267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3654 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3654  cobalamin B12-binding domain-containing protein  100 
 
 		 135 aa  263  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.136466 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5018  cobalamin B12-binding domain-containing protein  79.26 
 
 		 135 aa  213  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0538  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  77.86 
 
 		 136 aa  206  9e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000893241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2128  cobalamin B12-binding domain-containing protein  62.7 
 
 		 172 aa  159  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2369  methylmalonyl-CoA mutase-like protein  54.14 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.308524  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1854  cobalamin B12-binding domain-containing protein  51.88 
 
 		 137 aa  150  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1432  methylmalonyl-CoA mutase  55.38 
 
 		 140 aa  148  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.329321 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1673  cobalamin B12-binding domain protein  54.33 
 
 		 153 aa  147  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1242  methylmalonyl-CoA mutase  53.49 
 
 		 135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778509 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2692  cobalamin B12-binding domain protein  53.79 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4240  cobalamin B12-binding domain protein  52.71 
 
 		 139 aa  144  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1832  methylmalonyl-CoA mutase  51.56 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436511  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1989  cobalamin B12-binding domain-containing protein  50.78 
 
 		 139 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2028  cobalamin B12-binding domain protein  50.78 
 
 		 140 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0510  cobalamin B12-binding domain protein  54.26 
 
 		 139 aa  143  7.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  0.90311 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2098  cobalamin B12-binding domain protein  50.78 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0582  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53.6 
 
 		 133 aa  142  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1715  cobalamin B12-binding domain protein  52.99 
 
 		 139 aa  143  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0587  cobalamin B12-binding domain protein  54.81 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.901029 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1574  cobalamin B12-binding domain-containing protein  56.8 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0630027 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0550  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53.79 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4204  cobalamin B12-binding domain-containing protein  52.03 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3814  cobalamin B12-binding domain-containing protein  52.03 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1574  methylmalonyl-CoA mutase-like  49.22 
 
 		 134 aa  140  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000332572  normal  0.305791 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0377  methylmalonyl-CoA mutase-like  50.39 
 
 		 158 aa  140  7e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.99713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2026  cobalamin B12-binding domain-containing protein  49.61 
 
 		 134 aa  140  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113125  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5088  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53.03 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4360  cobalamin B12-binding domain protein  58.47 
 
 		 138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.36975  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2805  cobalamin B12-binding domain protein  60 
 
 		 142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.069341  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0059  cobalamin B12-binding domain protein  51.67 
 
 		 136 aa  137  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0241  cobalamin B12-binding domain protein  51.54 
 
 		 139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0081  cobalamin B12-binding domain protein  46.56 
 
 		 141 aa  136  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2024  cobalamin B12-binding domain-containing protein  58.04 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000794891 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  49.22 
 
 		 134 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000031654  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2691  cobalamin B12-binding domain protein  50.42 
 
 		 134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0118523  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1578  B12-binding protein  48.44 
 
 		 134 aa  134  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.432317  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1541  methylmalonyl-CoA mutase, alpha subunit  50.39 
 
 		 151 aa  134  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0770461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1487  cobalamin B12-binding domain protein  51.69 
 
 		 135 aa  134  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.40083  normal  0.12756 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0900  cobalamin B12-binding domain protein  56.67 
 
 		 138 aa  133  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7994  cobalamin B12-binding domain protein  49.21 
 
 		 135 aa  133  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1548  cobalamin B12-binding domain protein  49.58 
 
 		 134 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166361 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2055  cobalamin B12-binding domain-containing protein  48.48 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2998  cobalamin B12-binding domain-containing protein  56.25 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.651513  normal  0.0337584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4641  cobalamin B12-binding domain protein  52.34 
 
 		 143 aa  131  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3987  cobalamin B12-binding domain-containing protein  53.23 
 
 		 137 aa  131  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195294  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0457  cobalamin B12-binding domain-containing protein  46.21 
 
 		 133 aa  131  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.364165 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2472  cobalamin B12-binding domain protein  57.8 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3482  cobalamin B12-binding domain-containing protein  47.46 
 
 		 134 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1322  cobalamin B12-binding domain-containing protein  51.18 
 
 		 136 aa  129  9e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6220  cobalamin B12-binding domain-containing protein  50 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3774  cobalamin B12-binding domain protein  45.8 
 
 		 157 aa  128  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137195  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1769  cobalamin B12-binding domain-containing protein  43.41 
 
 		 134 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00734137  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1910  cobalamin B12-binding domain protein  44.19 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.374857  normal  0.0962097 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0289  cobalamin B12-binding domain protein  48.8 
 
 		 140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3591  cobalamin B12-binding domain-containing protein  49.22 
 
 		 143 aa  123  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3836  cobalamin B12-binding domain protein  48.55 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.692162  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1359  cobalamin B12-binding domain protein  47.2 
 
 		 128 aa  121  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000160657  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1263  cobalamin B12-binding domain protein  52.5 
 
 		 149 aa  121  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.728671  normal  0.8637 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  49.24 
 
 		 140 aa  120  5e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0044288 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0318  cobalamin B12-binding domain protein  46.34 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3825  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  45.3 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438631  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3899  cobalamin B12-binding domain-containing protein  45.3 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3811  cobalamin B12-binding domain-containing protein  45.3 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0469463  normal  0.0948206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4309  cobalamin B12-binding domain-containing protein  43.2 
 
 		 133 aa  104  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  49.11 
 
 		 133 aa  103  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.698998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0388  methylmalonyl-CoA mutase  42.06 
 
 		 714 aa  101  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4260  cobalamin B12-binding domain-containing protein  44.07 
 
 		 133 aa  101  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1167  methylmalonyl-CoA mutase  46.73 
 
 		 712 aa  101  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.169366  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1292  methylmalonyl-CoA mutase  45.79 
 
 		 714 aa  100  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1173  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  47.66 
 
 		 1106 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00593374 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0875  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  47.66 
 
 		 1081 aa  99.8  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.036821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4373  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  44.8 
 
 		 735 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1164  methylmalonyl-CoA mutase  45.79 
 
 		 713 aa  99  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197015  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02748  methylmalonyl-CoA mutase  44.64 
 
 		 714 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0793  methylmalonyl-CoA mutase  44.64 
 
 		 714 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02711  hypothetical protein  44.64 
 
 		 714 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0868  methylmalonyl-CoA mutase  45.79 
 
 		 715 aa  97.8  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1772  methylmalonyl-CoA mutase  44.95 
 
 		 680 aa  97.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.292142  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3053  methylmalonyl-CoA mutase  44.64 
 
 		 714 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  45.54 
 
 		 714 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  44.64 
 
 		 714 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1771  cobalamin B12-binding domain-containing protein  41.46 
 
 		 148 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.379199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3260  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  44.64 
 
 		 713 aa  95.9  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3244  methylmalonyl-CoA mutase  44.64 
 
 		 714 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98625  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  43.75 
 
 		 714 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1223  methylmalonyl-CoA mutase  46.73 
 
 		 712 aa  95.1  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1320  methylmalonyl-CoA mutase  39.37 
 
 		 722 aa  94.7  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3621  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  40.62 
 
 		 668 aa  94.4  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1657  methylmalonyl-CoA mutase  43.86 
 
 		 715 aa  94.4  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.387473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1034  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  40.48 
 
 		 666 aa  94  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.488774  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2638  methylmalonyl-CoA mutase  42.74 
 
 		 720 aa  94  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1760  methylmalonyl-CoA mutase  43.59 
 
 		 718 aa  93.6  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.226069 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  41.86 
 
 		 719 aa  93.6  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2855  methylmalonyl-CoA mutase  35.38 
 
 		 657 aa  93.2  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2208  methylmalonyl-CoA mutase-like  38.89 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000192903  normal  0.0126749 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4003  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  40 
 
 		 685 aa  93.2  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.446619  hitchhiker  0.000372138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4193  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  38.35 
 
 		 670 aa  92.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.669168  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0910  methylmalonyl-CoA mutase  43.31 
 
 		 739 aa  93.2  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.736612  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0856  methylmalonyl-CoA mutase  40.17 
 
 		 714 aa  92  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3681  methylmalonyl-CoA mutase  41.41 
 
 		 714 aa  92  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542374  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>