More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2860 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2860  transcriptional regulator, TraR/DksA family  100 
 
 		 106 aa  209  9e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0648  putative DnaK suppressor protein  48.57 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0152  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.66 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1632  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.727995  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0382  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1346  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50.98 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37100  DnaK suppressor protein  56.86 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2148  zinc finger, DksA/TraR C4-type  50 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.282814 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2300  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.330947  hitchhiker  0.00514573 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3710  transcriptional regulator, TraR/DksA family  58.33 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.324918  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2088  C4 zinc finger domain-containing protein  34.29 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000002511  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0537  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.458636  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1511  hypothetical protein  41.43 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2904  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000908818  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2925  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4135  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.564899  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3203  zinc finger, DksA/TraR C4-type  45.45 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3682  transcriptional regulator, TraR/DksA family  59.52 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.594064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3429  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  decreased coverage  0.00561367 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0568  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.64 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0100  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0120  dnaK suppressor protein, putative  29.58 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0934145  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0693  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.27 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1322  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.67 
 
 		 216 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0160  dnaK suppressor protein, putative  29.58 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.532233  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1527  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143324  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.89 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0138  putative dnaK suppressor protein  29.58 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0615  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1052  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.129097 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1823  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.73 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00591197 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2396  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.73 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0818179  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2176  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.92 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.0134623 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0603  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.71 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1267  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 258 aa  50.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  35.92 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2010  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  46.03 
 
 		 135 aa  50.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3752  putative suppressor protein DnaK  51.16 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4875  hypothetical protein  35.14 
 
 		 127 aa  50.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0604  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8326  transcriptional regulator, TraR/DksA family  56.1 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1263  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.66 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1158  hypothetical protein  52.38 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0025  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.795475  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1363  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40 
 
 		 205 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000285999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1727  dnaK suppressor, putative  40.3 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447582  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.48 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3491  putative DNA-binding protein  35.94 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0750942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0866  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 251 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5516  DnaK suppressor protein  34.65 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.65 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00672458  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0212  conserved hypothetical protein, DksA-like protein  39.13 
 
 		 118 aa  49.7  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4563  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.48 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.258431 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3578  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2447  hypothetical protein  41.3 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000244827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1395  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.56 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.268655  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1294  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.56 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25924  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2554  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.365789  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.18 
 
 		 228 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000204402  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2803  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.58 
 
 		 253 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6416  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.83 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0580522  hitchhiker  0.0061347 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2062  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.33 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000865725 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4002  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.62 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1324  TraR/DksA family transcriptional regulator  45 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820819  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.65 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.65 
 
 		 213 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0517  DnaK suppressor protein  41.38 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6415  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.74 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.143253  normal  0.0110238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  36.71 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3660  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0008  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.08 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0752856 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1346  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1309  TraR/DksA family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2675  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.73 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.242775  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0249  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.534414  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.55 
 
 		 210 aa  47.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.4009  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0535  DnaK suppressor protein  29.41 
 
 		 117 aa  47.8  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0284  dnaK suppressor protein  43.48 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000202655  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1063  DnaK suppressor protein  44.44 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00483953  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3792  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0620628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1465  dnaK suppressor protein  29.2 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0623  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 212 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0992  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 257 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000149375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1181  transcriptional regulator, TraR/DksA family  29.2 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0565  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.03 
 
 		 269 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2558  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1282  zinc finger DksA/TraR C4-type  37.84 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1083  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5018  DksA/TraR family DNA-binding protein  44.19 
 
 		 243 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497032  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1036  dnaK suppressor protein  33.66 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.35343  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4989  DNA binding protein, DksA/TraR family  46.51 
 
 		 243 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106572  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1499  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0747562 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1679  transcriptional regulators, TraR/DksA family  40.58 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0939  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0812  transcriptional regulator  50 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>