More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2176 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2176  transcriptional regulator, TraR/DksA family  100 
 
 		 139 aa  281  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.0134623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  97.84 
 
 		 139 aa  277  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  91.37 
 
 		 146 aa  261  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1527  TraR/DksA family transcriptional regulator  92.09 
 
 		 139 aa  260  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143324  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  83.45 
 
 		 138 aa  236  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1036  dnaK suppressor protein  83.45 
 
 		 138 aa  235  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.35343  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  83.45 
 
 		 138 aa  233  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1002  RNA polymerase-binding protein DksA  82.73 
 
 		 138 aa  231  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3792  TraR/DksA family transcriptional regulator  81.2 
 
 		 140 aa  221  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0620628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5516  DnaK suppressor protein  79.7 
 
 		 133 aa  221  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1346  TraR/DksA family transcriptional regulator  78.95 
 
 		 138 aa  220  6e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1679  transcriptional regulators, TraR/DksA family  79.7 
 
 		 138 aa  219  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  79.7 
 
 		 142 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1499  TraR/DksA family transcriptional regulator  79.7 
 
 		 138 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0747562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  78.95 
 
 		 136 aa  217  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  75.54 
 
 		 158 aa  214  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3529  transcriptional regulator, TraR/DksA family  77.69 
 
 		 139 aa  210  5.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100266 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2558  TraR/DksA family transcriptional regulator  74.81 
 
 		 146 aa  208  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5556  TraR/DksA family transcriptional regulator  76.34 
 
 		 139 aa  208  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.398445  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1132  TraR/DksA family transcriptional regulator  75 
 
 		 138 aa  207  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.807192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  71.94 
 
 		 139 aa  205  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  71.94 
 
 		 139 aa  205  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3227  transcriptional regulator, TraR/DksA family  74.81 
 
 		 139 aa  204  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3036  RNA polymerase-binding protein DksA  74.05 
 
 		 139 aa  201  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3260  transcriptional regulator, TraR/DksA family  74.05 
 
 		 139 aa  201  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1950  TraR/DksA family transcriptional regulator  65.22 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0895  TraR/DksA family transcriptional regulator  66.41 
 
 		 158 aa  183  7e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1884  putative DnaK suppressor protein  67.94 
 
 		 157 aa  183  8e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.261909 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0758  TraR/DksA family transcriptional regulator  67.94 
 
 		 138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2671  transcriptional regulator, TraR/DksA family  67.18 
 
 		 137 aa  181  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0417031  normal  0.389784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3687  TraR/DksA family transcriptional regulator  71.19 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0724  TraR/DksA family transcriptional regulator  65.91 
 
 		 153 aa  179  8.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2847  TraR/DksA family transcriptional regulator  65.89 
 
 		 138 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0799762  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2681  TraR/DksA family transcriptional regulator  64.12 
 
 		 159 aa  176  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.133444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0635  TraR/DksA family transcriptional regulator  65.65 
 
 		 155 aa  176  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3101  TraR/DksA family transcriptional regulator  63.36 
 
 		 152 aa  168  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0509  transcriptional regulator, TraR/DksA family  61.07 
 
 		 138 aa  167  4e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0571  transcriptional regulator, TraR/DksA family  63.49 
 
 		 134 aa  163  8e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0547  TraR/DksA family transcriptional regulator  64.41 
 
 		 140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2297  transcriptional regulator, TraR/DksA family  60 
 
 		 141 aa  161  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0340464 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2654  DnaK suppressor protein  62.71 
 
 		 158 aa  156  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.562233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1312  TraR/DksA family transcriptional regulator  62.71 
 
 		 158 aa  156  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1192  TraR/DksA family transcriptional regulator  61.86 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal  0.628477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0906  transcriptional regulator, TraR/DksA family  56.56 
 
 		 207 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4557  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.03 
 
 		 257 aa  139  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0808  TraR/DksA family transcriptional regulator  54.92 
 
 		 165 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2993  transcriptional regulator, TraR/DksA family  54.03 
 
 		 223 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3387  putative dnaK suppressor protein  54.1 
 
 		 126 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3835  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 		 162 aa  135  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.827568 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1457  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 164 aa  135  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.969843  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0046  putative DNAK suppressor protein  52.42 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3683  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 281 aa  135  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1064  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.42 
 
 		 450 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1731  transcriptional regulator, TraR/DksA family  54.1 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00359  DnaK supressor  51.59 
 
 		 162 aa  133  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131287  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0126  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 229 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0162  hypothetical protein  51.61 
 
 		 228 aa  131  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2014  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 162 aa  131  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4379  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 139 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0344  transcriptional regulator, TraR/DksA family  53.23 
 
 		 139 aa  130  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2999  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.141456 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3381  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50.81 
 
 		 223 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3107  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4804  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  hitchhiker  0.00624661 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6440  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2476  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3704  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50.81 
 
 		 223 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3137  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3090  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3295  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1232  TraR/DksA family transcriptional regulator  57.98 
 
 		 139 aa  127  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.182051 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0071  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3428  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.81 
 
 		 278 aa  127  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.478863 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1181  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 		 154 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1465  dnaK suppressor protein  50 
 
 		 154 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3438  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 429 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3085  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.81 
 
 		 138 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3431  RNA polymerase-binding protein DksA  50.81 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2172  DnaK suppressor protein  50.81 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297381  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3255  DnaK suppressor protein  50.81 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.290883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0387  DnaK suppressor protein  50.81 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0166  DnaK suppressor protein  50.81 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.534243  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0192  RNA polymerase-binding protein DksA  50.81 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.426032  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2917  RNA polymerase-binding protein DksA  50.81 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.123295  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0203  RNA polymerase-binding protein DksA  50.81 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2734  transcriptional regulator, TraR/DksA family  49.61 
 
 		 405 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.152492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0835  hypothetical protein  48 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111035 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1243  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2533  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 139 aa  124  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0895997  normal  0.563175 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.88 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4011  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.96 
 
 		 144 aa  123  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00055516  normal  0.87616 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1032  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.11 
 
 		 151 aa  122  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.955703  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0276  TraR/DksA family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 313 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2286  hypothetical protein  46.15 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2259  hypothetical protein  46.15 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0307  TraR/DksA family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 313 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0517  DnaK suppressor protein  44.62 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5439  suppressor protein DksA  48 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0741  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000053151 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62490  suppressor protein DksA  48 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>