More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_2014 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_2014  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  325  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1731  transcriptional regulator, TraR/DksA family  96.3 
 
 		 162 aa  277  5e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0162  hypothetical protein  72.96 
 
 		 228 aa  241  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0126  TraR/DksA family transcriptional regulator  71.6 
 
 		 229 aa  237  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2999  TraR/DksA family transcriptional regulator  80.45 
 
 		 138 aa  223  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.141456 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6440  TraR/DksA family transcriptional regulator  80.45 
 
 		 138 aa  223  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3107  TraR/DksA family transcriptional regulator  80.45 
 
 		 138 aa  223  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2476  TraR/DksA family transcriptional regulator  80.45 
 
 		 138 aa  223  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3137  TraR/DksA family transcriptional regulator  80.45 
 
 		 138 aa  223  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3090  TraR/DksA family transcriptional regulator  80.45 
 
 		 138 aa  223  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0344  transcriptional regulator, TraR/DksA family  79.7 
 
 		 139 aa  223  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3255  DnaK suppressor protein  79.7 
 
 		 138 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.290883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0387  DnaK suppressor protein  79.7 
 
 		 138 aa  221  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2917  RNA polymerase-binding protein DksA  79.7 
 
 		 138 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.123295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0192  RNA polymerase-binding protein DksA  79.7 
 
 		 138 aa  221  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.426032  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2172  DnaK suppressor protein  79.7 
 
 		 138 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297381  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0166  DnaK suppressor protein  79.7 
 
 		 138 aa  221  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.534243  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3431  RNA polymerase-binding protein DksA  79.7 
 
 		 138 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0203  RNA polymerase-binding protein DksA  79.7 
 
 		 138 aa  221  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0071  TraR/DksA family transcriptional regulator  78.95 
 
 		 139 aa  221  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4379  TraR/DksA family transcriptional regulator  78.95 
 
 		 139 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0046  putative DNAK suppressor protein  77.44 
 
 		 139 aa  219  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3085  TraR/DksA family transcriptional regulator  78.95 
 
 		 138 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3438  TraR/DksA family transcriptional regulator  73.88 
 
 		 429 aa  218  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3704  transcriptional regulator, TraR/DksA family  73.68 
 
 		 223 aa  215  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3381  transcriptional regulator, TraR/DksA family  73.68 
 
 		 223 aa  215  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0808  TraR/DksA family transcriptional regulator  65.03 
 
 		 165 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1064  TraR/DksA family transcriptional regulator  71.64 
 
 		 450 aa  211  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2993  transcriptional regulator, TraR/DksA family  66.67 
 
 		 223 aa  209  9e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0906  transcriptional regulator, TraR/DksA family  66.03 
 
 		 207 aa  209  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3683  TraR/DksA family transcriptional regulator  66.03 
 
 		 281 aa  207  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1457  TraR/DksA family transcriptional regulator  63.41 
 
 		 164 aa  207  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.969843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4557  TraR/DksA family transcriptional regulator  70.9 
 
 		 257 aa  206  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3835  TraR/DksA family transcriptional regulator  69.48 
 
 		 162 aa  205  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.827568 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3428  TraR/DksA family transcriptional regulator  70.15 
 
 		 278 aa  201  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.478863 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3387  putative dnaK suppressor protein  71.43 
 
 		 126 aa  195  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2533  TraR/DksA family transcriptional regulator  65.65 
 
 		 139 aa  176  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0895997  normal  0.563175 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1232  TraR/DksA family transcriptional regulator  60.94 
 
 		 139 aa  152  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.182051 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0758  TraR/DksA family transcriptional regulator  58.68 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1598  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.62 
 
 		 149 aa  137  7.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  56.8 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  54.92 
 
 		 139 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2558  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.92 
 
 		 146 aa  133  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2671  transcriptional regulator, TraR/DksA family  57.02 
 
 		 137 aa  133  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0417031  normal  0.389784 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1527  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.92 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143324  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2176  transcriptional regulator, TraR/DksA family  53.28 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.0134623 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.94 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 138 aa  131  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2297  transcriptional regulator, TraR/DksA family  54.84 
 
 		 141 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0340464 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  55.46 
 
 		 136 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3687  TraR/DksA family transcriptional regulator  59.82 
 
 		 142 aa  131  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 138 aa  130  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1346  TraR/DksA family transcriptional regulator  55.65 
 
 		 138 aa  130  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3792  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 140 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0620628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5556  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.56 
 
 		 139 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.398445  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1679  transcriptional regulators, TraR/DksA family  52.24 
 
 		 138 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3529  transcriptional regulator, TraR/DksA family  55.46 
 
 		 139 aa  130  9e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100266 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1499  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.3 
 
 		 138 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0747562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  56.3 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3227  transcriptional regulator, TraR/DksA family  55.74 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.3 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0509  transcriptional regulator, TraR/DksA family  54.78 
 
 		 138 aa  127  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1132  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.92 
 
 		 138 aa  127  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.807192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1950  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.24 
 
 		 142 aa  127  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5516  DnaK suppressor protein  53.54 
 
 		 133 aa  127  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1036  dnaK suppressor protein  53.28 
 
 		 138 aa  127  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.35343  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0895  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.89 
 
 		 158 aa  127  8.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1002  RNA polymerase-binding protein DksA  53.28 
 
 		 138 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3260  transcriptional regulator, TraR/DksA family  54.92 
 
 		 139 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3036  RNA polymerase-binding protein DksA  54.92 
 
 		 139 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897126 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3101  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0571  transcriptional regulator, TraR/DksA family  56.64 
 
 		 134 aa  124  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2847  TraR/DksA family transcriptional regulator  57.76 
 
 		 138 aa  124  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0799762  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1953  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 143 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145281 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2440  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48 
 
 		 133 aa  123  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1884  putative DnaK suppressor protein  54.47 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.261909 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1312  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2654  DnaK suppressor protein  47.68 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.562233  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2681  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.41 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.133444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1192  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal  0.628477 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1243  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 		 142 aa  121  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0635  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.41 
 
 		 155 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00359  DnaK supressor  41.88 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131287  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0547  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 140 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1032  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.86 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.955703  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2734  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.99 
 
 		 405 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.152492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3060  TraR/DksA family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0497831  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2595  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0704814 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0307  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 313 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4537  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0724  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0276  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 313 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0674  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0276  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 143 aa  114  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.28 
 
 		 150 aa  113  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3985  RNA polymerase-binding transcription factor  47.06 
 
 		 151 aa  113  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000239354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0995  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6338  RNA polymerase-binding protein DksA  48.06 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73020  DksA/TraR family C4-type zinc finger protein  47.29 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450272  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>