  0.305791 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0377  methylmalonyl-CoA mutase-like  61.87 
 
 		 158 aa  175  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.99713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2026  cobalamin B12-binding domain-containing protein  63.85 
 
 		 134 aa  175  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113125  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3814  cobalamin B12-binding domain-containing protein  63.36 
 
 		 134 aa  175  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2028  cobalamin B12-binding domain protein  64.34 
 
 		 140 aa  174  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  65.38 
 
 		 134 aa  174  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000031654  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1578  B12-binding protein  63.57 
 
 		 134 aa  174  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.432317  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1832  methylmalonyl-CoA mutase  64.34 
 
 		 140 aa  173  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2098  cobalamin B12-binding domain protein  64.34 
 
 		 140 aa  173  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1673  cobalamin B12-binding domain protein  62.04 
 
 		 153 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2369  methylmalonyl-CoA mutase-like protein  66.67 
 
 		 133 aa  170  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.308524  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3482  cobalamin B12-binding domain-containing protein  64.62 
 
 		 134 aa  170  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1715  cobalamin B12-binding domain protein  67.74 
 
 		 139 aa  169  9e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0289  cobalamin B12-binding domain protein  63.36 
 
 		 140 aa  167  6e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1574  cobalamin B12-binding domain-containing protein  63.08 
 
 		 137 aa  166  9e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0630027 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1769  cobalamin B12-binding domain-containing protein  58.46 
 
 		 134 aa  165  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00734137  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6220  cobalamin B12-binding domain-containing protein  63.85 
 
 		 134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1432  methylmalonyl-CoA mutase  60.77 
 
 		 140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.329321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1242  methylmalonyl-CoA mutase  59.23 
 
 		 135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778509 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1910  cobalamin B12-binding domain protein  56.92 
 
 		 134 aa  160  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.374857  normal  0.0962097 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0059  cobalamin B12-binding domain protein  61.6 
 
 		 136 aa  160  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0587  cobalamin B12-binding domain protein  60.61 
 
 		 135 aa  159  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.901029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2998  cobalamin B12-binding domain-containing protein  58.14 
 
 		 134 aa  158  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.651513  normal  0.0337584 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1541  methylmalonyl-CoA mutase, alpha subunit  59.26 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0770461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1487  cobalamin B12-binding domain protein  58.91 
 
 		 135 aa  158  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.40083  normal  0.12756 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3591  cobalamin B12-binding domain-containing protein  65.08 
 
 		 143 aa  158  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2024  cobalamin B12-binding domain-containing protein  58.14 
 
 		 134 aa  159  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000794891 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4240  cobalamin B12-binding domain protein  58.02 
 
 		 139 aa  158  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7994  cobalamin B12-binding domain protein  61.42 
 
 		 135 aa  158  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0241  cobalamin B12-binding domain protein  60.15 
 
 		 139 aa  157  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3987  cobalamin B12-binding domain-containing protein  58.46 
 
 		 137 aa  155  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195294  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3774  cobalamin B12-binding domain protein  55.38 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137195  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0457  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53.03 
 
 		 133 aa  154  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.364165 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0550  cobalamin B12-binding domain-containing protein  63.78 
 
 		 133 aa  153  6e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4641  cobalamin B12-binding domain protein  65.32 
 
 		 143 aa  153  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0900  cobalamin B12-binding domain protein  55.4 
 
 		 138 aa  152  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1263  cobalamin B12-binding domain protein  64.52 
 
 		 149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.728671  normal  0.8637 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4360  cobalamin B12-binding domain protein  53.96 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.36975  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0081  cobalamin B12-binding domain protein  54.55 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1322  cobalamin B12-binding domain-containing protein  56.82 
 
 		 136 aa  148  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0582  cobalamin B12-binding domain-containing protein  56.69 
 
 		 133 aa  147  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5018  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.26 
 
 		 135 aa  147  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3654  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53.79 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.136466 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0318  cobalamin B12-binding domain protein  51.94 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0538  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  55.64 
 
 		 136 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000893241 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0510  cobalamin B12-binding domain protein  52.52 
 
 		 139 aa  144  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  0.90311 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2472  cobalamin B12-binding domain protein  56.15 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2055  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53.79 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3836  cobalamin B12-binding domain protein  50.36 
 
 		 138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.692162  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2805  cobalamin B12-binding domain protein  51.85 
 
 		 142 aa  137  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.069341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5088  cobalamin B12-binding domain-containing protein  61.32 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53.49 
 
 		 140 aa  133  9e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0044288 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1359  cobalamin B12-binding domain protein  53.12 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000160657  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  50.39 
 
 		 133 aa  129  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.698998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2128  cobalamin B12-binding domain-containing protein  47.06 
 
 		 172 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3825  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  53.28 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438631  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3899  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53.28 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4260  cobalamin B12-binding domain-containing protein  50 
 
 		 133 aa  128  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3811  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53.28 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0469463  normal  0.0948206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4309  cobalamin B12-binding domain-containing protein  52.46 
 
 		 133 aa  124  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1771  cobalamin B12-binding domain-containing protein  45.53 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.379199  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1772  methylmalonyl-CoA mutase  56.25 
 
 		 680 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.292142  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4193  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  48.87 
 
 		 670 aa  111  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.669168  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  46.62 
 
 		 1106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1034  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  48.87 
 
 		 666 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.488774  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0388  methylmalonyl-CoA mutase  45.45 
 
 		 714 aa  108  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1167  methylmalonyl-CoA mutase  50 
 
 		 712 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.169366  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3062  methylmalonyl-CoA mutase  50.89 
 
 		 671 aa  108  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  43.51 
 
 		 714 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2169  methylmalonyl-CoA mutase  51.35 
 
 		 692 aa  107  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.485789  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3621  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  50.89 
 
 		 668 aa  107  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4003  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  45.86 
 
 		 685 aa  106  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.446619  hitchhiker  0.000372138 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1292  methylmalonyl-CoA mutase  50 
 
 		 714 aa  106  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6418  methylmalonyl-CoA mutase  47.06 
 
 		 729 aa  105  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02748  methylmalonyl-CoA mutase  42.75 
 
 		 714 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  42.75 
 
 		 714 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1190  methylmalonyl-CoA mutase  44.53 
 
 		 712 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.942727  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3244  methylmalonyl-CoA mutase  42.75 
 
 		 714 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98625  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2479  methylmalonyl-CoA mutase  47.37 
 
 		 732 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3053  methylmalonyl-CoA mutase  42.75 
 
 		 714 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0793  methylmalonyl-CoA mutase  42.75 
 
 		 714 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02711  hypothetical protein  42.75 
 
 		 714 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1223  methylmalonyl-CoA mutase  48.25 
 
 		 712 aa  105  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1625  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  49.11 
 
 		 667 aa  104  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1164  methylmalonyl-CoA mutase  49.12 
 
 		 713 aa  103  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197015  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4373  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  40.91 
 
 		 735 aa  104  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  42.75 
 
 		 714 aa  104  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2294  methylmalonyl-CoA mutase  49.12 
 
 		 731 aa  103  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.895743  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0279  methylmalonyl-CoA mutase  42.42 
 
 		 731 aa  103  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4006  methylmalonyl-CoA mutase  39.42 
 
 		 716 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3260  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  46.15 
 
 		 713 aa  102  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1920  methylmalonyl-CoA mutase large subunit  44.92 
 
 		 720 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0552222  normal  0.617547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2161  methylmalonyl-CoA mutase  42.42 
 
 		 723 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385791  normal  0.481947 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0868  methylmalonyl-CoA mutase  45.76 
 
 		 715 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>