101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2555 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2555  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 		 107 aa  210  4.9999999999999996e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4199  hypothetical protein  54.08 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124455  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2384  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 119 aa  94  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68054 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 119 aa  92  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.581103  normal  0.0182397 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1977  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2786  TraR/DksA family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3073  transcriptional regulator, TraR/DksA family protein  42.57 
 
 		 115 aa  83.6  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0240851 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4470  putative DnaK suppressor protein  42.06 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000149172  hitchhiker  0.00792418 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4602  putative DnaK suppressor protein  42.06 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000114617  normal  0.012222 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3893  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111864 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1573  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.06 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0188  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1993  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2385  hypothetical protein  45.19 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0169  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.2184  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2328  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.79 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3949  DnaK suppressor protein, putative  40.82 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442738 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0916  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354828  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1926  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.77 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2687  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0540586 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1800  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.315491 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0166  DnaK suppressor protein  43.33 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1266  dnaK suppressor protein  57.78 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1477  TraR/DksA family transcriptional regulator  40 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1557  hypothetical protein  43.18 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1052  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.129097 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3489  hypothetical protein  38.3 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.711789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0615  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1007  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3752  putative suppressor protein DnaK  34.34 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2105  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.8303 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0812  transcriptional regulator  40 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3066  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.64 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0212  conserved hypothetical protein, DksA-like protein  30.67 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3596  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.25 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0007  hypothetical protein  43.48 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.807913  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1198  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.114031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0604  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1411  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2311  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  42.55 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2675  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.83 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.242775  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2243  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.176071  hitchhiker  0.000769405 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3203  zinc finger, DksA/TraR C4-type  44.19 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3429  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  decreased coverage  0.00561367 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0025  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.795475  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000533151  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2440  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.29 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1204  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.418656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4135  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.564899  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2692  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.414377  normal  0.0706919 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2860  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.689813  hitchhiker  0.0000000253321 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1239  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.29 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0619111 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.86 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00672458  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  26.09 
 
 		 210 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.4009  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1346  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.86 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4002  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.64 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2925  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2024  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  42.55 
 
 		 131 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.812974  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1419  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  42.55 
 
 		 131 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597542  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2010  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  37.93 
 
 		 135 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2415  transcriptional regulators, TraR/DksA family protein  30 
 
 		 123 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1950  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 142 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1334  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  42.55 
 
 		 131 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3205  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  42.55 
 
 		 131 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3077  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  42.55 
 
 		 131 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0162  hypothetical protein  45.71 
 
 		 228 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1047  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  42.55 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2314  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  42.55 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2014  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2791  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.1 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0008  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.53 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0752856 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2884  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.1 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.17875  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40860  hypothetical protein  38.81 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.802206  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0072  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000740961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2035  serine phosphatase  34.55 
 
 		 341 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0584  RNA polymerase-binding dnaK suppressor protein DksA  39.53 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1731  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.22 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  26.55 
 
 		 228 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000204402  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2860  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.51 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6440  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2698  TraR/DksA family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.303668  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3438  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 429 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2476  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3137  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3090  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0674  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3107  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2999  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.141456 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2389  hypothetical protein  28.91 
 
 		 141 aa  40.4  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000590846  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1083  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2552  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0402144  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3937  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000139541  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1064  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 450 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2582  TraR/DksA family transcriptional regulator  40 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.453869  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3899  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000283088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1785  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000697437 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1761  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.002786  hitchhiker  0.0085611 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1823  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.03 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00591197 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4329  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.34 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.92957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2453  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 119 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.571464  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>