More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1232 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1232  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 
139 aa  280  4.0000000000000003e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.182051 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3835  TraR/DksA family transcriptional regulator  62.41 
 
 
162 aa  164  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.827568 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3085  TraR/DksA family transcriptional regulator  61.65 
 
 
138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0126  TraR/DksA family transcriptional regulator  58.7 
 
 
229 aa  159  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0071  TraR/DksA family transcriptional regulator  60.15 
 
 
139 aa  159  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3255  DnaK suppressor protein  60.15 
 
 
138 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.290883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0387  DnaK suppressor protein  60.15 
 
 
138 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2172  DnaK suppressor protein  60.15 
 
 
138 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297381  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6440  TraR/DksA family transcriptional regulator  60.15 
 
 
138 aa  159  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3431  RNA polymerase-binding protein DksA  60.15 
 
 
138 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2917  RNA polymerase-binding protein DksA  60.15 
 
 
138 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.123295  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0166  DnaK suppressor protein  60.15 
 
 
138 aa  159  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.534243  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4379  TraR/DksA family transcriptional regulator  62.5 
 
 
139 aa  159  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2476  TraR/DksA family transcriptional regulator  60.15 
 
 
138 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0203  RNA polymerase-binding protein DksA  60.15 
 
 
138 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2999  TraR/DksA family transcriptional regulator  60.15 
 
 
138 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.141456 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3107  TraR/DksA family transcriptional regulator  60.15 
 
 
138 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3137  TraR/DksA family transcriptional regulator  60.15 
 
 
138 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0192  RNA polymerase-binding protein DksA  60.15 
 
 
138 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.426032  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3090  TraR/DksA family transcriptional regulator  60.15 
 
 
138 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0344  transcriptional regulator, TraR/DksA family  59.4 
 
 
139 aa  158  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0046  putative DNAK suppressor protein  57.25 
 
 
139 aa  156  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0162  hypothetical protein  57.97 
 
 
228 aa  155  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0906  transcriptional regulator, TraR/DksA family  60.47 
 
 
207 aa  156  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3683  TraR/DksA family transcriptional regulator  61.24 
 
 
281 aa  156  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0808  TraR/DksA family transcriptional regulator  59.4 
 
 
165 aa  155  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2993  transcriptional regulator, TraR/DksA family  60.47 
 
 
223 aa  154  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4557  TraR/DksA family transcriptional regulator  58.91 
 
 
257 aa  154  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1731  transcriptional regulator, TraR/DksA family  61.72 
 
 
162 aa  153  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2533  TraR/DksA family transcriptional regulator  62.9 
 
 
139 aa  152  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0895997  normal  0.563175 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1064  TraR/DksA family transcriptional regulator  57.69 
 
 
450 aa  151  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1457  TraR/DksA family transcriptional regulator  61.59 
 
 
164 aa  151  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.969843  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2014  TraR/DksA family transcriptional regulator  60.94 
 
 
162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3387  putative dnaK suppressor protein  60.8 
 
 
126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3438  TraR/DksA family transcriptional regulator  60.94 
 
 
429 aa  148  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3381  transcriptional regulator, TraR/DksA family  57.81 
 
 
223 aa  147  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3704  transcriptional regulator, TraR/DksA family  57.81 
 
 
223 aa  147  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3428  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.15 
 
 
278 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.478863 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  54.55 
 
 
146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0571  transcriptional regulator, TraR/DksA family  61.34 
 
 
134 aa  133  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1598  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.2 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26803  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2558  TraR/DksA family transcriptional regulator  55.56 
 
 
146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  58.82 
 
 
139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2176  transcriptional regulator, TraR/DksA family  57.98 
 
 
139 aa  127  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.0134623 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2297  transcriptional regulator, TraR/DksA family  56.45 
 
 
141 aa  127  6e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0340464 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3227  transcriptional regulator, TraR/DksA family  53.38 
 
 
139 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3036  RNA polymerase-binding protein DksA  53.38 
 
 
139 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0897126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3260  transcriptional regulator, TraR/DksA family  53.38 
 
 
139 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1527  TraR/DksA family transcriptional regulator  55.74 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143324  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.56 
 
 
138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5556  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.56 
 
 
139 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.398445  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  55.74 
 
 
158 aa  124  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1953  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.46 
 
 
143 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145281 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0895  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 
158 aa  124  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2819  RNA polymerase-binding transcription factor  49.26 
 
 
151 aa  123  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.02941  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.14 
 
 
139 aa  123  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  54.14 
 
 
139 aa  123  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0758  TraR/DksA family transcriptional regulator  55.65 
 
 
138 aa  123  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3985  RNA polymerase-binding transcription factor  47.79 
 
 
151 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000239354  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22970  RNA polymerase-binding DksA like protein  54.4 
 
 
134 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1884  putative DnaK suppressor protein  52.71 
 
 
157 aa  121  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.261909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3101  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.54 
 
 
152 aa  120  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1032  RNA polymerase-binding transcription factor  48.53 
 
 
151 aa  120  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0218805  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1132  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.1 
 
 
138 aa  120  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.807192  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1036  dnaK suppressor protein  52.46 
 
 
138 aa  118  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.35343  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1002  RNA polymerase-binding protein DksA  52.46 
 
 
138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1243  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.82 
 
 
142 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.28 
 
 
138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2595  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 
134 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0704814 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0635  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.24 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  0.248385 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00144  DNA-binding transcriptional regulator of rRNA transcription, DnaK suppressor protein  47.06 
 
 
151 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3457  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.06 
 
 
151 aa  118  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0154  RNA polymerase-binding transcription factor  47.06 
 
 
151 aa  118  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0031107  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3514  RNA polymerase-binding transcription factor  47.06 
 
 
151 aa  118  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000935377  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0148  RNA polymerase-binding transcription factor  47.06 
 
 
151 aa  118  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000273463  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3529  transcriptional regulator, TraR/DksA family  54.62 
 
 
139 aa  118  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100266 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0136  RNA polymerase-binding transcription factor  47.06 
 
 
151 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000300013  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00143  hypothetical protein  47.06 
 
 
151 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000224196  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0156  RNA polymerase-binding transcription factor  47.06 
 
 
151 aa  118  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000187582  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0149  RNA polymerase-binding transcription factor  47.06 
 
 
151 aa  118  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0218  RNA polymerase-binding transcription factor  46.32 
 
 
151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.236664  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0203  RNA polymerase-binding transcription factor  46.32 
 
 
151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0202  RNA polymerase-binding transcription factor  46.32 
 
 
151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.210967  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0220  RNA polymerase-binding transcription factor  46.32 
 
 
151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000337551  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0214  RNA polymerase-binding transcription factor  46.32 
 
 
151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.748319  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0780  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.32 
 
 
147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00166659  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2671  transcriptional regulator, TraR/DksA family  54.1 
 
 
137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0417031  normal  0.389784 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1164  RNA polymerase-binding transcription factor  47.06 
 
 
151 aa  116  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00894629  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2440  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.38 
 
 
133 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  52.1 
 
 
136 aa  115  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0685  RNA polymerase-binding transcription factor  45.59 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0013378  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3468  RNA polymerase-binding transcription factor  44.85 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0312993  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1181  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.83 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3338  RNA polymerase-binding transcription factor  44.85 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000258197  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2681  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.06 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.133444  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1465  dnaK suppressor protein  46.83 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0724  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.33 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3687  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.42 
 
 
142 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220582  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6338  RNA polymerase-binding protein DksA  49.61 
 
 
134 aa  114  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 
150 aa  114  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>