More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2558 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2558  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  295  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  73.94 
 
 		 158 aa  221  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  79.23 
 
 		 138 aa  216  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1132  TraR/DksA family transcriptional regulator  73.91 
 
 		 138 aa  215  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.807192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  77.69 
 
 		 138 aa  214  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1036  dnaK suppressor protein  76.92 
 
 		 138 aa  212  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.35343  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5556  TraR/DksA family transcriptional regulator  73.53 
 
 		 139 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.398445  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5516  DnaK suppressor protein  74.24 
 
 		 133 aa  210  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3260  transcriptional regulator, TraR/DksA family  73.53 
 
 		 139 aa  210  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3036  RNA polymerase-binding protein DksA  73.53 
 
 		 139 aa  210  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897126 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3227  transcriptional regulator, TraR/DksA family  72.79 
 
 		 139 aa  210  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  76.15 
 
 		 146 aa  209  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1002  RNA polymerase-binding protein DksA  76.15 
 
 		 138 aa  209  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  72.06 
 
 		 139 aa  208  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  72.06 
 
 		 139 aa  208  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2176  transcriptional regulator, TraR/DksA family  74.81 
 
 		 139 aa  208  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.0134623 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0895  TraR/DksA family transcriptional regulator  73.53 
 
 		 158 aa  208  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1499  TraR/DksA family transcriptional regulator  71.01 
 
 		 138 aa  207  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0747562 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3792  TraR/DksA family transcriptional regulator  74.24 
 
 		 140 aa  207  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0620628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3529  transcriptional regulator, TraR/DksA family  73.85 
 
 		 139 aa  207  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100266 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  74.05 
 
 		 139 aa  207  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1346  TraR/DksA family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 138 aa  207  6e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1679  transcriptional regulators, TraR/DksA family  73.48 
 
 		 138 aa  206  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1527  TraR/DksA family transcriptional regulator  73.85 
 
 		 139 aa  205  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143324  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1950  TraR/DksA family transcriptional regulator  71.85 
 
 		 142 aa  204  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1884  putative DnaK suppressor protein  71.22 
 
 		 157 aa  204  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.261909 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  72.73 
 
 		 142 aa  204  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  71.97 
 
 		 136 aa  204  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2681  TraR/DksA family transcriptional regulator  69.12 
 
 		 159 aa  197  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.133444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0635  TraR/DksA family transcriptional regulator  69.34 
 
 		 155 aa  193  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2847  TraR/DksA family transcriptional regulator  65.22 
 
 		 138 aa  192  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0799762  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0724  TraR/DksA family transcriptional regulator  67.91 
 
 		 153 aa  189  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3687  TraR/DksA family transcriptional regulator  70.8 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2671  transcriptional regulator, TraR/DksA family  65.44 
 
 		 137 aa  185  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0417031  normal  0.389784 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3101  TraR/DksA family transcriptional regulator  64.66 
 
 		 152 aa  183  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0547  TraR/DksA family transcriptional regulator  73.13 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0758  TraR/DksA family transcriptional regulator  63.77 
 
 		 138 aa  181  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2654  DnaK suppressor protein  64.18 
 
 		 158 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.562233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1312  TraR/DksA family transcriptional regulator  64.18 
 
 		 158 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1192  TraR/DksA family transcriptional regulator  64.18 
 
 		 158 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal  0.628477 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0509  transcriptional regulator, TraR/DksA family  58.7 
 
 		 138 aa  172  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0571  transcriptional regulator, TraR/DksA family  62.79 
 
 		 134 aa  170  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2297  transcriptional regulator, TraR/DksA family  61.07 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0340464 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4557  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 257 aa  143  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0906  transcriptional regulator, TraR/DksA family  55.47 
 
 		 207 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2993  transcriptional regulator, TraR/DksA family  55.37 
 
 		 223 aa  140  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0046  putative DNAK suppressor protein  55.65 
 
 		 139 aa  139  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0808  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1064  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 450 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3438  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 429 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3683  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 281 aa  138  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1457  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.35 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.969843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3835  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.827568 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00359  DnaK supressor  50.39 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131287  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1731  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.82 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3387  putative dnaK suppressor protein  53.12 
 
 		 126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0276  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 313 aa  134  5e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0307  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 313 aa  133  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0162  hypothetical protein  52 
 
 		 228 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2014  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.92 
 
 		 162 aa  132  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2734  transcriptional regulator, TraR/DksA family  49.61 
 
 		 405 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.152492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4379  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.03 
 
 		 139 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0344  transcriptional regulator, TraR/DksA family  54.03 
 
 		 139 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0126  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 229 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2999  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 138 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.141456 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6440  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 138 aa  130  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2476  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 138 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3137  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 138 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3107  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 138 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3090  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 138 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1232  TraR/DksA family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.182051 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3428  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 278 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.478863 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0071  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.42 
 
 		 139 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3295  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3381  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50.81 
 
 		 223 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3704  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50.81 
 
 		 223 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0203  RNA polymerase-binding protein DksA  50.81 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3431  RNA polymerase-binding protein DksA  50.81 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3255  DnaK suppressor protein  50.81 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.290883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0387  DnaK suppressor protein  50.81 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2172  DnaK suppressor protein  50.81 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297381  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0166  DnaK suppressor protein  50.81 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.534243  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2917  RNA polymerase-binding protein DksA  50.81 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.123295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0192  RNA polymerase-binding protein DksA  50.81 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.426032  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3085  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.81 
 
 		 138 aa  124  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1598  TraR/DksA family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 149 aa  123  8.000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1032  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.8 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.955703  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1243  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.42 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1465  dnaK suppressor protein  46.92 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0517  DnaK suppressor protein  45.6 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1181  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.92 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42640  RNA polymerase binding protein DksA  43.18 
 
 		 145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.105027  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3060  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0497831  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.6 
 
 		 150 aa  117  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5439  suppressor protein DksA  41.73 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2533  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0895997  normal  0.563175 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0995  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3372  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.911345  normal  0.0274052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62490  suppressor protein DksA  41.73 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0072  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000740961  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>