More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1419 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA2024  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  100 
 
 		 131 aa  258  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.812974  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1419  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  100 
 
 		 131 aa  258  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597542  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3077  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  100 
 
 		 131 aa  258  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3205  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  100 
 
 		 131 aa  258  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1334  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  100 
 
 		 131 aa  258  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2311  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  96.95 
 
 		 131 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1047  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  99.15 
 
 		 117 aa  229  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2314  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  99.05 
 
 		 105 aa  208  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3641  TraR/DksA family transcriptional regulator  61.24 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4116  TraR/DksA family transcriptional regulator  61.24 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4387  TraR/DksA family transcriptional regulator  62.02 
 
 		 256 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3299  TraR/DksA family transcriptional regulator  59.69 
 
 		 130 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4148  TraR/DksA family transcriptional regulator  59.69 
 
 		 130 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4218  TraR/DksA family transcriptional regulator  59.69 
 
 		 130 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.419171  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1799  TraR/DksA family transcriptional regulator  58.91 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.392784 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0025  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.795475  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1557  hypothetical protein  38.1 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2675  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.38 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.242775  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2010  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  36.8 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1158  hypothetical protein  47.13 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0100  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.88 
 
 		 120 aa  67  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4563  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.88 
 
 		 120 aa  67  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.258431 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1171  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0188  hypothetical protein  52.83 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22970  RNA polymerase-binding DksA like protein  35.77 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0693  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.78 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73020  DksA/TraR family C4-type zinc finger protein  36.59 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6338  RNA polymerase-binding protein DksA  37.4 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1346  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.22 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4537  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2595  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0704814 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1232  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.182051 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0249  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.534414  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4453  TraR/DksA family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 123 aa  52.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540844  normal  0.142377 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37100  DnaK suppressor protein  41.46 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2286  hypothetical protein  29.91 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0812  transcriptional regulator  47.89 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1346  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.36 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2088  C4 zinc finger domain-containing protein  35.48 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000002511  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2259  hypothetical protein  29.91 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2533  TraR/DksA family transcriptional regulator  46 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0895997  normal  0.563175 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  48.94 
 
 		 136 aa  50.8  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5516  DnaK suppressor protein  48.94 
 
 		 133 aa  50.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1511  hypothetical protein  36.15 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0615  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  49.12 
 
 		 213 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.94 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8326  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.56 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1499  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0747562 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3596  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.22 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2803  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.04 
 
 		 253 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0126  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 229 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0537  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 113 aa  50.4  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.458636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16480  DnaK suppressor protein  36.44 
 
 		 236 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266038  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1953  TraR/DksA family transcriptional regulator  44 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145281 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2440  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.51 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3710  transcriptional regulator, TraR/DksA family  57.45 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.324918  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1322  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.36 
 
 		 216 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3792  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0620628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3101  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1679  transcriptional regulators, TraR/DksA family  46.81 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1313  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0534  zinc finger DksA/TraR C4-type  23.97 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781364  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3054  zinc finger, DksA/TraR C4-type  37.36 
 
 		 283 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.06 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.65 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3895  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.78 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0249902  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  51.06 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.82 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.581103  normal  0.0182397 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3491  putative DNA-binding protein  36.27 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0750942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0565  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.3 
 
 		 269 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3496  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 243 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000227563  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0992  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 257 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000149375  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1632  TraR/DksA family transcriptional regulator  46 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.727995  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3203  zinc finger, DksA/TraR C4-type  34.67 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3429  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  decreased coverage  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3660  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 149 aa  48.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2062  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.94 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000865725 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2925  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 110 aa  48.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1527  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143324  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2297  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.08 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0340464 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4700  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 243 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000265525  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2176  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.94 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.0134623 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0276  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4693  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  39.62 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000772708 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2014  TraR/DksA family transcriptional regulator  46 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0939  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1884  putative DnaK suppressor protein  48.94 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.261909 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4557  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195272  hitchhiker  0.00000457182 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1598  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0535  DnaK suppressor protein  30 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5556  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.398445  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1126  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.68 
 
 		 231 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00340237  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>