More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0377 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0377  methylmalonyl-CoA mutase-like  100 
 
 		 158 aa  315  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.99713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1989  cobalamin B12-binding domain-containing protein  70.68 
 
 		 139 aa  195  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4204  cobalamin B12-binding domain-containing protein  71.43 
 
 		 134 aa  188  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3814  cobalamin B12-binding domain-containing protein  71.43 
 
 		 134 aa  187  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1832  methylmalonyl-CoA mutase  67.67 
 
 		 140 aa  186  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436511  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2028  cobalamin B12-binding domain protein  67.67 
 
 		 140 aa  186  9e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2098  cobalamin B12-binding domain protein  67.67 
 
 		 140 aa  186  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1578  B12-binding protein  65.91 
 
 		 134 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.432317  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2369  methylmalonyl-CoA mutase-like protein  68.22 
 
 		 133 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.308524  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1574  methylmalonyl-CoA mutase-like  66.41 
 
 		 134 aa  180  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000332572  normal  0.305791 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1715  cobalamin B12-binding domain protein  69.29 
 
 		 139 aa  179  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0059  cobalamin B12-binding domain protein  70.63 
 
 		 136 aa  180  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107152 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2026  cobalamin B12-binding domain-containing protein  65.65 
 
 		 134 aa  179  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113125  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1574  cobalamin B12-binding domain-containing protein  67.67 
 
 		 137 aa  178  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0630027 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  65.65 
 
 		 134 aa  177  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000031654  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3774  cobalamin B12-binding domain protein  59.26 
 
 		 157 aa  176  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137195  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1673  cobalamin B12-binding domain protein  60.15 
 
 		 153 aa  176  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1242  methylmalonyl-CoA mutase  68.22 
 
 		 135 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778509 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2692  cobalamin B12-binding domain protein  61.87 
 
 		 140 aa  175  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3482  cobalamin B12-binding domain-containing protein  64.89 
 
 		 134 aa  175  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1854  cobalamin B12-binding domain-containing protein  60.45 
 
 		 137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2691  cobalamin B12-binding domain protein  63.08 
 
 		 134 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0118523  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0289  cobalamin B12-binding domain protein  58.65 
 
 		 140 aa  170  7.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1548  cobalamin B12-binding domain protein  62.31 
 
 		 134 aa  169  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000166361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7994  cobalamin B12-binding domain protein  68.03 
 
 		 135 aa  168  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6220  cobalamin B12-binding domain-containing protein  65.38 
 
 		 134 aa  165  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4240  cobalamin B12-binding domain protein  54.81 
 
 		 139 aa  164  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1541  methylmalonyl-CoA mutase, alpha subunit  60.31 
 
 		 151 aa  164  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0770461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4641  cobalamin B12-binding domain protein  65.32 
 
 		 143 aa  163  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0241  cobalamin B12-binding domain protein  59.09 
 
 		 139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3591  cobalamin B12-binding domain-containing protein  68 
 
 		 143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1263  cobalamin B12-binding domain protein  69.35 
 
 		 149 aa  160  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.728671  normal  0.8637 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1769  cobalamin B12-binding domain-containing protein  59.23 
 
 		 134 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00734137  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1910  cobalamin B12-binding domain protein  56.49 
 
 		 134 aa  159  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.374857  normal  0.0962097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1432  methylmalonyl-CoA mutase  57.25 
 
 		 140 aa  159  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.329321 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0582  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.69 
 
 		 133 aa  159  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1487  cobalamin B12-binding domain protein  54.69 
 
 		 135 aa  153  8e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.40083  normal  0.12756 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0081  cobalamin B12-binding domain protein  52.59 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0587  cobalamin B12-binding domain protein  56.15 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.901029 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0457  cobalamin B12-binding domain-containing protein  52.31 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.364165 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1322  cobalamin B12-binding domain-containing protein  59.84 
 
 		 136 aa  150  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2998  cobalamin B12-binding domain-containing protein  56.39 
 
 		 134 aa  150  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.651513  normal  0.0337584 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2024  cobalamin B12-binding domain-containing protein  55.64 
 
 		 134 aa  150  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000794891 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0318  cobalamin B12-binding domain protein  54.81 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2055  cobalamin B12-binding domain-containing protein  51.85 
 
 		 155 aa  149  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0550  cobalamin B12-binding domain-containing protein  58.46 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3987  cobalamin B12-binding domain-containing protein  55.38 
 
 		 137 aa  148  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195294  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0510  cobalamin B12-binding domain protein  54.96 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  0.90311 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5018  cobalamin B12-binding domain-containing protein  52.34 
 
 		 135 aa  143  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2805  cobalamin B12-binding domain protein  52.63 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.069341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3654  cobalamin B12-binding domain-containing protein  50.39 
 
 		 135 aa  140  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.136466 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4360  cobalamin B12-binding domain protein  54.26 
 
 		 138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.36975  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0900  cobalamin B12-binding domain protein  53.12 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2472  cobalamin B12-binding domain protein  52.67 
 
 		 152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1359  cobalamin B12-binding domain protein  57.14 
 
 		 128 aa  137  4.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000160657  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0538  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  48.44 
 
 		 136 aa  134  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000893241 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3836  cobalamin B12-binding domain protein  51.91 
 
 		 138 aa  133  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.692162  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2388  cobalamin B12-binding domain-containing protein  57.38 
 
 		 133 aa  130  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.698998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4309  cobalamin B12-binding domain-containing protein  55.74 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3825  methylmalonyl-CoA mutase C-terminal domain-containing protein  56.1 
 
 		 132 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438631  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3899  cobalamin B12-binding domain-containing protein  56.1 
 
 		 132 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3811  cobalamin B12-binding domain-containing protein  56.1 
 
 		 132 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0469463  normal  0.0948206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4260  cobalamin B12-binding domain-containing protein  56.56 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0958  cobalamin B12-binding domain-containing protein  48.48 
 
 		 140 aa  124  6e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0044288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2128  cobalamin B12-binding domain-containing protein  54.1 
 
 		 172 aa  124  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1771  cobalamin B12-binding domain-containing protein  42.96 
 
 		 148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.379199  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5088  cobalamin B12-binding domain-containing protein  47.29 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1034  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  50.89 
 
 		 666 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.488774  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1772  methylmalonyl-CoA mutase  52.25 
 
 		 680 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.292142  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4006  methylmalonyl-CoA mutase  45.04 
 
 		 716 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4213  methylmalonyl-CoA mutase  43.85 
 
 		 714 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3753  methylmalonyl-CoA mutase  44.19 
 
 		 738 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801598  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1164  methylmalonyl-CoA mutase  49.12 
 
 		 713 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197015  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1849  methylmalonyl-CoA mutase  42.64 
 
 		 720 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1167  methylmalonyl-CoA mutase  47.37 
 
 		 712 aa  105  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.169366  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2040  methylmalonyl-CoA mutase  42.64 
 
 		 720 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0776  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  43.08 
 
 		 714 aa  103  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3244  methylmalonyl-CoA mutase  43.08 
 
 		 714 aa  104  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98625  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3053  methylmalonyl-CoA mutase  43.08 
 
 		 714 aa  104  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2169  methylmalonyl-CoA mutase  49.11 
 
 		 692 aa  104  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.485789  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2510  methylmalonyl-CoA mutase  42.75 
 
 		 722 aa  104  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02748  methylmalonyl-CoA mutase  43.08 
 
 		 714 aa  103  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0793  methylmalonyl-CoA mutase  43.08 
 
 		 714 aa  103  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02711  hypothetical protein  43.08 
 
 		 714 aa  103  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0932  methylmalonyl-CoA mutase  41.35 
 
 		 724 aa  103  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2697  methylmalonyl-CoA mutase  46.96 
 
 		 720 aa  102  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.20812 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0910  methylmalonyl-CoA mutase  40.6 
 
 		 739 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.736612  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0388  methylmalonyl-CoA mutase  44.92 
 
 		 714 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3075  methylmalonyl-CoA mutase  43.08 
 
 		 714 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1320  methylmalonyl-CoA mutase  46.09 
 
 		 722 aa  101  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3398  methylmalonyl-CoA mutase  42.64 
 
 		 731 aa  101  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.526303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4193  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  48.21 
 
 		 670 aa  101  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.669168  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1983  methylmalonyl-CoA mutase  43.08 
 
 		 714 aa  101  5e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.774356  normal  0.0211504 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2805  methylmalonyl-CoA mutase  41.09 
 
 		 719 aa  101  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2127  methylmalonyl-CoA mutase  40.91 
 
 		 720 aa  100  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.063815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2161  methylmalonyl-CoA mutase  41.22 
 
 		 723 aa  100  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.385791  normal  0.481947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1197  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  45.61 
 
 		 657 aa  100  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4373  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  45.61 
 
 		 735 aa  100  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3188  Methylmalonyl-CoA mutase  44.92 
 
 		 725 aa  100  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.36577  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3260  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  46.09 
 
 		 713 aa  99.8  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>