More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4457 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4457  ABC transporter related  100 
 
 		 613 aa  1236    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.754482  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2079  ABC transporter related  56.56 
 
 		 623 aa  654    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304897 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  30.05 
 
 		 720 aa  243  9e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  32.07 
 
 		 750 aa  243  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  32.48 
 
 		 740 aa  239  8e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  29.69 
 
 		 720 aa  239  1e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  29.76 
 
 		 706 aa  236  9e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  29.1 
 
 		 980 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.89 
 
 		 1008 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.89 
 
 		 1008 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  30.58 
 
 		 753 aa  228  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  29.8 
 
 		 712 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  28.62 
 
 		 743 aa  226  8e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  30.62 
 
 		 705 aa  226  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  28.57 
 
 		 725 aa  226  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  28.67 
 
 		 717 aa  225  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.42 
 
 		 1024 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5958  type I secretion system ATPase  33.04 
 
 		 569 aa  223  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  29.37 
 
 		 737 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.3 
 
 		 720 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1634  ABC transporter related  29.59 
 
 		 730 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  29.3 
 
 		 739 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  28.44 
 
 		 731 aa  221  3.9999999999999997e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.18 
 
 		 1006 aa  219  8.999999999999998e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3202  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  31.13 
 
 		 725 aa  219  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.612562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.9 
 
 		 739 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  28.93 
 
 		 721 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  29.17 
 
 		 731 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  29.27 
 
 		 726 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  28.71 
 
 		 700 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  29.52 
 
 		 726 aa  217  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  28.6 
 
 		 741 aa  216  7e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 1038 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  28.65 
 
 		 725 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 1038 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  28.47 
 
 		 975 aa  216  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.05 
 
 		 1000 aa  215  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0039  Type I secretion system ATPase, PrtD  30.08 
 
 		 585 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  28.81 
 
 		 723 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06452  ABC-type RTX toxin transporter ATPase and permease components  30.13 
 
 		 523 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.68 
 
 		 976 aa  214  2.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  28.6 
 
 		 720 aa  214  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  28.24 
 
 		 728 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0529  ABC transporter related  31.23 
 
 		 871 aa  213  5.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.299767  normal  0.097306 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3835  Type I secretion system ATPase, PrtD  31.15 
 
 		 570 aa  213  7.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171691  normal  0.0822882 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  27.15 
 
 		 718 aa  213  9e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  28.88 
 
 		 725 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2060  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.12 
 
 		 763 aa  212  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  28.42 
 
 		 726 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  28.88 
 
 		 725 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2196  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  31.12 
 
 		 763 aa  212  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.338051  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  28.88 
 
 		 725 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  28.46 
 
 		 728 aa  212  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  29.39 
 
 		 734 aa  212  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  28.88 
 
 		 725 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  28.68 
 
 		 986 aa  211  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  29.14 
 
 		 762 aa  211  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  27.91 
 
 		 725 aa  211  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  27.56 
 
 		 971 aa  210  5e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  26.53 
 
 		 968 aa  210  7e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  28.63 
 
 		 712 aa  210  7e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.06 
 
 		 1019 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  28.35 
 
 		 725 aa  209  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0312  ABC transporter-related protein  27.73 
 
 		 726 aa  208  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  28.63 
 
 		 712 aa  208  3e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2547  ABC transporter related  29.01 
 
 		 740 aa  207  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293981  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0383  type I secretion system ATPase  28.86 
 
 		 590 aa  207  6e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  27.99 
 
 		 725 aa  207  6e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  28.65 
 
 		 724 aa  206  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.27 
 
 		 1003 aa  206  7e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  28.65 
 
 		 724 aa  206  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  29.69 
 
 		 721 aa  206  7e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0379  type I secretion system ATPase  28.1 
 
 		 570 aa  206  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.092179  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  27.26 
 
 		 726 aa  206  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0631  Type I secretion system ATPase, PrtD  28.85 
 
 		 592 aa  205  2e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  30.26 
 
 		 723 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.65 
 
 		 1001 aa  205  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  27.99 
 
 		 725 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  29.17 
 
 		 776 aa  204  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  28.68 
 
 		 719 aa  203  9e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  27.99 
 
 		 712 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  27.99 
 
 		 712 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0476  type I secretion system ATPase  28.12 
 
 		 726 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  27.91 
 
 		 734 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  26.69 
 
 		 727 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3592  ABC transporter related  28.19 
 
 		 725 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2722  ABC transporter related  28.3 
 
 		 730 aa  201  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0635  type I secretion system ATPase  30.41 
 
 		 920 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.144577  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3586  type I secretion system ATPase  28.95 
 
 		 598 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0383  ABC transporter related  28.86 
 
 		 727 aa  200  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  27.66 
 
 		 1018 aa  200  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  27.8 
 
 		 712 aa  200  7.999999999999999e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  31.24 
 
 		 731 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  26.82 
 
 		 930 aa  199  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.89 
 
 		 1018 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  25.76 
 
 		 982 aa  198  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.52 
 
 		 999 aa  198  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.03 
 
 		 865 aa  197  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06455  RTX toxin transporter  29.3 
 
 		 714 aa  195  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1418  ATPase  27.75 
 
 		 756 aa  195  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.702704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>