More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2987 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2987  ABC transporter related  100 
 
 		 613 aa  1250    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  24.57 
 
 		 738 aa  206  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  24.81 
 
 		 718 aa  204  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  25.41 
 
 		 737 aa  197  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0564  type I secretion system ATPase  26.37 
 
 		 743 aa  195  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1190  ABC transporter-related protein  25.05 
 
 		 701 aa  190  7e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0379  type I secretion system ATPase  27.07 
 
 		 570 aa  187  5e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.092179  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3382  type I secretion system ATPase  26.31 
 
 		 579 aa  187  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  23.43 
 
 		 723 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0731  ABC transporter related  26.63 
 
 		 713 aa  186  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.269341  normal  0.324121 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  23.67 
 
 		 762 aa  186  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01405  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.44 
 
 		 694 aa  184  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.637071  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  22.84 
 
 		 712 aa  182  2e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1418  ATPase  24.81 
 
 		 756 aa  182  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.702704  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  24.95 
 
 		 776 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  24.34 
 
 		 704 aa  180  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1634  ABC transporter related  24.24 
 
 		 730 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2300  type I secretion system ATPase  24.71 
 
 		 739 aa  179  9e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2560  type I secretion system ATPase  27.82 
 
 		 578 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3155  type I secretion system ATPase  28.12 
 
 		 578 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3354  type I secretion system ATPase  27.77 
 
 		 578 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2512  type I secretion system ATPase  24.62 
 
 		 581 aa  178  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  24.95 
 
 		 740 aa  177  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0760  ABC transporter related  23.42 
 
 		 867 aa  177  6e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00472894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2196  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  24.5 
 
 		 763 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.338051  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2060  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.5 
 
 		 763 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  23.47 
 
 		 704 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0312  ABC transporter-related protein  23.67 
 
 		 726 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  22.31 
 
 		 734 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0635  type I secretion system ATPase  24.58 
 
 		 920 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.144577  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  25.05 
 
 		 721 aa  174  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  24 
 
 		 725 aa  173  9e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2660  ABC transporter related  23.3 
 
 		 687 aa  173  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3161  Type I secretion system ATPase, PrtD  25.3 
 
 		 598 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2206  type I secretion system ATPase  27.27 
 
 		 582 aa  172  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  22.37 
 
 		 726 aa  172  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1291  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  23.46 
 
 		 711 aa  172  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  21.4 
 
 		 712 aa  172  2e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  24.39 
 
 		 718 aa  171  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  24.05 
 
 		 725 aa  171  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  24.39 
 
 		 718 aa  171  5e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  24.71 
 
 		 721 aa  171  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  24.05 
 
 		 725 aa  170  6e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  24.18 
 
 		 741 aa  170  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  23.98 
 
 		 739 aa  169  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  23.81 
 
 		 726 aa  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0476  type I secretion system ATPase  23.3 
 
 		 726 aa  169  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0680  Type I secretion system ATPase, PrtD  24.05 
 
 		 563 aa  169  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.738771  normal  0.0936545 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4007  type I secretion system ATPase  23.98 
 
 		 573 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3835  Type I secretion system ATPase, PrtD  23.99 
 
 		 570 aa  168  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171691  normal  0.0822882 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  22.86 
 
 		 723 aa  169  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  22.92 
 
 		 725 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  23.67 
 
 		 721 aa  167  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  24.12 
 
 		 725 aa  167  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1748  type I secretion system ATPase  26.17 
 
 		 571 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.492562  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1749  type I secretion system ATPase  25.1 
 
 		 561 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  23.24 
 
 		 725 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2501  ABC transporter  25.88 
 
 		 733 aa  166  9e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.576449 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0039  Type I secretion system ATPase, PrtD  25.93 
 
 		 585 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0802  Type I secretion system ATPase, PrtD  24.43 
 
 		 593 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1002  ABC transporter related  24.42 
 
 		 722 aa  166  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5958  type I secretion system ATPase  24.57 
 
 		 569 aa  166  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  23.4 
 
 		 734 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  23.24 
 
 		 725 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  23.79 
 
 		 731 aa  165  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  23.05 
 
 		 725 aa  165  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  23.05 
 
 		 725 aa  165  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0548  ABC transporter related  24.81 
 
 		 722 aa  165  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3149  ABC transporter related  23.54 
 
 		 776 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16240  Type I secretion system ATPase  23.4 
 
 		 580 aa  164  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  22.08 
 
 		 733 aa  163  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2242  ABC transporter related  21.93 
 
 		 718 aa  163  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.960631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1348  Type I secretion system ATPase, PrtD  27.03 
 
 		 556 aa  163  9e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.716552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4336  type I secretion system ATPase  24.72 
 
 		 663 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.270132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  23.33 
 
 		 718 aa  163  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  22.08 
 
 		 731 aa  163  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1599  ABC drug efflux transporter, fused ATPase and inner mebrane subunits  24.45 
 
 		 751 aa  162  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.164249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3892  ABC transporter  26.1 
 
 		 602 aa  162  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.881504 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1707  Type I secretion system ATPase, PrtD  22.88 
 
 		 596 aa  162  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3592  ABC transporter related  24.07 
 
 		 725 aa  162  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2543  type I secretion system ATPase  24.91 
 
 		 614 aa  161  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23418  normal  0.267124 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1563  type I secretion system ATPase  25.43 
 
 		 603 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1098  ABC transporter ATP-binding protein  24.03 
 
 		 707 aa  161  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89235  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0132  type I secretion ATP-binding protein  25.9 
 
 		 602 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5062  type I secretion system ATPase  23.71 
 
 		 718 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.507618 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1347  Type I secretion system ATPase, PrtD  25.81 
 
 		 568 aa  160  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.753541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  23.51 
 
 		 731 aa  160  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4084  type I secretion system ATPase  25.9 
 
 		 602 aa  160  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3330  ABC transporter, ATP-binding protein  24.51 
 
 		 599 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.355213  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4457  ABC transporter related  27.29 
 
 		 613 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.754482  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0185  type I secretion system ATPase  23.9 
 
 		 718 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206215 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0381  ATPase  22.14 
 
 		 718 aa  159  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.700678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1761  type I secretion system ATPase  25.29 
 
 		 573 aa  159  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0167  toxin secretion ATP-binding protein  23.9 
 
 		 718 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0186  ABC transporter related  23.9 
 
 		 718 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0846231 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3437  type I secretion system ATPase  24.24 
 
 		 591 aa  158  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.732646  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4601  type I secretion system ATPase  25.7 
 
 		 730 aa  158  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0139  type I secretion system ATPase  22.29 
 
 		 579 aa  158  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.720717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  24.77 
 
 		 724 aa  157  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  24.77 
 
 		 724 aa  157  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>