More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_16480 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_16480  DnaK suppressor protein  100 
 
 
236 aa  454  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266038  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5737  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.94 
 
 
275 aa  148  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3054  zinc finger, DksA/TraR C4-type  53.44 
 
 
283 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22720  DnaK suppressor protein  48.1 
 
 
153 aa  134  8e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.432466  normal  0.0927989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1030  TraR/DksA family transcriptional regulator  56.56 
 
 
527 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00152227  hitchhiker  0.0090317 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3190  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.8 
 
 
159 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1603  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50 
 
 
150 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.455354  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1082  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.62 
 
 
150 aa  115  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.151397  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0910  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.19 
 
 
136 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1292  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.69 
 
 
157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359698  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1418  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.24 
 
 
133 aa  109  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0975581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4002  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.25 
 
 
155 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3203  zinc finger, DksA/TraR C4-type  41.88 
 
 
139 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3429  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.88 
 
 
139 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  decreased coverage  0.00561367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3895  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.53 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0249902  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2760  DnaK suppressor protein  43.68 
 
 
118 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.19847e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0284  dnaK suppressor protein  40.71 
 
 
118 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000202655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3278  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.29 
 
 
118 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000778936  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2148  zinc finger, DksA/TraR C4-type  36.43 
 
 
132 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.282814 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2300  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.43 
 
 
132 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.330947  hitchhiker  0.00514573 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.67 
 
 
118 aa  67  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4001  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.67 
 
 
118 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1736  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.70977 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2611  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.73 
 
 
120 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  49.21 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0238  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.98 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.62 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0008  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0752856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6338  RNA polymerase-binding protein DksA  45.33 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22970  RNA polymerase-binding DksA like protein  44.74 
 
 
134 aa  64.7  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0129  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.33 
 
 
118 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014175  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1181  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.28 
 
 
154 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1465  dnaK suppressor protein  36.28 
 
 
154 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73020  DksA/TraR family C4-type zinc finger protein  34.09 
 
 
134 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450272  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.44 
 
 
228 aa  62.8  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000204402  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1309  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.33 
 
 
120 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0534  zinc finger DksA/TraR C4-type  40 
 
 
119 aa  62.8  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781364  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1263  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.07 
 
 
176 aa  62.8  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2554  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.33 
 
 
120 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.365789  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1294  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.33 
 
 
120 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25924  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1395  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.33 
 
 
120 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.268655  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1184  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.84 
 
 
123 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000422996  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4537  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.67 
 
 
140 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44 
 
 
139 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  44 
 
 
146 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1953  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.33 
 
 
143 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145281 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1126  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.67 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00340237  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2176  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.67 
 
 
139 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.0134623 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0680  TraR/DksA family transcriptional regulator  60 
 
 
109 aa  60.1  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0997736  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0973  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.97 
 
 
121 aa  59.7  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492217  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2345  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.65 
 
 
132 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283018  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2440  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.98 
 
 
133 aa  59.3  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2595  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.33 
 
 
134 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0704814 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3529  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.33 
 
 
139 aa  59.3  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100266 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.67 
 
 
138 aa  58.5  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0196  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.19 
 
 
144 aa  58.5  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.67 
 
 
139 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.67 
 
 
139 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1427  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.09 
 
 
109 aa  58.5  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0733302  normal  0.617985 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3491  putative DNA-binding protein  34.48 
 
 
122 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0750942  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2692  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.36 
 
 
297 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0535  DnaK suppressor protein  36 
 
 
117 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  36 
 
 
118 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000533151  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1132  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.67 
 
 
138 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.807192  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1527  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.33 
 
 
139 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143324  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1754  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.14 
 
 
118 aa  57  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000650821  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2847  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.79 
 
 
138 aa  56.6  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0799762  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.65 
 
 
120 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00672458  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1598  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.84 
 
 
149 aa  56.6  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26803  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.67 
 
 
158 aa  57  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4387  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.46 
 
 
256 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2088  C4 zinc finger domain-containing protein  37.33 
 
 
119 aa  56.2  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000002511  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3227  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.78 
 
 
139 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5556  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.89 
 
 
139 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.398445  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1083  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.29 
 
 
120 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_002936  DET1373  dnaK suppressor protein, putative  33.63 
 
 
123 aa  55.8  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000567795  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3208  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.98 
 
 
218 aa  55.5  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000145805  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0007  hypothetical protein  35.58 
 
 
104 aa  55.8  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.807913  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2791  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.54 
 
 
144 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0162  hypothetical protein  33.33 
 
 
228 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2558  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.33 
 
 
146 aa  55.8  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2884  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.54 
 
 
144 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.17875  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1036  dnaK suppressor protein  40 
 
 
138 aa  55.5  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.35343  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.33 
 
 
138 aa  55.5  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1267  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.22 
 
 
258 aa  55.1  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120418  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1679  transcriptional regulators, TraR/DksA family  40 
 
 
138 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1351  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.58 
 
 
212 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1171  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.29 
 
 
116 aa  55.1  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0758  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.54 
 
 
138 aa  55.1  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3487  dnaK suppressor protein, putative  35 
 
 
134 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3262  dnaK suppressor protein, putative  35 
 
 
134 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  40 
 
 
136 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5516  DnaK suppressor protein  40 
 
 
133 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40 
 
 
142 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4135  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.18 
 
 
121 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.564899  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1154  DnaK suppressor protein-like protein  32.74 
 
 
122 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136974  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2671  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.36 
 
 
137 aa  53.9  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0417031  normal  0.389784 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2447  hypothetical protein  34.38 
 
 
141 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000244827  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0691  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.56 
 
 
139 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0872386  normal  0.218793 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0866  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.62 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>