289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00359 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00359  DnaK supressor  100 
 
 
162 aa  329  9e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131287  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2734  transcriptional regulator, TraR/DksA family  90 
 
 
405 aa  284  4e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.152492  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0307  TraR/DksA family transcriptional regulator  75.84 
 
 
313 aa  276  7e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0276  TraR/DksA family transcriptional regulator  84.87 
 
 
313 aa  275  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0509  transcriptional regulator, TraR/DksA family  54.89 
 
 
138 aa  146  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1884  putative DnaK suppressor protein  52.99 
 
 
157 aa  142  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.261909 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0895  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.75 
 
 
158 aa  141  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0571  transcriptional regulator, TraR/DksA family  56 
 
 
134 aa  140  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2681  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.75 
 
 
159 aa  138  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.133444  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2671  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.63 
 
 
137 aa  137  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0417031  normal  0.389784 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1950  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.47 
 
 
142 aa  138  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2558  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.39 
 
 
146 aa  137  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0547  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.46 
 
 
140 aa  136  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3687  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.89 
 
 
142 aa  136  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220582  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  53.17 
 
 
139 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1312  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.64 
 
 
158 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2654  DnaK suppressor protein  51.64 
 
 
158 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.562233  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  51.97 
 
 
136 aa  133  8e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2847  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.39 
 
 
138 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0799762  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2297  transcriptional regulator, TraR/DksA family  53.66 
 
 
141 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0340464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2176  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.59 
 
 
139 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.0134623 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1192  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.64 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal  0.628477 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1346  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.97 
 
 
138 aa  131  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5516  DnaK suppressor protein  52.76 
 
 
133 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.2 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1679  transcriptional regulators, TraR/DksA family  51.18 
 
 
138 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1132  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.8 
 
 
138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.807192  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  49.23 
 
 
138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1036  dnaK suppressor protein  47.69 
 
 
138 aa  128  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.35343  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3227  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.64 
 
 
139 aa  128  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3792  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.39 
 
 
140 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0620628  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.2 
 
 
142 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3036  RNA polymerase-binding protein DksA  51.64 
 
 
139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0897126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3260  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.64 
 
 
139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1499  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.39 
 
 
138 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0747562 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  49.6 
 
 
138 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1527  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.4 
 
 
139 aa  127  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143324  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  51.2 
 
 
146 aa  127  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3428  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.87 
 
 
278 aa  127  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.478863 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1002  RNA polymerase-binding protein DksA  47.69 
 
 
138 aa  127  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0758  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.38 
 
 
138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3438  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.39 
 
 
429 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5556  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.4 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.398445  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03545  putative DnaK suppressor protein  50 
 
 
152 aa  125  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000789924  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.06 
 
 
139 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.06 
 
 
139 aa  125  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3372  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.77 
 
 
145 aa  125  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.911345  normal  0.0274052 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3295  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.28 
 
 
155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013948  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.65 
 
 
150 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3387  putative dnaK suppressor protein  51.61 
 
 
126 aa  124  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1064  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.39 
 
 
450 aa  123  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3529  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.41 
 
 
139 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100266 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3704  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 
223 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3381  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 
223 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3060  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.44 
 
 
145 aa  122  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0497831  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0635  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.84 
 
 
155 aa  120  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0126  TraR/DksA family transcriptional regulator  49.6 
 
 
229 aa  120  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1457  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.64 
 
 
164 aa  120  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.969843  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0162  hypothetical protein  48.8 
 
 
228 aa  120  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1032  transcriptional regulator, TraR/DksA family  49.22 
 
 
151 aa  120  9e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.955703  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1023  DnaK suppressor protein  50 
 
 
136 aa  120  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0517  DnaK suppressor protein  47.01 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0906  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.39 
 
 
207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1731  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.26 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0072  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.99 
 
 
140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000740961  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3985  RNA polymerase-binding transcription factor  48.44 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000239354  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0724  TraR/DksA family transcriptional regulator  48 
 
 
153 aa  118  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3683  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.58 
 
 
281 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0046  putative DNAK suppressor protein  48.8 
 
 
139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2993  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.58 
 
 
223 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0808  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.39 
 
 
165 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3835  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.82 
 
 
162 aa  117  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.827568 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1243  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.51 
 
 
142 aa  117  9e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2014  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.53 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3170  RNA polymerase-binding, DksA  46.09 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000043315  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3255  DnaK suppressor protein  50.4 
 
 
138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.290883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0387  DnaK suppressor protein  50.4 
 
 
138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0584  RNA polymerase-binding dnaK suppressor protein DksA  48.72 
 
 
148 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0114  RNA polymerase-binding protein DksA  47.66 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000001721  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0203  RNA polymerase-binding protein DksA  50.4 
 
 
138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2917  RNA polymerase-binding protein DksA  50.4 
 
 
138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.123295  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0166  DnaK suppressor protein  50.4 
 
 
138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.534243  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0192  RNA polymerase-binding protein DksA  50.4 
 
 
138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.426032  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2172  DnaK suppressor protein  50.4 
 
 
138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297381  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3937  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.83 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000139541  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0276  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.43 
 
 
143 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4557  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.77 
 
 
257 aa  115  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3431  RNA polymerase-binding protein DksA  50.4 
 
 
138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00144  DNA-binding transcriptional regulator of rRNA transcription, DnaK suppressor protein  46.88 
 
 
151 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3457  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.88 
 
 
151 aa  115  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0156  RNA polymerase-binding transcription factor  46.88 
 
 
151 aa  115  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000187582  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0780  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.72 
 
 
147 aa  115  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00166659  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3899  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.88 
 
 
147 aa  115  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000283088  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3514  RNA polymerase-binding transcription factor  46.88 
 
 
151 aa  115  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000935377  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0149  RNA polymerase-binding transcription factor  46.88 
 
 
151 aa  115  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0154  RNA polymerase-binding transcription factor  46.88 
 
 
151 aa  115  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0031107  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0148  RNA polymerase-binding transcription factor  46.88 
 
 
151 aa  115  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000273463  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00143  hypothetical protein  46.88 
 
 
151 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000224196  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0136  RNA polymerase-binding transcription factor  46.88 
 
 
151 aa  115  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000300013  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1005  RNA polymerase-binding transcription factor  45.31 
 
 
182 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132792  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>